snOPY snoRNA Orthological Gene Database
SpeciesBox typeTarget RNAOrganization
Keywords
Curation status  Locus View
  Species snoRNA name Box Target RNA Organization Locus
Caenorhabditis_elegans K07C10.2 C/D 26S rRNA Mono Mono:17:K07C10.2
Canis_familiaris SNORD58 C/D 28S rRNA Intronic ENSCAFG00000019044
Canis_familiaris SNORD58 C/D 28S rRNA Intronic ENSCAFG00000019044
Canis_familiaris SNORD58 C/D   Intronic ENSCAFG00000019044
Cavia_porcellus SNORD58 C/D   Poly Poly:19:SNORD58
Cavia_porcellus SNORD58 C/D   Poly Poly:19:SNORD58
Cavia_porcellus SNORD58 C/D   Poly Poly:19:SNORD58
Danio_rerio SNORD58 C/D 28S rRNA Intronic wu:fa28a02
Danio_rerio SNORD58 C/D 28S rRNA Intronic wu:fa28a02
Danio_rerio SNORD58 C/D 28S rRNA Intronic wu:fa28a02
Dasypus_novemcinctus SNORD58 C/D   Poly Poly:20:SNORD58
Dasypus_novemcinctus SNORD58 C/D   Poly Poly:20:SNORD58
Dasypus_novemcinctus SNORD58 C/D   Poly Poly:20:SNORD58
Drosophila_melanogaster snoRNA:Me28S-G3113a C/D 28S rRNA Intronic CG13900
Drosophila_melanogaster snoRNA:Me28S-G3113b C/D 28S rRNA Intronic CG13900
Echinops_telfairi SNORD58 C/D   Intronic DYM
Echinops_telfairi SNORD58 C/D   Intronic DYM
Echinops_telfairi SNORD58 C/D   Intronic DYM
Equus_caballus SNORD58 C/D   Intronic ENSECAG00000011547
Equus_caballus SNORD58 C/D   Intronic ENSECAG00000011547
Equus_caballus SNORD58 C/D   Intronic ENSECAG00000011547
Equus_caballus SNORD58 C/D   Mono Mono:17:SNORD58
Erinaceus_europaeus SNORD58 C/D   Intronic ENSEEUG00000004875
Erinaceus_europaeus SNORD58 C/D   Mono Mono:202:SNORD58
Erinaceus_europaeus SNORD58 C/D   Mono Mono:403:SNORD58
Felis_catus SNORD58 C/D   Intronic DYM
Felis_catus SNORD58 C/D   Intronic DYM
Gallus_gallus SNORD58 C/D   Intronic Q6EE61_CHICK
Gallus_gallus SNORD58 C/D   Intronic Q6EE61_CHICK
Gallus_gallus SNORD58 C/D   Intronic Q6EE61_CHICK
Gallus_gallus SNORD58 C/D   Intronic Q6EE61_CHICK
Gallus_gallus SNORD58 C/D   Intronic Q6EE61_CHICK
Gasterosteus_aculeatus SNORD58 C/D   Intronic RPL17
Homo_sapiens SNORD58A (U58A) C/D 28S rRNA Intronic RPL17
Homo_sapiens SNORD58B (U58B) C/D 28S rRNA Intronic RPL17
Homo_sapiens SNORD58C (U58C) C/D 28S rRNA Intronic RPL17
Loxodonta_africana SNORD58 C/D   Intronic ENSLAFG00000005569
Loxodonta_africana SNORD58 C/D   Mono Mono:34:SNORD58
Macaca_mulatta SNORD58 C/D   Intronic ENSMMUG00000018837
Macaca_mulatta SNORD58 C/D   Intronic ENSMMUG00000018837
Macaca_mulatta SNORD58 C/D   Intronic ENSMMUG00000018837
Microcebus_murinus SNORD58 C/D   Intronic ENSMICG00000017102
Microcebus_murinus SNORD58 C/D   Mono Mono:247:SNORD58
Microcebus_murinus SNORD58 C/D   Poly Poly:22:SNORD58
Microcebus_murinus SNORD58 C/D   Poly Poly:22:SNORD58
Monodelphis_domestica SNORD58 C/D   Intronic ENSMODG00000003534
Monodelphis_domestica SNORD58 C/D   Intronic ENSMODG00000003534
Monodelphis_domestica SNORD58 C/D   Intronic ENSMODG00000003534
Monodelphis_domestica SNORD58 C/D   Intronic ENSMODG00000003534
Monodelphis_domestica SNORD58 C/D   Mono Mono:7:SNORD58
Mus_musculus SNORD58 C/D 28S rRNA Mono Mono:173:SNORD58
Mus_musculus SNORD58 C/D 28S rRNA Intronic Rpl17
Mus_musculus SNORD58 C/D 28S rRNA Intronic Rpl17
Mus_musculus SNORD58 C/D 28S rRNA Intronic Rpl17
Ornithorhynchus_anatinus SNORD58 C/D   Intronic ENSOANG00000002910
Ornithorhynchus_anatinus SNORD58 C/D   Intronic ENSOANG00000002910
Ornithorhynchus_anatinus SNORD58 C/D   Intronic ENSOANG00000002910
Ornithorhynchus_anatinus SNORD58 C/D   Intronic ENSOANG00000002910
Ornithorhynchus_anatinus SNORD58 C/D   Intronic ENSOANG00000002910
Oryctolagus_cuniculus SNORD58 C/D   Intronic ENSOCUG00000000746
Oryctolagus_cuniculus SNORD58 C/D   Poly Poly:28:SNORD58
Oryctolagus_cuniculus SNORD58 C/D   Poly Poly:28:SNORD58
Oryzias_latipes SNORD58 C/D   Intronic RPL17
Oryzias_latipes SNORD58 C/D   Intronic RPL17
Otolemur_garnettii SNORD58 C/D   Intronic ENSOGAG00000004559
Otolemur_garnettii SNORD58 C/D   Mono Mono:278:SNORD58
Otolemur_garnettii SNORD58 C/D   Mono Mono:347:SNORD58
Otolemur_garnettii SNORD58 C/D   Mono Mono:348:SNORD58
Otolemur_garnettii SNORD58 C/D   Mono Mono:469:SNORD58
Pan_troglodytes SNORD58 C/D   Intronic
Pan_troglodytes SNORD58 C/D   Poly
Pan_troglodytes SNORD58 C/D   Poly
Pan_troglodytes SNORD58 C/D   Intronic
Pongo_pygmaeus SNORD58 C/D   Intronic
Pongo_pygmaeus SNORD58 C/D   Mono
Pongo_pygmaeus SNORD58 C/D   Mono
Rattus_norvegicus SNORD58 C/D   Intronic
Rattus_norvegicus SNORD58 C/D   Intronic
Rattus_norvegicus SNORD58 C/D   Intronic
Sorex_araneus SNORD58 C/D   Intronic
Sorex_araneus SNORD58 C/D   Mono
Spermophilus_tridecemlineatus SNORD58 C/D   Intronic
Spermophilus_tridecemlineatus SNORD58 C/D   Intronic
Spermophilus_tridecemlineatus SNORD58 C/D   Mono
Tetraodon_nigroviridis SNORD58 C/D 28S rRNA Intronic
Tetraodon_nigroviridis SNORD58 C/D 28S rRNA Intronic
Tetraodon_nigroviridis SNORD58 C/D 28S rRNA Intronic
Tupaia_belangeri SNORD58 C/D   Intronic
Tupaia_belangeri SNORD58 C/D   Mono
Tupaia_belangeri SNORD58 C/D   Mono
Tupaia_belangeri SNORD58 C/D   Poly
Tupaia_belangeri SNORD58 C/D   Poly
Xenopus_tropicalis SNORD58 C/D   Intronic
Xenopus_tropicalis SNORD58 C/D   Intronic
Xenopus_tropicalis SNORD58 C/D   Intronic
Xenopus_tropicalis SNORD58 C/D   Intronic
Copyright © 2008 RI Laboratory, Frontier Science Research Center, University of Miyazaki, All rights reserved