snOPY snoRNA Orthological Gene Database

Family: SNORD45

CLUSTAL 2.0.10 multiple sequence alignment C_familiaris300050 GGTCGATGATGA--GCTGGCATGTAT--TCTGAATCTGAA--GTTGATGA C_familiaris300279 GGTCAGCAATGT--GATGGCCTGTGTTAGCTGAATCCAAA--GTTGATGT C_familiaris300388 AGTCAGTGATGT--GATGCTATGT-TTACCTAAACCTAAA--GTTGATGT C_familiaris300394 GGTCAATGATGT--GATGGCATGTATTAGCTGAATCCAAA--GTTGATGT C_familiaris300395 GGTCAGTGATGT--GTTGGCATGTATTACCTGACTAAATG--GCTGATGT C_familiaris300396 GGTCGATGATGA--GCTGGCATGTAT--TCTGAATCTGCA--GTTGGTGA C_porcellus300340 GGTCAGTGATGA--GATGGCATGTAT--TCTGAATCTAAA--GTTGATTA C_porcellus300459 GGTCAGTGATGA--GATGGCATGTAT--TCTGAATCTAAA--GTTGATTA C_porcellus300949 GGTCAATGATGT--ATTGGCATGTATTATCTGA-TTTACT--GCTGATGT C_porcellus300950 GGTCAGTGATGT--CATGGCATGTATTAGCTGAATGTGCA--GTTGATG- E_telfairi300182 GGTCAATGATGA--GTTGGCATGTAT--TCTGAATCTAAA--GTTGATTA E_telfairi300521 GGTCAATGATGA--GTTGGCATGTAT--TCTGAATCTAAA--GTTGATTA E_telfairi300699 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTATCTGAATTTTCT--GCTGATGT E_telfairi300700 GGTCTATGATGA--GTTGGCATGTAT--TCTGAAACTAAA--CTTGATTA E_caballus300187 GGTCGATGATGA--GCCGGCATGTAT--TCTGAATCTAAA--GTTGATTA E_caballus300318 GGTCAGTGATGT--GATGGCATGTATTAACTGAATCCAAA--GTTGATG- E_caballus300319 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTATCTGAATTTATG--GCTGATGT E_europaeus300043 GGTCAATGATGT--TTTGGCATGTATTATCTGATATTAAA--GCTGATGT E_europaeus300177 GGCTAGTGATGA--GATGGCATATATT--CTGAATCTAAA--GTTAAT-- E_europaeus300244 GGTCAAGGATGC---TCTGCATGTATTATCTGACATGAAA--GCTGATGT E_europaeus300400 GGTCAATGATGA--CACGGCATGTATT--CTGAATCTAAA--GTTGAT-- E_europaeus300710 GGTCAATGATGT--TTTGGCATGTATTATCTGACGTTAAA--GCTGATGT E_europaeus300711 GGTCTGTGATGTTTTATGGCATGTATTAGCTGAATCCAGA--GTTGATGT E_europaeus300712 GGTCGATGATGT--TTTGGCATGTATTATCTGAC-TTACA--GCTGATGT F_catus300126 GGTCAATGATGA--GCTGGCATGTAT--TCTGAATCCGAA--GTTGATTA F_catus300196 AGTCAGCGATGT--GACGGCACGTATTAGCCGAATCCAGA--GTTGATGT F_catus300309 GGTCGGTGATGT--GGTGGCATGTGTTAGTTGAATTCACA--GTTGAGGT G_gallus300104 GGTCTGTGATGAGTTTTGGCATGTATTATCTGA--GCATA--AGTG-TGA G_gallus300105 GGTCAGTGATGATTGGTGGCATGTATTATCTGAT-GTAAA--GGTGATGT H_sapiens300666 GGTCAATGATGA--GTTGGCATGTAT--TCTGAATCTAAA--GTTGATTA H_sapiens300667 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTATCTGAATCTATT--GCTGATGT H_sapiens300668 GGTCAATGATGT--AATGGCATGTATTAGCTGAATCTAAA--GTTGATGT L_africana300065 GGTCAGTGATGT--GTTGGCATGTATTATCTGAATTTACT--GCTGATGT L_africana300432 --TCGATGGTGA--GATGACATGTAT--TCTGAACCTCAA-----GATTA L_africana300433 GGTCAATGATGT--GATGGCATGTATTAGCTGAATCCGAA--GTTGATGT M_mulatta300173 GGTCAATGATGA--GCTGACATGTAT--TCTGAATCTAAA--GTTGATTA M_mulatta300438 GATTGATGATGA--GCTGGCATATAT--TCTGAATCTTAA--GTTTATTA M_mulatta300468 GGTCAAGGT-AT--GTTGACATGTATTACTTGAATTTATT--GCTGATGT M_mulatta300515 GGTCAATGATGT--AATGGCATGTATTAACTGAACCCAAA--GTTGATAT M_mulatta300582 GGTCAATGATGA--GCTGGCATGTAT--TCTGAATCTAAA--GTTGATTA M_mulatta300583 GGTCAATGATGT--TTTGGCATGTATTATCTGAATCTATT--GCTGATGT M_mulatta300584 GGTCAATGATGT--AATGGCATGTATTAGCTGAATCCAAA--GTTGATGT M_murinus300049 GGTCGATGATGA--GCTGGCATGTAT--TCTGAATCTGAA--GTTGATTA M_murinus300153 GGTCAATGATGT--GCTGGCATGTAT--TCTGAATCTAAA--GTTGACTA M_murinus300311 GGTCAGTGATGT--AATGGCATGTATTAGCTGAATGGAAA--GTTGATGT M_murinus300400 GGTCGATGATGA--GTTGGCATGGAT--TCTGAATCTAAAAAGTTGATTA M_murinus300412 GGCCAATGATGT--AATGATATGTATTAGCCGAATCCACA--GTTGATGT M_murinus300531 GGTCAATGATGT--TTTGGCATGTATTACCTGAATTTATT--GCTGATGT M_domestica300072 GGTCAATGATGT--CTTGGCATGTATTAGCTGAGC-CGCC--GCTGATGC M_domestica300073 GGTCAGTGATGT--GATGGCATGTATTACCTGAATCCAAA--GTTGATGG M_musculus300542 GGTCAATGATGA--GCTGGCATGTAT--TCTGAATCTAAA--GTTGATTA M_musculus300909 GGTCAGTGATGT--CATGGCATGTATTAGCTGAATGCTAA--CCTGATGC M_musculus300910 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTATCTGAATTC-----GCTGATGT O_anatinus302262 GGTCAGTGATG--TGTTGGCATGTATTATCTGAATCTAAA--GTTGATGC O_anatinus302263 GGTCAATGATG---GTTGGCATGTATTATCTGAATCTAAA--GTTGATGT O_anatinus302264 GGTCAATGATGT--TTTGGCATGTATTACCTGAATCTAAA--GTTGATGC O_anatinus302265 TGTCAATGATGA--GTTGGCATGTAT--TCTGAATCTAAA--GTTGATGT O_cuniculus300175 GGTCAATGATGA--GCTGGCATGTAT--TCTGAATTTAAA--GTTGATTA O_cuniculus300386 GGTAAGTGATGG--AATGGCATGTATTAGCTGAAT-CACC--ATTGATA- O_cuniculus300486 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTACCTGAATTTAAT--GCTGATGT O_garnettii300122 GGTCAATGATGA--GCCGGCATGTAT--TCTGAATCTAAA--GTTGATTA O_garnettii300369 GGTCAAGGTTGT--GTTGACAGATATTACCTGAATTTATT--GCTGATGT O_garnettii300638 GGTCAATGATGT--TTTGGCATGTATTAGCTGACTGCACA--GTTGATGT P_troglodytes300052 GGTCAATGATGA--GCTGACATGTAT--TCTGAATCTAAA--GTTGATTA P_troglodytes300315 GGTCAAAGT-GT--GTTGACATGTATTACCTGAATTTATT--GCTGATGT P_troglodytes300361 GGTCAATGATGT--CGTGGCATGTATCAGCTGAATCCAAA--GTTGATGT P_troglodytes300364 GGTCAATGATGT--AATGGCATGTATTAGCTGAATCCCAA--GT-GATGT P_troglodytes300373 GGTCAATGATGT--AATGGCATGTATTAGCTGAATCCAGA--GTTGATAT P_troglodytes300526 GGTCAATGATGA--GTTGGCATGTAT--TCTGAATCTAAA--GTTGATTA P_troglodytes300527 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTATCTGAATCTATT--GCTGATGT P_troglodytes300528 GGTCAATGATGT--AATGGCATGTATTAGCTGAATCTAAA--GTTGATGT P_pygmaeus300008 GGTCAATGATAT--CGTGGCATGTATTAGCTGAGTCCAAA--GTTGATGT P_pygmaeus300261 GGTCAAGGT-GT--GTTGACATGTATTACCTGAATTTATT--GATGATGT P_pygmaeus300342 GGTCAATGATGT--AATGGCATGTATTAGCTGAATCCAAA--GTTGATGT P_pygmaeus300528 GGTCAATGATGA--GCTGACATGTAT--TCTGAATCTAAA--GTTGATTA P_pygmaeus300590 GGTCAATGATGT--AATGGCATGTATTAGCTGAATCCAAA--GTTGATGT P_pygmaeus300591 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTATCTGAATCTATT--GATGATGT P_pygmaeus300592 GGTCAATGATGA--GTTGGCATGTAT--TCTGAATCTAAA--GTTGATT- R_norvegicus300143 GGTCAATGATGA--GCTGGCATGTAT--TCTGAATCTAAA--GTTGATTA R_norvegicus300592 GGTCAGTGACGT--CACGGCATGTATTAGCTGAACGCTAA--CCTGAGGC R_norvegicus300974 GGTCAGTGATGT--CATGGCATGTATTAGCTGAATGCTAA--CTTGATGC R_norvegicus300975 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTATCTGAATTT-----GCTGATGT S_araneus300249 GGTCAATGATGA--GCCGGCATGTAT--TCTGAGTCTAAC--GTTGATTA S_araneus300494 TATATATCATGT--GTTGCCATTTATTACCTGAAACTT-----CTGATGA S_araneus300915 GGTCAATGATGT--TTTGGCATGTATTATCTGATTTTGAA--GCTGATGT S_araneus300916 GGTCAATGATGTT-GAAGGCATGTATTAACTGAATCAAAA--GTTGATG- S_tridecemlineatus300080 GGTCAATGATGA--GCTGGCATGTAT--TCTGAATCAAAA--GTTGATCA S_tridecemlineatus300326 GGTGAAGGAGGC---TC-----GTATTACCTGAATTTACT--GCTTATGT T_belangeri300046 GGTCGATGATGA--GTTGGCATGTAT--TCTGAATTTAAA--GTTGATTA T_belangeri300072 AGTTGCTGACAA--GTTGGTATGTAT--TCAGAATCTAAA--GTTGATT- T_belangeri300325 GGTCAATGATGT--GTTGGCATGTATTACCTGAATTTACT--CCTGATGT T_belangeri300326 GGTCAGTGATGT--GATGGCATGTATTAGCTGAATCCAAA--GTTGATGT * * C_familiaris300050 TT-A---CTCCTTCAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- C_familiaris300279 A-------------AA-TTCTAAAATTACACGAAAACCTT-- C_familiaris300388 --------------AAATTCTAAAATTACAG--AGGCCTT-- C_familiaris300394 C-------------AA-TTGTAAGATTACACTGAGACCTT-- C_familiaris300395 GT-GATAACACA--AG-CTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- C_familiaris300396 TT-A---CTCCTTCAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- C_porcellus300340 TT-A---CTGCTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- C_porcellus300459 TT-A---CTGCTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- C_porcellus300949 GT-AATAACACTTTAG-CTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- C_porcellus300950 -------------TGAATTCTGAAATTACCCTGAGACCTT-- E_telfairi300182 TT-G---CTTCTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- E_telfairi300521 TT-G---CTTCTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- E_telfairi300699 GTGAATAACACTT-AG-CTCTAG--TTACGCTGAGACCTT-- E_telfairi300700 TT-A---CTATTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTA-- E_caballus300187 TT-A---CTACTTCAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- E_caballus300318 -------------TAAGTTCTAAAATTACACTGAGACCTT-- E_caballus300319 GT-AATAACACTTTAG-CTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- E_europaeus300043 GT-A-TACTACTTTAG-GAAAAAAGAAAAG---AAAATCTAA E_europaeus300177 TA-ATT--TACTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTT-- E_europaeus300244 G--GAGAACACT--GG-CTCTGGGATTACACTGAGACCTT-- E_europaeus300400 TA-ATT--TACTTCAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTA-- E_europaeus300710 GT-ATAG-CACTTTAG-CTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- E_europaeus300711 --------------AAATTCTGAAATAACACTGAGACCTT-- E_europaeus300712 GT-ATAA-CACTTTAG-CTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- F_catus300126 TT-A---CTACGTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- F_catus300196 --------------AAATTCTAAAATGACAG--TGACCTT-- F_catus300309 C-------------AA-TTCTAAAATTACACTAAACCCTT-- G_gallus300104 AG-ATTATCAGTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTT-- G_gallus300105 TT-ATCATCACATTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCCA-- H_sapiens300666 TT-A---CTACTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- H_sapiens300667 GT-AATAACACTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCT--- H_sapiens300668 G-------------AG-TTCTAAAATTACACTGAGACCTT-- L_africana300065 GT-AATGACACTT-AG-CTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- L_africana300432 AT-A---TTATTTTGG-CTCTAGAATTACTCTGAGA------ L_africana300433 GT----ATCATCAAG--CTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- M_mulatta300173 TT-A---GTACTTTAG-TTCTAGAATTACT--GAGACATG-- M_mulatta300438 TT-A---CTACTGTAG-CTCTAAAATTACTGTGATACCTA-- M_mulatta300468 AT-AATAACACTTTAA-CTCTAGAATAATA--TAGCTTTTGG M_mulatta300515 G-------------AG-TTCTAAAATTACACTGAGGCTGG-- M_mulatta300582 TT-A---ATACTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- M_mulatta300583 GT-AATAACACTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTT-- M_mulatta300584 G-------------AGTTTCTAAAATTACACTGAGACCTT-- M_murinus300049 TT-A---CTACTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- M_murinus300153 TT-A---GTACTTTAG-CTCTAGAATTACT--GAGACCTG-- M_murinus300311 G-------------AG-TTCCAATGTTACACTGAGACCTT-- M_murinus300400 TT-A---CTACTTTAG-CTCTAGAATCACTCTGAGACCTG-- M_murinus300412 GA----ATTTTTAAAGACATTTAAATTATGCCGAGATCTT-- M_murinus300531 GT-AATAACACTTAAG-CTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- M_domestica300072 TT-CCTACCCGGAAAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCGT-- M_domestica300073 AT-ATC-ACACTTTAG-CTCTAGAATTACACTGAGACCTT-- M_musculus300542 TA-AA--CCACTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- M_musculus300909 A-------------AG-TTACAA-ATTACACTGAGACCTT-- M_musculus300910 GT-CATAACACTTTAG-CTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- O_anatinus302262 TT-ACCATTCCTATAG-CTCTAGGATTAC--TGAGACCTT-- O_anatinus302263 TT-ATCACCACATTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTT-- O_anatinus302264 TA-ATTACCTCTTCAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCCT-- O_anatinus302265 TT-ATCACCAT-TTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGGCTTG-- O_cuniculus300175 TT-A---CTACTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- O_cuniculus300386 -------------TGAATTATAAAATTACACTGAGACCTT-- O_cuniculus300486 GT-AATAACACTTTAG-CTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- O_garnettii300122 TT-A---CTACTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- O_garnettii300369 AT-AATAACACTTCAG-CTCTCAAATTATGCTTGGAACTT-- O_garnettii300638 -------------GAG-CTCTAATGTGACACTGAGACCTT-- P_troglodytes300052 TT-A---GTACTTTAG-TTCTAGAATTACT--GAGACATG-- P_troglodytes300315 AT-AATAACACTTTAA-CTCTAAAATAATA--TAGCTTTTGG P_troglodytes300361 G-------------AG-TTCCAAAATTATACTGAGACTTT-- P_troglodytes300364 --------------GAAT-CTAAATTTACACC-AGACCTT-- P_troglodytes300373 G-------------AG-TTCTAAAATTACACTGAAGCTGG-- P_troglodytes300526 TT-A---CTACTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- P_troglodytes300527 GT-AATAACACTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTT-- P_troglodytes300528 G-------------AG-TTCTAAAATTACACTGAGACCTT-- P_pygmaeus300008 G-------------AG-TTCCAAAATTATACTGAGACTTT-- P_pygmaeus300261 AT-AATAACACTTTAA-CTCTAGAATAATA--TAGCTTTTGG P_pygmaeus300342 G-------------AA-TTCTAAAATTACACCAAGACCTT-- P_pygmaeus300528 TT-A---GTACTTTAG-TTCTAGAATTACT--GAGACATG-- P_pygmaeus300590 G-------------AGTT-CTAAAATTACACTGAGACCTT-- P_pygmaeus300591 GT-AATAACACTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTT-- P_pygmaeus300592 TT-A---CTACTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- R_norvegicus300143 AT-AA--CCACTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCCG-- R_norvegicus300592 C-------------AG-TTACAA-ATAGCAGTGAGACCTT-- R_norvegicus300974 A-------------AG-TTACAA-ATGGCACTGAGACCTG-- R_norvegicus300975 GT-CCTAACATTTGAG-CTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- S_araneus300249 TT-C---CTACTATAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- S_araneus300494 AA-ATCATATGGATAAAATTCAAAATGAATTTGAAGTATT-- S_araneus300915 GT-AAAAATACTTAAG-CTCTAGAATTACGCTGAGACCTT-- S_araneus300916 -------------CAAATTCTTAAGTTACACTGAGACCTT-- S_tridecemlineatus300080 TT-A---ATACTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- S_tridecemlineatus300326 GT-GATAGCACTTCAG-CTCTAGAATTACACTGAGATTTT-- T_belangeri300046 TT-A---CTATTTTAG-CTCTAGAATTACTCTGAGACCTG-- T_belangeri300072 -------CTACTTTAG-CTCTAGAATTACTCCAAGACCTG-- T_belangeri300325 GT-AATGAAACATTAG-CTCTAGAATTACGCTGAGACTTT-- T_belangeri300326 G-------------AA-TTTTAAAAT--TACTGAGACCTT--

Copyright © 2008 RI Laboratory, Frontier Science Research Center, University of Miyazaki, All rights reserved