snOPY snoRNA Orthological Gene Database

Family: SNORD45

CLUSTAL W (1.83) multiple sequence alignment C_familiaris300050 GGTCGATGATGA--GCTGGCATGTATT--CTGAATCTGAA--GTTGAT-- C_familiaris300279 GGTCAGCAATGT--GATGGCCTGTGTTAGCTGAATCCAAA--GTTGATG- C_familiaris300388 AGTCAGTGATGT--GATGCTATGT-TTACCTAAACCTAAA--GTTGATG- C_familiaris300394 GGTCAATGATGT--GATGGCATGTATTAGCTGAATCCAAA--GTTGATG- C_familiaris300395 GGTCAGTGATGT--GTTGGCATGTATTACCTGACTAAATG--GCTGATGT C_familiaris300396 GGTCGATGATGA--GCTGGCATGTATT--CTGAATCTGCA--GTTGGT-- C_porcellus300340 GGTCAGTGATGA--GATGGCATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- C_porcellus300459 GGTCAGTGATGA--GATGGCATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- C_porcellus300949 GGTCAATGATGT--ATTGGCATGTATTATCTGA-TTTACT--GCTGATGT C_porcellus300950 GGTCAGTGATGT--CATGGCATGTATTAGCTGAATGTGCA--GTTGATG- E_telfairi300182 GGTCAATGATGA--GTTGGCATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- E_telfairi300521 GGTCAATGATGA--GTTGGCATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- E_telfairi300699 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTATCTGAATTTTCT--GCTGATGT E_telfairi300700 GGTCTATGATGA--GTTGGCATGTATT--CTGAAACTAAA--CTTGAT-- E_caballus300187 GGTCGATGATGA--GCCGGCATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- E_caballus300318 GGTCAGTGATGT--GATGGCATGTATTAACTGAATCCAAA--GTTGATG- E_caballus300319 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTATCTGAATTTATG--GCTGATGT E_europaeus300043 GGTCAATGATGT--TTTGGCATGTATTATCTGATATTAAA--GCTGATGT E_europaeus300177 GGCTAGTGATGA--GATGGCATATATT--CTGAATCTAAA--GTTAAT-- E_europaeus300244 GGTCAAGGATGC---TCTGCATGTATTATCTGACATGAAA--GCTGATGT E_europaeus300400 GGTCAATGATGA--CACGGCATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- E_europaeus300710 GGTCAATGATGT--TTTGGCATGTATTATCTGACGTTAAA--GCTGATGT E_europaeus300711 GGTCTGTGATGTTTTATGGCATGTATTAGCTGAATCCAGA--GTTGATG- E_europaeus300712 GGTCGATGATGT--TTTGGCATGTATTATCTGAC-TTACA--GCTGATGT F_catus300126 GGTCAATGATGA--GCTGGCATGTATT--CTGAATCCGAA--GTTGAT-- F_catus300196 AGTCAGCGATGT--GACGGCACGTATTAGCCGAATCCAGA--GTTGATG- F_catus300309 GGTCGGTGATGT--GGTGGCATGTGTTAGTTGAATTCACA--GTTGAGG- G_gallus300104 GGTCTGTGATGAGTTTTGGCATGTATTATCTGA--GCATA--AGTG-TGA G_gallus300105 GGTCAGTGATGATTGGTGGCATGTATTATCTGAT-GTAAA--GGTGATGT G_gorilla300848 GGTCAATGATGT--CGTGGCATGTATTAGCTGAATCCAAA--GTTGATG- G_gorilla300849 GGTCAATGATGT--AATGGCATGTATTAGCTGAATCCAGA--GTTGATA- G_gorilla300417 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTATCTGAATCTATT--GCTGATGT G_gorilla300418 GGTCAGTGATGT--AATGGCATGTATTAGCTGAATCTAAA--GTTGATG- G_gorilla300419 GGTCAATGATGA--GTTGGCATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- G_gorilla300420 GGTCAAAGT-GT--GTTGACATGTATTACCTGAATTTATT--GCTGATGT G_gorilla300491 GGTCAATGATGT--AATGGCATGTATTACCTGAATCCAAA--GTTGATG- G_gorilla300789 GGTCAATGATGA--GCTGACATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- H_sapiens300667 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTATCTGAATCTATT--GCTGATGT H_sapiens300666 GGTCAATGATGA--GTTGGCATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- H_sapiens300668 GGTCAATGATGT--AATGGCATGTATTAGCTGAATCTAAA--GTTGATG- L_africana300065 GGTCAGTGATGT--GTTGGCATGTATTATCTGAATTTACT--GCTGATGT L_africana300432 --TCGATGGTGA--GATGACATGTATT--CTGAACCTCAA--GATTAA-- L_africana300433 GGTCAATGATGT--GATGGCATGTATTAGCTGAATCCGAA--GTTGATGT M_mulatta300468 GGTCAAGGT-AT--GTTGACATGTATTACTTGAATTTATT--GCTGATGT M_mulatta300515 GGTCAATGATGT--AATGGCATGTATTAACTGAACCCAAA--GTTGATA- M_mulatta300582 GGTCAATGATGA--GCTGGCATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- M_mulatta300583 GGTCAATGATGT--TTTGGCATGTATTATCTGAATCTATT--GCTGATGT M_mulatta300584 GGTCAATGATGT--AATGGCATGTATTAGCTGAATCCAAA--GTTGATG- M_mulatta300173 GGTCAATGATGA--GCTGACATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- M_mulatta300438 GATTGATGATGA--GCTGGCATATATT--CTGAATCTTAA--GTTTAT-- M_murinus300049 GGTCGATGATGA--GCTGGCATGTATT--CTGAATCTGAA--GTTGAT-- M_murinus300311 GGTCAGTGATGT--AATGGCATGTATTAGCTGAATGGAAA--GTTGATG- M_murinus300400 GGTCGATGATGA--GTTGGCATGGATT--CTGAATCTAAAAAGTTGAT-- M_murinus300412 GGCCAATGATGT--AATGATATGTATTAGCCGAATCCACA--GTTGATGT M_murinus300531 GGTCAATGATGT--TTTGGCATGTATTACCTGAATTTATT--GCTGATGT M_murinus300153 GGTCAATGATGT--GCTGGCATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAC-- M_domestica300072 GGTCAATGATGT--CTTGGCATGTATTAGCTGAGC-CGCC--GCTGATGC M_domestica300073 GGTCAGTGATGT--GATGGCATGTATTACCTGAATCCAAA--GTTGATGG M_musculus300910 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTATCTGAATTC-----GCTGATGT M_musculus300542 GGTCAATGATGA--GCTGGCATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- M_musculus300909 GGTCAGTGATGT--CATGGCATGTATTAGCTGAATGCTAA--CCTGATG- M_lucifugus300041 GGTCTATGATGA--GCCGGCATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- M_lucifugus300562 GGTCAATGATGT--GATGGCATGTATTAGCTGAATTCAAA--GTTGATG- M_lucifugus300638 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTATCTGAATTTACA--GCTGATGT O_anatinus302262 GGTCAGTGATG--TGTTGGCATGTATTATCTGAATCTAAA--GTTGATGC O_anatinus302263 GGTCAATGATG---GTTGGCATGTATTATCTGAATCTAAA--GTTGATGT O_anatinus302264 GGTCAATGATGT--TTTGGCATGTATTACCTGAATCTAAA--GTTGATGC O_anatinus302265 TGTCAATGATGA--GTTGGCATGTAT--TCTGAATCTAAA--GTTGATGT O_cuniculus300386 GGTAAGTGATGG--AATGGCATGTATTAGCTGAAT-CACC--ATTGATA- O_cuniculus300486 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTACCTGAATTTAAT--GCTGATGT O_cuniculus300175 GGTCAATGATGA--GCTGGCATGTATT--CTGAATTTAAA--GTTGAT-- O_garnettii300122 GGTCAATGATGA--GCCGGCATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- O_garnettii300369 GGTCAAGGTTGT--GTTGACAGATATTACCTGAATTTATT--GCTGATGT O_garnettii300638 GGTCAATGATGT--TTTGGCATGTATTAGCTGACTGCACA--GTTGATGT P_troglodytes300052 GGTCAATGATGA--GCTGACATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- P_troglodytes300315 GGTCAAAGT-GT--GTTGACATGTATTACCTGAATTTATT--GCTGATGT P_troglodytes300361 GGTCAATGATGT--CGTGGCATGTATCAGCTGAATCCAAA--GTTGATG- P_troglodytes300364 GGTCAATGATGT--AATGGCATGTATTAGCTGAATCCCAA--GT-GATG- P_troglodytes300373 GGTCAATGATGT--AATGGCATGTATTAGCTGAATCCAGA--GTTGATA- P_troglodytes300526 GGTCAATGATGA--GTTGGCATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- P_troglodytes300527 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTATCTGAATCTATT--GCTGATGT P_troglodytes300528 GGTCAATGATGT--AATGGCATGTATTAGCTGAATCTAAA--GTTGATG- P_pygmaeus300008 GGTCAATGATAT--CGTGGCATGTATTAGCTGAGTCCAAA--GTTGATG- P_pygmaeus300261 GGTCAAGGT-GT--GTTGACATGTATTACCTGAATTTATT--GATGATGT P_pygmaeus300342 GGTCAATGATGT--AATGGCATGTATTAGCTGAATCCAAA--GTTGATG- P_pygmaeus300528 GGTCAATGATGA--GCTGACATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- P_pygmaeus300591 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTATCTGAATCTATT--GATGATGT P_pygmaeus300592 GGTCAATGATGA--GTTGGCATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- P_pygmaeus300590 GGTCAATGATGT--AATGGCATGTATTAGCTGAATCCAAA--GTTGATG- R_norvegicus300143 GGTCAATGATGA--GCTGGCATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- R_norvegicus300592 GGTCAGTGACGT--CACGGCATGTATTAGCTGAACGCTAA--CCTGAGG- R_norvegicus300974 GGTCAGTGATGT--CATGGCATGTATTAGCTGAATGCTAA--CTTGATG- R_norvegicus300975 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTATCTGAATTT-----GCTGATGT S_araneus300915 GGTCAATGATGT--TTTGGCATGTATTATCTGATTTTGAA--GCTGATGT S_araneus300916 GGTCAATGATGTT-GAAGGCATGTATTAACTGAATCAAAA--GTTGATG- S_araneus300249 GGTCAATGATGA--GCCGGCATGTATT--CTGAGTCTAAC--GTTGAT-- S_araneus300494 TATATATCATGT--GTTGCCATTTATTACCTGAAACT-----TCTGATGA S_tridecemlineatus300326 GGTGAAGGAGGC---TC-----GTATTACCTGAATTTACT--GCTTATGT S_tridecemlineatus300080 GGTCAATGATGA--GCTGGCATGTATT--CTGAATCAAAA--GTTGAT-- T_belangeri300325 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTACCTGAATTTACT--CCTGATGT T_belangeri300326 GGTCAGTGATGT--GATGGCATGTATTAGCTGAATCCAAA--GTTGATG- T_belangeri300046 GGTCGATGATGA--GTTGGCATGTATT--CTGAATTTAAA--GTTGAT-- T_belangeri300072 AGTTGCTGACAA--GTTGGTATGTATT--CAGAATCTAAA--GTTGAT-- * * C_familiaris300050 -GATTA-CTCCTTCAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- C_familiaris300279 ------------TAAATTCTAAAATTACACGAAAACCTT-- C_familiaris300388 ------------TAAATTCTAAAATTACAG--AGGCCTT-- C_familiaris300394 ------------TCAATTGTAAGATTACACTGAGACCTT-- C_familiaris300395 GT-GATAACACA--AGCTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- C_familiaris300396 -GATTA-CTCCTTCAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- C_porcellus300340 -TATTA-CTGCTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- C_porcellus300459 -TATTA-CTGCTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- C_porcellus300949 GT-AATAACACTTTAGCTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- C_porcellus300950 ------------TGAATTCTGAAATTACCCTGAGACCTT-- E_telfairi300182 -TATTG-CTTCTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- E_telfairi300521 -TATTG-CTTCTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- E_telfairi300699 GTGAATAACACTT-AGCTCTAG--TTACGCTGAGACCTT-- E_telfairi300700 -TATTA-CTATTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTA-- E_caballus300187 -TATTA-CTACTTCAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- E_caballus300318 ------------TAAGTTCTAAAATTACACTGAGACCTT-- E_caballus300319 GT-AATAACACTTTAGCTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- E_europaeus300043 GT-A-TACTACTTTAGGAAAAAAGAAAAG---AAAATCTAA E_europaeus300177 -TAATT--TACTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTT-- E_europaeus300244 G--GAGAACACT--GGCTCTGGGATTACACTGAGACCTT-- E_europaeus300400 -TAATT--TACTTCAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTA-- E_europaeus300710 GT-ATAG-CACTTTAGCTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- E_europaeus300711 ------------TAAATTCTGAAATAACACTGAGACCTT-- E_europaeus300712 GT-ATAA-CACTTTAGCTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- F_catus300126 -TATTA-CTACGTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- F_catus300196 ------------TAAATTCTAAAATGACAG--TGACCTT-- F_catus300309 ------------TCAATTCTAAAATTACACTAAACCCTT-- G_gallus300104 -AGATTATCAGTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTT-- G_gallus300105 -TTATCATCACATTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCCA-- G_gorilla300848 ------------TGAGTTCCAAAATTATACTGAGACTTT-- G_gorilla300849 ------------TGAGTTCTAAAATTACACTGAAGCTGG-- G_gorilla300417 GT-AATAACACTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTT-- G_gorilla300418 ------------TGAGTTCTAAAATTACACTGAGACCTT-- G_gorilla300419 -TATTA-CTACTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- G_gorilla300420 AT-AATAACACTTTAACTCTAAAATAATA--TAGCTTTTGG G_gorilla300491 ------------TGAATTCTAAAATTACACCAAGGCCTT-- G_gorilla300789 -TATTA-GTACTTTAGTTCTAGAATTACT--GAGACATG-- H_sapiens300667 GT-AATAACACTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCT--- H_sapiens300666 -TATTA-CTACTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- H_sapiens300668 ------------TGAGTTCTAAAATTACACTGAGACCTT-- L_africana300065 GT-AATGACACTT-AGCTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- L_africana300432 -TA--T--TATTTTGGCTCTAGAATTACTCTGAGA------ L_africana300433 ---GTATCATCAAG--CTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- M_mulatta300468 AT-AATAACACTTTAACTCTAGAATAATA--TAGCTTTTGG M_mulatta300515 ------------TGAGTTCTAAAATTACACTGAGGCTGG-- M_mulatta300582 -TATTA-ATACTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- M_mulatta300583 GT-AATAACACTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTT-- M_mulatta300584 -----------TGAGTTTCTAAAATTACACTGAGACCTT-- M_mulatta300173 -TATTA-GTACTTTAGTTCTAGAATTACT--GAGACATG-- M_mulatta300438 -TATTA-CTACTGTAGCTCTAAAATTACTGTGATACCTA-- M_murinus300049 -TATTA-CTACTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- M_murinus300311 ------------TGAGTTCCAATGTTACACTGAGACCTT-- M_murinus300400 -TATTA-CTACTTTAGCTCTAGAATCACTCTGAGACCTG-- M_murinus300412 ---GAATTTTTAAAGACATTTAAATTATGCCGAGATCTT-- M_murinus300531 GT-AATAACACTTAAGCTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- M_murinus300153 -TATTA-GTACTTTAGCTCTAGAATTACT--GAGACCTG-- M_domestica300072 TT-CCTACCCGGAAAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCGT-- M_domestica300073 -ATATC-ACACTTTAGCTCTAGAATTACACTGAGACCTT-- M_musculus300910 GT-CATAACACTTTAGCTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- M_musculus300542 -TATAAACCACTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- M_musculus300909 ------------CAAGTTACAA-ATTACACTGAGACCTT-- M_lucifugus300041 -TACGA-CTACTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- M_lucifugus300562 ------------CAAATTCT-AAATTACACTGAGACCTT-- M_lucifugus300638 GT-AAT--AACACTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACTTT-- O_anatinus302262 -TTACCATTCCTATAGCTCTAGGATTAC--TGAGACCTT-- O_anatinus302263 -TTATCACCACATTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTT-- O_anatinus302264 -TAATTACCTCTTCAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCCT-- O_anatinus302265 -TTATCACCAT-TTAGCTCTAGAATTACTCTGAGGCTTG-- O_cuniculus300386 ------------TGAATTATAAAATTACACTGAGACCTT-- O_cuniculus300486 GT-AATAACACTTTAGCTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- O_cuniculus300175 -TATTA-CTACTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- O_garnettii300122 -TATTA-CTACTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- O_garnettii300369 AT-AATAACACTTCAGCTCTCAAATTATGCTTGGAACTT-- O_garnettii300638 -------------GAGCTCTAATGTGACACTGAGACCTT-- P_troglodytes300052 -TATTA-GTACTTTAGTTCTAGAATTACT--GAGACATG-- P_troglodytes300315 AT-AATAACACTTTAACTCTAAAATAATA--TAGCTTTTGG P_troglodytes300361 ------------TGAGTTCCAAAATTATACTGAGACTTT-- P_troglodytes300364 ------------TGAAT-CTAAATTTACACC-AGACCTT-- P_troglodytes300373 ------------TGAGTTCTAAAATTACACTGAAGCTGG-- P_troglodytes300526 -TATTA-CTACTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- P_troglodytes300527 GT-AATAACACTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTT-- P_troglodytes300528 ------------TGAGTTCTAAAATTACACTGAGACCTT-- P_pygmaeus300008 ------------TGAGTTCCAAAATTATACTGAGACTTT-- P_pygmaeus300261 AT-AATAACACTTTAACTCTAGAATAATA--TAGCTTTTGG P_pygmaeus300342 ------------TGAATTCTAAAATTACACCAAGACCTT-- P_pygmaeus300528 -TATTA-GTACTTTAGTTCTAGAATTACT--GAGACATG-- P_pygmaeus300591 GT-AATAACACTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTT-- P_pygmaeus300592 -T-TTA-CTACTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- P_pygmaeus300590 ------------TGAGTTCTAAAATTACACTGAGACCTT-- R_norvegicus300143 -TAATAACCACTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCCG-- R_norvegicus300592 ------------CCAGTTACAA-ATAGCAGTGAGACCTT-- R_norvegicus300974 ------------CAAGTTACAA-ATGGCACTGAGACCTG-- R_norvegicus300975 GT-CCTAACATTTGAGCTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- S_araneus300915 GT-AAAAATACTTAAGCTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- S_araneus300916 ------------CAAATTCTTAAGTTACACTGAGACCTT-- S_araneus300249 -TATTC-CTACTATAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- S_araneus300494 AAATCATATGGATAAAATTCAAAATGAATTTGAAGTATT-- S_tridecemlineatus300326 GT-GATAGCACTTCAGCTCTAGAATTACACTGAGATTTT-- S_tridecemlineatus300080 -CATTA-ATACTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- T_belangeri300325 GT-AATGAAACATTAGCTCTAGAATTACGCTGAGACTTT-- T_belangeri300326 ------------TGAATTTTAAAATTAC--TGAGACCTT-- T_belangeri300046 -TATTA-CTATTTTAGCTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- T_belangeri300072 -T-----CTACTTTAGCTCTAGAATTACTCCAAGACCTG--

Copyright © 2008 Medical Biology, Faculty of Medicine, University of Miyazaki, All rights reserved