snOPY snoRNA Orthological Gene Database

Family: U54

CLUSTAL W (1.83) multiple sequence alignment A_tauschii300312 ----------AGCTCAGTGATTAG-AGCCAATTACAT---TGGCAATATATGCTATACTG A_tauschii300153 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTAGATTCATGGCGATATACGCTATTCTG A_tauschii300152 ----------TTCTCAATGATTA--AGCCGTGTAGATTCATGGCGATATACGCTATTCTG A_tauschii300151 ----------AGCTCAGTGATTTT-AGCCAAATAAACTT-TGGTCATATACGCTATTCTG A_tauschii300150 ----------TGCTCAGTGATTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATGCTG A_tauschii300149 ----------AGCTCAGTGATTAG-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG A_tauschii300316 ----------ATCTCAGTGATTTC-AGTCCAATA--CTT-TGGTCATATATGCTATTCTG A_tauschii300315 ----------TGCTCAGTGACTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTACGCTG A_tauschii300314 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTAGATTCATGGTGATATACGCTATTCTG A_tauschii300313 ----------GGGTTTGTGAT-A--TGCCATTTAGATTCATGGCGATATACACTATTCTG G_gorilla300971 TGGCGATGAGGAGGTACCTATTGT-GTTGAGTAACGGTGATAATTTTATACGCTATTCTG O_sativa300052 ----------TGCTCAATGATTA--ACCCATGC---ACCATGGCAATACACGCTATTCTG O_sativa300053 ----------GGCTCAATGATTGT-TGCCAATCACATT--TGGTCATATATGCTATTCTG O_sativa300146 ----------AGCTCAGTGATTTC-AACCAGTCACAT---TGGTTTTATACGCTATTCTG O_sativa300147 ----------AGCTCAGTGATTGT-AGTCACTTTTGT---TGGTAATATACGCTATGCTG O_sativa300148 ----------TGCTCAAGGATTATAAGCCATGTTATGCCATCACAATATACGCTATTCTG O_sativa300227 ----------AGCTCAATG---------CAATCAAGT---TGGTTTTATACGCTATTCTG O_sativa300041 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTTAATCCATGGCAATATGCGCTATTCTG O_sativa300042 ----------GGCTCAGTGATTGT-TGCCAATCAGATT--TGGTCATATACGCTATTCTG O_sativa300043 ----------AGCTCTGTGATTTC-AACCAATCACAT---TGGTTTTATACGCTATTCTG O_sativa300044 ----------AGCTCAGTGATTGC-AGCCGTTTTCAT---TGGCAATATACGCTATGCTG T_aestivum300052 ----------ATCTCAGTGATTTC-AGTCCAATA--CTT-TGGTCATATATGCTATTCTG T_aestivum300053 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTAGATTCATGGTGATATGCGCTATTCTG T_aestivum300054 ----------TGCTCAGTGACTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTACGCTG T_aestivum300378 ----------AGCTCAGTGATTAG-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG T_aestivum300379 ----------AGCTCAGTGATTTT-AGCCAAATAAACTT-TGGTCATATACGCTATTCTG T_aestivum300380 ----------TGCTCAGTGATTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATGCTG T_aestivum301197 ----------TTCTCAATGATTA--AGCCGTGTAGATTCATGGCGATATACGCTATTCTG T_aestivum301196 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTAGATTCATGGCGATATACGCTATTCTG T_aestivum301195 ----------AGCTCAGTGATTTT-AGCCAAATAAACTT-TGGTCATATACGCTATTCTG T_aestivum301194 ----------TGCTCAGTGATTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG T_aestivum301193 ----------AGCTCAGTGATTAG-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG T_aestivum300382 ----------TTCTCAATGATTA--AGCCGTGTAGATTCATGGCGATATACGCTATTCTG T_aestivum300381 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTAGATTCATGGCGATATACGCTATTCTG T_aestivum301238 ----------GGGTTTGTGAT-A--TGCCATTTAGATTCATGGCGATATACACTATTCTG T_aestivum300051 ----------AGCTCAGTGATTAG-AGCCAATTACAT---TGGCATTATATGCTATACTG T_dicoccoides300950 ----------ATCTCAGT-ATTCG-AGTCCAATA--CTT-CGGTCATATATGCTATTCTG T_dicoccoides300021 ----------TGCTCAGTGACTAT-GGCAAATTACAT---TGGCAATATGCGCTACGCTG T_dicoccoides300020 ----------AGCTCAGTGATTAG-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG ** *** *** A_tauschii300312 A-TCATACTTTGATGAAAAGTT-TA--TATGAGCT-- A_tauschii300153 ATTCTT--TAGGATGTCATCAAATGT-TATGAGAGCA A_tauschii300152 AGTCTT--TAAGATGTCATCAAACTT-TATGAGAGAA A_tauschii300151 A---ATATGTTGTTGTAAAATAAATT-TATGAGAGCT A_tauschii300150 A-CCTTGTTTTGATGAAAAGTTGGA--TATGAGAGCT A_tauschii300149 A-CCATATTTTGATGAAAAGTTGTA--TATGAGAGCT A_tauschii300316 A---ATATGTTG---TAAAATAAACT-TATGAGAGCT A_tauschii300315 G-CCTTGTTTTGATGCAAGGTTGGA--CATGAGAGCT A_tauschii300314 AGTCTT--TACGATGTCATCACATGT-TATGAGAGCA A_tauschii300313 AGTCTT--TAGGATGTCGTCAAATGT-TATGAAATCA G_gorilla300971 AGCCAGCG----------------------------- O_sativa300052 AATCATATTAAGATGCCAT-AAACAT-TATGAGAGCA O_sativa300053 ATTTCTA-TTGGTGAAAACGAA--TT-TATGAGAGCT O_sativa300146 A--TTGGAGCTGTTGAAAAATAATACTTATGAGAGCT O_sativa300147 A-CCATAGTTTGATGATGAATGAGAA-TATGAGAGCT O_sativa300148 AATCATATTAAGATGTCAT-AAACAT-TATGAGAGCA O_sativa300227 A-TTGGAGTGTTTTTTTATTAGGACT-TATGAGAGCT O_sativa300041 AATCATATTAAGATGTCAT-AAACAT-TATGAGAGCA O_sativa300042 ATTTCTA-TTGGTGAAAAAGAAAATT-TATGAGAGCT O_sativa300043 A--TTGGAGCTGTTGAAAAATAAGACTTATGAGAGCT O_sativa300044 A-CT---GTTTGATGACAAATAAGAA-TATGAGAGCT T_aestivum300052 A---ATATGTTG---TAAAATAAACT-TATGAGAGCT T_aestivum300053 AGTCTT--TACGATGTCATCACATGT-TATGAGAGCA T_aestivum300054 G-CCTTGTTTTGATGCAAGGTTGGA--CATGAGAGCT T_aestivum300378 A-CCATATTTTGATGAAAAGTTGTA--TATGAGAGCT T_aestivum300379 A---ATATGTTGTTGTAAAATAAATT-TATGAGAGCT T_aestivum300380 A-CCTTGTTTTGATGAAAAGTTGGA--TATGAGAGCT T_aestivum301197 AGTCTT--TAAGATGTCATCAAACTT-TATGAGAGCA T_aestivum301196 AATCTT--TAGGATGTCATCAAATGT-TATGAGAGCA T_aestivum301195 A---ATATGTTGTTGTAAAATAAATT-TATGAGAGCT T_aestivum301194 A-CCATATTTTGATGAAAAGTTGTA--TATGAGAGCT T_aestivum301193 A-CCATATTTTGATGAAAAGTTGTA--TATGAGAGCT T_aestivum300382 AGTCTT--TAAGATGTCATCAAACTT-TATGAGAGAA T_aestivum300381 ATTCTT--TAGGATGTCATCAAATGT-TATGAGAGCA T_aestivum301238 AGTCTT--TAGGATGTCGTCAAATGT-TATGAAATCA T_aestivum300051 A-TCATATTTTGATGAAAAGTT-TA--TATGAGCT-- T_dicoccoides300950 A---ATATGTTG---TAAAATAAACT-TCTGAGAGCT T_dicoccoides300021 G-CCTTGTTTTGATGAAAAGTTGGA--CATGAGAGCT T_dicoccoides300020 A-TCATATTTTGATGAAAAGTT-TA--TATGAGAGCT

Copyright © 2008 Medical Biology, Faculty of Medicine, University of Miyazaki, All rights reserved