snOPY snoRNA Orthological Gene Database

Family: snoZ188

CLUSTAL W (1.83) multiple sequence alignment A_tauschii300190 GCATGCCGATGATGAT-----GCAAAAGCATTGGTGAATTCTGGATGAATA-CGCTTAC- A_tauschii300191 GCATGCCGATGATGAT-----GCAAAAGCATCGGTGAATTCTGGATGAATG-CGCTTAC- A_tauschii300221 GCGTGCCGATGATGAT-----GCAAAAGCATCGGTGAATTCTGGATGAGTG-TGCCCGCG A_tauschii300603 GCGTGCCGATGATGAT-----GCAAAAGCTTCGGTGAATTCTGGATGAATG-CGCTTGCG A_tauschii300604 GCGTGCCGATGATGAT-----GCAAAAGCATCGGTGAATTCTGGATGAACG-CGCTTGCG O_sativa300016 GCGTGCCGATGATGATTAAAAGAGCTAACAATGGTGAATTC--GATGAATG-TGCTTGCG O_sativa300030 GCGTGCTAGTGATGATTAAAGAAGTTAAAAATGGTGAATCCTGGATTAATG-TGCTCGCG O_sativa300033 TCGTGCTGGTGATGATTA-AAGAGCTAGCAATGGTGAATTC--GATGAATT-TGTTCGCG O_sativa300035 TCGTGCTGGTGATGATTA-AAGAGCTAGCAATGGTGAATTC--GATGAATT-TGTTCGCG O_sativa300037 GCGTGCCAGTGATGATTACAGAGATAAAAAATGGTGAATTCTGGATGAGCGGTGCTCGCG T_aestivum300119 GCGTGCCGATGATGAT-----GCAAAAGCATCGGTGAATTCTGGATGAGTG-TGCCCGCG T_aestivum300122 GCGTGCCGATGATGAT-----GCAAAAGCTTCGGTGAATTCTGGATGAATG-CGCTTGCG T_aestivum300123 GCGTGCCGATGATGAT-----GCAAAAGCATCGGTGAATTCTGGATGAACG-CGCTTGCG T_aestivum300124 GCGTGCCGATGATGAT-----GCAAAAGCATCGGTGAATTCTGGATGAATG-CGCTTGCG T_aestivum300375 GCGTGCCGATGATGAT-----GCAAAAGCATCGGTGAATTCTGGATGAGTG-TGCCCGCG * *** ******* * ******* * *** * * * A_tauschii300190 CACGACGAG----GTGTGCA----ACTCTGGTGATATCCAT---AGCGCAATAC-TCTGA A_tauschii300191 CACGACGAG----GTGTGCG----GCTCTGAAGATATCCAC---TGCGCAATAC-TCTGA A_tauschii300221 CACGACCAG-----TGTGCG----GCTCTGGTGATATCCAC---AGCGTAATAC-TCTGA A_tauschii300603 CACCATCAGTTGTGTGCGCA----GCTCTGGTGATATCCAC---TGCGTAATAC-TCTGA A_tauschii300604 CACCACCAG---TGCGCAGA----GCTCTCGTGATATCCAC---TGCGTAATTA-TCTGA O_sativa300016 TGCCGCTGG--GTGCGCAGCTATGGTCAGGGTTTCACTTAT---CGCACGA--------- O_sativa300030 TGCCGCTGTGTGCGCGCGCG------GCTGGAGATTTTTTTTTTCTCTCTGTTCTTCTGT O_sativa300033 TGCTGCTGG----GTGCGCA----GCAGTGGTGATATGCATCCTTACGCAGTTCATATGA O_sativa300035 TGCCGCTGG----GTGCGCA----GCAGTGGTGATATGCATTCTTACGCAGTTCATCTGA O_sativa300037 TGTCGCTGCGTGCGCGCGCGCTCGGCCGTGGTGATATCCCT---TGCTCAGTTCATCTGA T_aestivum300119 GACGACCAG-----TGTGCG----GCTCTGGTGATATCCGC---AGCGTAATAC-TCTGA T_aestivum300122 CACCATCAGTTGTGTGCGCA----GCTCTGGTGATATCCAC---TGCGTAATAC-TCTGA T_aestivum300123 CACCACCAG---TGCGCAGA----GCTCTCGTGATATCCAC---TGCGTAATTA-TCTGA T_aestivum300124 CACCACAAG----GTGTGCG----GCTTTGGTGATATCCAC---TGCGCTATAC-TCTGA T_aestivum300375 CACGACCAG-----TGTGCG----GCTCTGGTGATATCCAC---AGCGTAATAC-TCTGA * * A_tauschii300190 GGCTTGC-- A_tauschii300191 GGCACGC-- A_tauschii300221 GGCACCC-- A_tauschii300603 GGCACAC-- A_tauschii300604 GGCACAC-- O_sativa300016 --------- O_sativa300030 GAGTTCTTC O_sativa300033 GGCACGC-- O_sativa300035 GGCACGC-- O_sativa300037 GGCACGC-- T_aestivum300119 GGCACGC-- T_aestivum300122 GGCACAC-- T_aestivum300123 GGCACAC-- T_aestivum300124 GGCACGC-- T_aestivum300375 GGCACCC--

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