snOPY snoRNA Orthological Gene Database

Family: snoZ103

CLUSTAL W (1.83) multiple sequence alignment A_tauschii300361 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- A_tauschii300272 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- A_tauschii300273 ATGGAAGTGATTATCCTTTCCCCAAATGATCGACATTGATTAA-ACTGTG-CG------- A_tauschii300359 ATGGAATTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGAGTATGATTAT-ACTATG-CGCA--TGT A_tauschii300360 ATGGGTGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-ACTATG-CG------- A_tauschii300442 ATGGATGTGAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACTATGATTAT-ACTATG-CG------- A_tauschii300362 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACCATGATTAT-ACTGTG-CG------- A_tauschii300392 ATGGATGTGAGGTCCCTTTCCC-AAATTATCGACTACGATTAT-ACTGTG-TG------- A_tauschii300429 ATGGAATTGAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCAACTATGATTAT-ACTATG-CG------- A_tauschii300447 ATGGATGTGAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- A_tauschii300449 ATGGATGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-ACTGGGGCG------- A_tauschii300446 ATGGATGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATTGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- A_tauschii300445 ATGGATGTGAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACTATGATTAT-ACTATG-CG------- A_tauschii300444 ATGGATGTGAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACTATGATTAT-ACTATG-CG------- A_tauschii300502 GTGGACATGATGATCCTTTCCCCAGATGATCGACAATGAACAT-GCTGAG-CG------- A_tauschii300569 ATGGAAGTGAGGATCCTTTTTCAAGCTGATCGACTATAATTAT-ATTGTG-CT------- A_tauschii300171 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- A_tauschii300570 -----ATTGAGATTGCGTTCTCCAGCTGATCGACTATAATTAT-ACTGTG-CT------- A_tauschii300582 TTGGATGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-ACTATG-CG------- A_tauschii300585 GAGGATATGATGATCCTTTCCCTGGATGATCGGCAATGAACAT-GCTGAG-CG------- A_tauschii300443 ATGGATGTGAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACTATGATTAT-ACTATG-CG------- A_tauschii300501 GAGGATATGATGATCCTTTCCCCAGATGATCGACAATGAACAT-GCTGAG-CG------- A_tauschii300043 ATGGATGTGAGGACCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-ACTATG-CG------- A_tauschii300044 ATGGACATGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-ACTATG-CG------- A_tauschii300081 GAGGATATGATGATCCTTTCCCCAGATGATTGGCAATGAACAT-GCTGAG-CG------- A_tauschii300140 --------ATGGCCCCTTTCCCCAAATTATCGACT-TGATTAT-A----G-TG------- A_tauschii300172 ATTGGAGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATTGACTGTGATTAT-AATGTG-CG------- A_tauschii300216 ATGGAAGCGAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CT------- A_tauschii300245 AAGGATGTGAGGATACTTTCCCCAAATTACCGACTATGATTATTACTATG-AG------- A_tauschii300252 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- A_tauschii300253 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACCATGTTTAT-ACTGTG-CG------- A_tauschii300254 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAGCTTATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- A_tauschii300271 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- A_tauschii300448 ATGGATGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATTGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- O_sativa300194 ATGGAAGTGACGATCCTTTCCCCAGATGATCGACTATGATTAT-ACAGTG-CG-----CA O_sativa300090 GAGGATATGATGATCCTTTCCCCAGATGATCGACAATGAACAT-ACCGTG-CG------- O_sativa300091 GAGAATATGATGATCCTTTCCCCAGATGATCGACAATGAACAT-ACTGAG-CG------- O_sativa300095 GAGGATATGACGATCCTTTCCCCAGATGATCGACGATGAGCAT-AATGTG-CG------- O_sativa300192 ATGGAAGTGAAGATCCTTTCCCCAGATGATCGACTACGATTAT-ACTGTG-CG------- O_sativa300193 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- O_sativa300094 GAGAATATGATGATCCTTTCCCCAGATGATCGACAATGAACAT-ACTGAG-CG------- O_sativa300195 TTTGAAGTGATGATCCTTTCCCCAAATTATCGACTATGATTGT-ACTGTG-CGATTTTTG P_patens300015 GAGGAGGTGAGGATACTTTCCCCAAATGATCGATTCTGATT-----CCAT-CT------- P_patens300020 GAGGAGGTGAGGATACTTTCCCCAT-TGATCGACTCTGATT-----CCAT-CT------- P_patens300031 AAGGATATGAGGATACTCTCCCCAAATGATCGAATCTGATT-----CGAA-CT------- P_patens300048 GGGGATATGAGGATACTTTCCCCAAATGATCGACACTGATT-----CGAG-CT------- P_patens300051 GGGGATATGAGGATACTTTCCCCAAATGATCGACACTGATT-----CGAG-CT------- P_patens300056 GGGGATATGAGGATACTTTCCCCAAATGATCGACACTGATT-----CGAG-CT------- P_patens300057 AGAGATATGAGGATACTTTCCTCAAATGATCGACACTGATT-----CGAG-CT------- P_patens300070 GAGGAGTTGAGGACACTTTCCCCAAATGATCGACTCTGATT-----CCAT-CT------- P_patens300073 GAGGAGTTGAGGACACTTTCCCCAAATGATCGACTCTGATT-----CCAT-CT------- T_aestivum301326 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACAATGATTGT-ACTGTG-CG------- T_aestivum301474 ATGGAAGTGATTATCCTTTCCCCAAATGATCGACATTGATTAA-ACTGTG-CG------- T_aestivum301475 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- T_aestivum301476 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- T_aestivum301512 ATGGAAGTGAGGATTCTTTCCCCAGCTGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- T_aestivum301220 ATGGATGTGAGGTCCCTTTCCC-AAATTATCGACTACGATTAT-ACTGTG-TG------- T_aestivum301228 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAGCTTATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- T_aestivum301234 ATGGAATTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGAGTATGATTAT-ACTATG-CGCA--TGT T_aestivum301235 ATGGGTGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-ACTATG-CG------- T_aestivum301236 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- T_aestivum301237 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACCATGATTAT-ACTGTG-CG------- T_aestivum301288 ATGGACATGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-ACTATG-CG------- T_aestivum301289 ATGGATGTGAGGACCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-ACTATG-CG------- T_aestivum301314 CTGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACAGTGATTAT-ACTGCG-CG------- T_aestivum301315 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- T_aestivum301316 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- T_aestivum301513 ATGGAAGTGAAGATCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-AATGTG-CG------- T_aestivum301336 ATGGAAGTAAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- T_aestivum301345 ATGGAAGTAAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- T_aestivum301389 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- T_aestivum301390 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATGGACTATGATTAT-ACTGCG-CG------- T_aestivum301391 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- T_aestivum301392 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACATTGATTAT-ACTGTG-CG------- T_aestivum301446 AAGGATGTGAGGATACTTTCCCCAAATTACCGACTATGATTATTACTATG-AG------- T_aestivum301455 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAGCTTATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- T_aestivum301456 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACCATGTTTAT-ACTGTG-CG------- T_aestivum301457 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- T_aestivum301467 ATGGAAGCGAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CT------- T_dicoccoides300007 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACAATGATTAT-ACTGTG-CG------- T_dicoccoides300008 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACTATGATTAT-ACTGTG-CG------- T_dicoccoides300946 GTGGAATTGAGGTTCCTTTCCCCAAATGATCGAGTATGATTAT-ACTATA-TGTC--CTC T_dicoccoides300037 ATGGAAGTGAGGATCCTTTCCCCAGCTGATCGACAATGATTGT-ACTGTG-CG------- T_dicoccoides300009 ATGGGTATGAGGATCCTTTCCCCAAATGATCGACTTTGATTAT-ACTATG-CG------- * * * * A_tauschii300361 CAACTGTAATC--CCATCAG--GATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300272 CACATGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300273 CAACTGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300359 GTAATCCTATTCACTTGATTTTGTTTCTT-------------------- A_tauschii300360 CAAATGTAATCCC--ATC--AGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300442 CACATGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300362 CAAATGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300392 CCACTGTAATCTTTATT-AGAGGATTCCAAGCCAGAAGTAT-GATCCAT A_tauschii300429 CAAATGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300447 CACATGTAATCC-TCATTTGAGGGTTCCAAGCCAGAAATCT-AATCCAT A_tauschii300449 CACATGTAATCC-TCGTTAGAGGGTTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300446 CACATGTAATCC-TCGTTAGAGGGTTCCAAGCCAGAAATCT-AATCCAT A_tauschii300445 CACATGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300444 CACATGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300502 ---CTATAATTTCTCTTAGGAGA-AACCAAGCCAG-GACTCTGATCTGC A_tauschii300569 CAAATGTAATCCTTTATCGGAGGATTCCAAGCCAGAAATTTTGATCCAT A_tauschii300171 CAAATGAAATTCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300570 CAAATGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GGTCGAC A_tauschii300582 CAAATGTAATCCC--ATCTCAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300585 ---CTATTATTTCTCTTCAGAGA-AACCAAGCCAG-TATTCTGATCCTC A_tauschii300443 CACATGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300501 ---CTATTATTTCTCTTCAGAGA-AACCAAGCCAG-TACTCTGATCCTC A_tauschii300043 CATCTGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAGTCT-GATCCAT A_tauschii300044 CATATGTAATCCTT-ATCAGAGGGTTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300081 ---CTATTATTTCTCTTCAGAGA-AACCAAGCCAG-TATTCTGATCCTC A_tauschii300140 CAACTGTAATCCTTTAT-CGAGGATTCCAAGCCAGAAGTCT-GATCCAT A_tauschii300172 CACATGAAATCC-TTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAAATCTGATCCAT A_tauschii300216 CAAATGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300245 CAAATGTAATCCC--ATC--AGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300252 CAACTGTAATC--CCACCGG--GATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300253 CAACTATAATC--TCACCGG--GATTCCTAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300254 CAAATGTAATCCTTTTTCAGAGGATTCCAAGCCAG-AAATCTGATCCAT A_tauschii300271 CAACTGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT A_tauschii300448 CACATGTAATCC-TCGTTAGAGGGTTCCAAGCCAGAAATCT-AATCCAT O_sativa300194 CAAGTGACCCCTCTTCGAGGAGGATTCCAAGCCAG-AATTCTGATCCAT O_sativa300090 ---ATTGT-TTTCTCTTAGGAGATAATCAAGCCAG-AAATCTGATCCTC O_sativa300091 ---CTATTATTTCTCTTTTGAGA-A-CCAAGCCAG-TATTCTGATTCTC O_sativa300095 ---CTATT-GTTCTCTTAAGAGATAATCAAGCCAG-AACTATGATTCTC O_sativa300192 CAAATGTAATCCCTTTTCGGAGGATTC-AAGCCAG-AAATCTGATCCAT O_sativa300193 CAAATGTAATCCCTCTTCAGAGGATTC-AAGCCAG-AAATCTGATCCAT O_sativa300094 ---CTATTATTTCTCCTTTGAGA-A-CCAAGCCAG-TATTCTGATTCTC O_sativa300195 CAAGCTCTTCTCTTCGGAGAAGGCTTCTAAGCCAGTAGTTCTGATCAAA P_patens300015 ---GTGCTAATCAGCTCGAAAGA--GCCAAGCCAGGAAAACTGATCCTT P_patens300020 ---GTGCTAATCAGGTCAAAAGA--GCCAAGCCAGGAAAACTGATCCTT P_patens300031 ---AAGCGTTTATGCTCGAAAGA--GCCAAGCCAG-AAATCTGATCCTG P_patens300048 ---GTGCGTTCATGCTCCAAGGA--GCCAAGCCAG-AAATCTGATCCCT P_patens300051 ---GTGCGTTCATGCTCCAAGGA--GCCAAGCCAG-AAATCTGATCCCT P_patens300056 ---GTGCGTTCATGCTCCAAGGA--GCCAAGCCAG-AAATCTGATCCCT P_patens300057 ---GTGCGTTCATGCTCCAAGGA--GCCAAGCCTG-AAATTTGATCCGT P_patens300070 ---GTGCTAACAAGCTCGAAAGA--GCCAAGCCAGGAAAACTGATCCTT P_patens300073 ---GTGCTAACAAGCTCGAAAGA--GCCAAGCCAGGAAAACTGATCCTT T_aestivum301326 CAAATGTTATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301474 CAACTGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301475 CAACTGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301476 CACATGTAATCCTT-ATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301512 CAAATGAAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301220 CCACTGTAATCTTTATT-AGAGGATTCCAAGCCAGAAGTAT-GATCCAT T_aestivum301228 CAAATGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAG-AAATCTGATCCAT T_aestivum301234 GTAATCCTATTCACTTGATTTTGTTTCTT-------------------- T_aestivum301235 CAAATGTAATCCC--ATC--AGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301236 CAACTGTAATC--CCATCAG--GATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301237 CAAATGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301288 CATATGTAATCCTT-ATCAGAGGGTTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301289 CATCTGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAGTCT-GATCCAT T_aestivum301314 TAACTGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301315 CAACTGCAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301316 CAAATGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301513 CACATCAAATCC-TTATCAGAGGGTTCCAAGCCAGAAA-TCTGATCCAT T_aestivum301336 CAAATGTGATCCTTTATCATAGGATTC-AAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301345 CAAATGTGATCCTTTATCATAGGATTC-AAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301389 CAAATGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301390 CAACTGCAATCCTTTATCAGAGGATTCGAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301391 CAACTGTAATCCTTTACCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301392 CAACTGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301446 CAAATGTAATCCC--ATC--AGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301455 CAAATGTAATCCTTTTTCAGAGGATTCCAAGCCAG-AAATCTGATCCAT T_aestivum301456 CAACTATAATC--TCACCGG--GATTCCTAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301457 CAACTGTAATC--CCACCGG--GATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_aestivum301467 CAAATGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_dicoccoides300007 CAAATGTAATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_dicoccoides300008 CAACTGTAATC--CCATCGG--GATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_dicoccoides300946 ATGTGTTTCTTCGGTACAGTAGATTTCTCGATCTCATGCTTTGATCTAC T_dicoccoides300037 CAAATGTTATCCTTTATCAGAGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT T_dicoccoides300009 CAAATGTAATCCC--ATC--AGGATTCCAAGCCAGAAATCT-GATCCAT

Copyright © 2008 Medical Biology, Faculty of Medicine, University of Miyazaki, All rights reserved