snOPY snoRNA Orthological Gene Database

Family: SNORD99

CLUSTAL 2.0.10 multiple sequence alignment C_familiaris300074 ACTGGT--CCAGGATGAAACCTAATCTGAGTGGACAT-CTATGGATGATA C_porcellus300394 ACTGGT--CCAGGATGAAACCTAATCTGAGTGGACAT-CTGTGGATGAGA D_rerio300046 ACTGAT--CAAGGATGATAGTATATTG--ATGGTGAC-TGCTGGATGAAA E_telfairi300230 GCTGTATTCAAGGATGAAACCTATTCTGAGTGGACAT-ATATGGATGATA E_telfairi300489 CCTGGT--CAAGGATGAAACCTAATCTGAGTGGACAT-CTCCGGATGATA E_telfairi300625 GTAGGTCACCTACTTTAAAGCAAAC--AAGTG-ACAT-CTATGGATGATA E_caballus300004 ACTGGT--CCAGGATGAAACCTAATCTGAATGGACAT-CTATGGATGATA E_europaeus300053 ACTGGT--CAAGGATGAAAACCTATCTCTGTGGACAT-CATTGGATGATA E_europaeus300340 ATTGGT--CAAGGATGAAAACCTATCTCTGTGGACAT-CATTGGGTGATA G_aculeatus300019 -GTGAT--CTATGATGATTCAATACTAAAATTGTGAC-TGCTGGATGAAG H_sapiens300651 ACTGGT--CCAGGATGAAACCTAATTTGAGTGGACAT-CCATGGATGAGA L_africana300173 ACTGGT--CCAGGATGAAACCTAATCTGAGTGGACAT-CTGTGGATGATA M_mulatta300214 ACTGGT--CCAGGATGAAAC--AATCTGAGTGGACAT-CCATGGATGAGA M_domestica300062 ACTGGT--CAGTGATGAATCTCTTATCTGGTGGACATGCTTTGGATGACA M_musculus300613 ACTGGT--CCATGATGAAACCCATTATCAGTGGACAT-CTATGGATGAGA O_anatinus303291 GCTGGT--TAAGGATGACACTCAAT---GGTGGACAT-GTATGGATGACA O_cuniculus300205 ACTGGT--CCAGGATGAATCCTAATCTGAGTGGACAT-CTTTGGATGAGA O_latipes300040 TCTGAT--CCATGATGACTTCCAAACAC-ATGTGGAC-TGTTGGATGAAG P_troglodytes300511 ACTGGT--CCAGGATGAAACCTAATTTGAGTGGACAT-CCATGGATGAGC P_pygmaeus300607 ACTGGT--CCAGGATGAAACCTAATTTGAGTGGACAT-CCATGGATGAGA S_araneus301081 GCTGGT--TCAGGATGAAACCTTATCTGAGTGGACAT-CTATGGATGATA S_tridecemlineatus300294 ACTGGT--CCAGGATGAAACCTAATCTGAATGGACAT-CTATGGATGAGA T_nigroviridis300174 TCTGAT--CTGTGATGATGCCTAAATG--ATGAGGAC-TGCTGGATGAAG T_belangeri300185 AGTGGT--CCGGGATGAAGCCTAGTCTGAGTGGACAT-CT--GGATGAGA X_tropicalis300028 GCTGCG--CGGGGATGAATCTCTTATCTGG-AGACGG---TTGGATGAAT X_tropicalis300029 TCTGTG--TGGGGATGAATCCCTTATCTGG-AGACGG---TTGGATGAAT X_tropicalis300030 GCTGTG--CGGGGATGAATCTCTTATCTGG-AGACGG---TTGGATGAAT * * * ** *** C_familiaris300074 AATGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTCTTCAG C_porcellus300394 AATGCGGATATGGGACTGAGACCAGTGCTTAGG D_rerio300046 CTTGCGGATATGGGACTGAGATCAGTT------ E_telfairi300230 AATACGGATATGGGACTGAGACCAGCTGCTCGA E_telfairi300489 AATGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTGCTTGA E_telfairi300625 AATGAGGATTTGGGACTGAGACCAGCTGCTCCT E_caballus300004 GATGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTTTTAGG E_europaeus300053 GATGCGGATATGGGACTGAGACCAGTTCTAGGG E_europaeus300340 AATGTGGATATGGGACTGAGACCAGTTCTTGGG G_aculeatus300019 CTTGCGGATATGGGACTGAGATCAGCATTTCAA H_sapiens300651 AATGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTCCTAGG L_africana300173 AATGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTCTTAGA M_mulatta300214 AATGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTCCTAGG M_domestica300062 CTTGCGGATATGGGGCTGAGACCAGTCACAAGC M_musculus300613 AATGCGGATATGGGACTGAGACCAGTTCTTAGG O_anatinus303291 CTTGCGGATATGGGACTGAGACCAGCT------ O_cuniculus300205 AATGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTCTTGGG O_latipes300040 CATGCGGATATGGGACTGAGATCAGACTTTAGC P_troglodytes300511 AATGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTCCTAGG P_pygmaeus300607 AATGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTCCTAGG S_araneus301081 AATGCGGATATGGGACTGAGACCTGCTGTTTGA S_tridecemlineatus300294 AATGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTCTTAGG T_nigroviridis300174 CTTGCGGATATGGGACTGAGATCAGCC------ T_belangeri300185 GAAGCGGATATGGGGTTGAGACTAGCTCGGGGA X_tropicalis300028 CTTGCGGATATGGGACTGAGCGCAGCCGTTGCC X_tropicalis300029 CTTGCGGATATGGGACTGAGCACAGGCGCCTCC X_tropicalis300030 CTTGCGGATATGGGACTGAGCGCAGCCTTTGCC **** **** **** *

Copyright © 2008 RI Laboratory, Frontier Science Research Center, University of Miyazaki, All rights reserved