|
|
| Xenopus_tropicalis rps3 | ||
| organism | Xenopus_tropicalis | |
| locus name | rps3 | |
| chromosome ⁄ contig | scaffold_277 | |
| snoRNA list | SNORD15, SNORD15, SNORD15, SNORD15 | |
| snoRNA position | 3807..3949, 5726..5872, 7129..7275, 8431..8576 | |
| length | 10585 | |
| sequence |
agtacatgggggcaatatgatggggcaataaaaaggctgctggcagcctggcacaggta
catgggggcaatcaggaagggggggggcactcattgaagcccttgcctagggtgccaaaa taccttggcccggccctgccgcatcggctcgttgatgaggttcccgaaacagctgcatct attgccggcattcttattcaattgtttggccccagggccaagtcagatattcttcaggac tgctaatcatctgccctgctgctacatagtttcaggagtcagaaccaccatggcagataa tataaacagcaacagcaagagggatactactttcaatagtaattacattcacaaataact gaaaaatatcatgaatttgtaaatataacatttttttaatcttcctgaagtaaattttat ttctataaggacctttggagaactgtcaaatgccagtggtgggggggcctatatgattgg acaagggggaagggcttcctcagaatggggcaaggggggtccctagtgggaccagatccg acattcagaggtgacaggcagtttccatgtatctacatgagagatggcacacagtgcttc ctgcagactgaaatgttacctgagccatcggcctttattatttctgattatattaaccct ttacatgagtggttattgcactttgctgacagacgactaaatggcaaagtacaggaagtg ttaggcgtacattgtttggctgagagttgtagtacaacaagagctgttgagatatatcta taaagtaccaactactaagaaaggcaaatttagaaatttgggaacacattttcaagaaaa tcaatattttttgcaaaatgtttcccctacggcaaacaatttcctacgcaaaaatcaccg gtgaaactcctatgcgctaaaactacatatcccgtggggcattgcgcgctgaacgcacac tttcctgtcacactctaggtatatagcagcttccgccggaaGTGGCCTCCCTTTCCTTCC AGCGGCGCTTCGCAAGATGGCGGTGCAGATCTCTAAGAAGAGGAAGgtaggcttaaaaaa agcgctcttttatagtgtgcggtgggacattgtagggcaatacagttagcgctgggtcca gggggctccggagggtgcagggaagcatagagcgggcagatggctgtgcctgcggggtag atggatggagattgagtcgggcctgagagtccggagctgacatggctgcgcgctgtttgg ccccaggcaagccgggtatgtgtgtgggactgtgatactgagataggaacgtctgtttcc tattggctacacctagttggtatagatagggttaatgagactctctgtaccaactatttg tgtgtaagttacccctgtattactgtctgtctgtctcctattcactattactgccctgta ccccaatgtctctatctgtaaccttgttatgggctaagggggcccagcctgaaggccagt tagggggggatttggggtgagtgcttatttgtgccctgggtacccctggaactatagcag ggtgactgttaccccaatgtttctatatatctgtaaccttgttatgggctaagggggccc agcctgaaggccagttaggggggggatttggggtgagtgcttatttgtgccctgggtacc cctggaactatagcggggtgactgttaccccaatgtttctatatatctgtaaccttgtta tgggctaagggggcccagcctgaaggccagttagggggggatttggggtgagtgcttatt tgtgccctgggtacccctggaactatagcggggtgactgttaccccaatgtttctatata tctgtaaccttgttatgggctaagggggcccagcctgaaggccagttagggggagacttg gggtgagtgccactaatggaactgtatatatatatcgggcaaatggcaggtgttattggt aagggacatgtgcgaggagttagtgacatttgtatattaattaatggctctctttgcagT TTGTCGCTGACGGCATCTTCAAGGCTGAACTCAATGAGTTCCTTACTCGGGAGCTGGCTG AAGATGGCTACTCCGGTGTAGAGGTCAGAGTCACCCCAACCCGGACTGAAATCATCATTC TCGCTACCAGgtaacaagttggatctttatttcaatcacttttatattatctcacattat ctgtagttgcattcattttggtgatggtgacgtatagatatgatatataggatacaaagc caagacctgttattatcctgattagaaactgtgcattagaatttactgcaggtaggataa tggctgcgtagggtttatcatccttccagaagactaatacacagttctcccaggattgtg ggtataagtagaatatatggcgaagcaagctggcagtgatattcactatggggatatcca caatttcaaatagttcccttccagaacagcttgtgtttggttgtgtgcattgctgctttt gtaactccgttccgtttcccacatgcagAACCCAAAATGTTCTGGGTGAGAAGGGCAGGC GCATCCGTGAGCTGACTGCAGTTGTTCAGAAGAGGTTTGGATTCCCTGAAGGGAGTGTTG AGgtaagtgatctctctgcccgtattaactacagagcatttaaagggtaggagtgtgcta tttacataagggcccctgtaacagccccctttccccaccacaccacccacactcctccaa cccactaccccccataccttataataaaaggcagagtagttggtggtgggcattgcttga caagtcagggctggatcagctgcaaatgtgcctggccctgggcagccatcccccccagag agcaaagcagtgtcggcagtcaactcttctactcaactctgcctttcaaacagggtagag ttggggtccgtataagagagttaacttttcatgtaatagaacagtgatccccaaccagtg gctcaggggtaacatgttgctccccaaccccttggatgttgctctccgtgcccccaaacc agggagttatttttgaattcctgacttgggggcaagttttggaagctgatagtgtgcata gaggttgcctaatagccaatcttagcccttatttggctcctccataaacttttatgcttg tgttgctctcagtctttttacatttggctgtggctcactagtaagaaaggttggggatcc tttttatagaatgtccttcccttagcaaatctcaatggttcatgattttgagtacttttg cttactttacagttttcatattggtgtctgaccccaacagaaaactctttgaggctatac ttttattatgaaatgttatttttctttgtttagccactttcctattcactgcctggttac tagggtaaattagaccctagcacagggctctccaacctttttcatccataagccacattc aaatataaaaagattcagggagcaacagcataaaaaaatgtcctgggaatatcaaataag ggctgtggactatgtacactttttttttttttttttgggaacatccaagggtttggggag caacgtgttgcccccgagccactctccagattggagagattttgtacaaatggcaaaacc acaagtgaccaatcgcagattgtttcagaatatctgtccagataattgtaaaaacttcaa agatgcactttaatagggttagctgtagctcgactgctagcccgcaggcaagcagtgttc taatgcagtggttccaggtataggattcttcagtgatgatttgatgacgagtcggacatt ctcctctcgtgccccagtcggcggaaggagctgcgttctgccgctgcttttgctgttggg ttctcatgagaaagttgtgtgaagagtcttgaggcatttgtctgagaagaaaaccttttt ctgtgttatgatcctgttgccagtgaatggactccatgtttttgtttaaatctggaagta cgtggctactaaaatgcttaaggggcccttttactaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacagac attattgatgcagtctgataaattgcagttttctctgtccccattccttcatttactctc ttatgagcccaggacctcggacggtgcttaatactctttgaaagcagtgggttttaccca acgagctgcagacactgctagttgctacgcactggctcattggtacagtgcattctgtct taaggcatttttgggtttggttctggtgggaaagtcacataatcttcctgtaacaggaga taaactataggggagatcaactgatgggggttcagtcatggggcaacagtgcgtttgatg gcaagcaaccaatttccaacctacctaaaaagaatttaatgtacatgtaaatttgaataa actcttaacagaatcttaactgagaggctcacaaataaaggtcatctcaccccctgcaga gtggttttcggcctgatccctcgagagtgatatttataaaccaaatacagttttatctgg aattttatttgctttttcacagatttagacaagatgatttactggctcagttctcctgag cttggggatttatttctgtatctgctcacggtgatggttttctctttgtagCTCTATGCT GAGAAAGTTGCCACAAGGGGTCTGTGTGCCATTGCCCAAGCCGAATCTCTCCGTTACAAA CTCCTGGGAGGTCTGGCTGTGAGGAGgtgagtctcatttgaggaaaggggatttattaaa gccaatgggttgtggtttttgggagcagtttctcttttatttccgctctcaattaaatca cccttggagctgtgcattgtaaaggaatcaaccctactatagtttatataaataccccgc tgtgtagcccgggggcagccattcctgcactggtacagctggggtgtttgctacagaaac cctactatagtttatataaataccccgctgtgtagccccgggggcagccattcctgcact ggtacagctggggtgtttgctacagaaaccctactatagtttatataaataccccgctgt gtagccccgggggcagccattcctgcactggtacagctggggtgtttgctacagaaaccc tactatagtttatataaataccccgctgtgtagccccgggggcagccattcctgcactgg tacagctggggtgtttgctacagaaaccctactatagtttatataaataccccgctgtgt agccccgggggcagccattcctgcactggtacagctggggtgtttgctacagaaacccta ctatagtttatataaataccccgctgtgtagccccgggggcagccattcaagctgcagaa aaggcacaggttacatagcagataactgataaactctgcagaatacaatggagttttatc tatctctgtagcctgtgccttttttcctattgaatgctgcctccatggctacacaaaagg gtttatatagaaactatatagtagggtttctgaagcaaacacaacttttaccaatgcagg gcaacagtacattatacttttgataactcattttactcattttttaggtgttacccttta acttggctatcttcccagagacttgaattgagttttgctctggttttcattcttccctgg ttcttttgccttgtcctgtatcagcccttcagtgatgagacgatgacgagtcagacagga caagcaatgtagtgtttcctgcacgggggcacgttctgtgtcgctgggcttggctgcact gcatgagatttgtccttcttactgatcgatattgaggcatttgtctgagaagggttggca tttgttttaaataagcggctcagtttttattttaagggggagaaaaggtgcaggttacac agcagataacatataaactctacagaatacaatggtgttatctatgtaacctgtgacttt tctccttttgaatggctgcccccaaggctacatagaaaggtttatatagaaactatggga gtctttctgaagcatacacacaacttttaccagtgcagggcaacagtacattattaatta gtttgatacatttacattttttggtcttactgttccttaacttagttagacttcaattgc tgtaacccttaacctgccagcagtgccacccacagagggaagaaacattattcctattgc aacagcaatttaaacttatagtaatcttcatatcttaatcgtatgtatatagtgcatccg ctccgggcctcccatagtgtagcttctgaaaatgcggagcagcctcatagatggatcagt aactggattggtactttttattagaaccacttatgttttagcactttagccaaatctgta ttgcagctccagaggaatggtacagacttgatagcaattttgtgacaaattttatcccat tatgccatgtagaaaagcctccagctttctgcgttttgtttggtttcagtaaaggttata tgtagtaactaagcctgactctctcccctcactagAGCTTGCTATGGTGTCCTCCGTTTC ATCATGGAGAGTGGAGCCAAGGGTTGTGAGGTTGTCGTGTCCGGAAAACTAAGAGGCCAG AGAGCCAAGTCCATGAAGTTCGTAGACGGCCTGATGATCCACAGTGGAGATCCAGTTAAT TACTACGTGGATACTGCTGTACGCCATGTGCTCCTCAGGCAGGgtgagtgggtagaactt gtgcgctcctatgtccctaggcacacagtggtttctctgcttctctcagcctgtggaacc tgtagttttcattgcagacacatggagcagcgcagggaaaaacgtggctgagagaagcag acaagcagttccatgtacccagggccttaatgaaagtgtgttaactattgattagccagc agtgagtttaattttgggcttgattttccttgtttccatttttggttctttactttggca gtcagtttcttaggtcagtgcatttagcaggaaggaggtctctaacagactggaaagttt agctctgtcttcattctactctggttcctttgccttgtcctgtgcagcccttcagtgatg agacgatgacgagtcagacaggacaagcaatgtagtgtttcctgcacagaggcacgttct gtgtcgctgtacttggctgcactgcatgagatttgtccttcttactgatcgatattgagg catttgtctgagaagggttggcactacctaattgtgggcaaaaactttgttaccctcctc ctggttgctatgggactagcggtactgctaattaatcatagcccatagcttcacacaaag actaccaaaaatgattaaaaccagtagctcactaagtaatttaattggtccgggtttgaa acccccagaccctcctcatccaattcaatgttttatgcaatatcaacaaaatcaaagaaa atccgcacttaccaaaaaaatatagtggcctgggtgaagctccccaaaccagtagcttgg gggtgtagcatagaaccgaactgtagaaagctggcaatcctttatccactataaaacatg tctttttattttaaaggtctagcacaaaattgtgttttcttttagacctacaataaagac atgttttatagcagataaaggtttgcacgccagttctgtacagtttggttctatggaatc tgctttgctgtgttttgggtaggatcctcaatagtttaatgtacagtgctttatatttac tctaaaggagggttttgtttataaaacggtatcataagggacatgaactgtgtaaaagtg cccacctgtgtccggcaattgggggtaaaggggaatatgtccacaaagaaactgtccagt cattgtaaaggatatagtggtgcctggcagtgtaaattgtctatcaaagcttcatggcac tgggtagcacactggatatagcaaaatgcacagctgttgagaagtgtcacttatttgttg tagcccgagtcctaatcattggtttaggttttttccataaagtctcaatcttggttcttt agtttaaaaatgcatttttatttttaactgcagGTGTCCTTGGAATCAAGGTAAAGATTA TGCTTCCCTGGGATCCAAGTGGAAAGATCGGACCCAAGAAGCCCCTGCCTGACCACGTCA GCATTGTTGAGCCCAAGGAAGAGATTCTGCCTACAACCCCCATCTCTGAGCAGAAGGGAG CCAAGCCAGATCAGCCACAACCACCCGCCATGCCACAGCCTGTGCCCACAGCATAatggg tatgccttactgacctgtgcaaacataaattccattttattataccctaaacatatacag tacaggccatagccatatttgaatgagagcccttctgtgatgatacgatgacgagtctga ttgggtaaatccttttccagtggtccctgtctgcatcacgttctgtgctgtaggctgaag cccactgagtcaaggttgccctttgcttgatgtccatgaggcatttgtctgagaaggtga aagtattgggcttttatatgggtcgtgctctctgctccagcatggcggccagctattact ggcattctccccttcaactgggaaatagtgtttggctcatacagacagtggaaatctgtc ctctttcctgtgcattgttacactgagctgccatctgtctgtttgcaacgttctctggta aattttgccactgaggaaatgtaatatggcagctcaaattctatttgcaaatacacagtg aaggcgtttgtgctctgacttgtacacttataatttgctaagtaaagggatgctctacag cagtgatccccaaccagtggctcaggggcaacatgttactcaccaaccccttgggtgttg ctctcagtgcccccaaaccaggtagttatttttgaattcctgacttgggggcaagttttg gttgaataaaaacaagatttgctactaaataaagcccctgtaagctgatagggtgcatag aggcccctaatagccaatcgcagtccttatttggctcctccatgaacttttatggtgctt gtgttgctccccaagtctttttatgtttgactctggctcacgagtaagaaaggttgggga cccctgctctacgggtatgggatctattattagaatgcttacaagctggtgttttacctc ctaccagggctgctaacaatcatttaaacattaaataaaccaaataggatgattttgcca ccaatatgatttgtgcagcttagttcctataaagtacagggtgctgtttataataaaaca aaattttttaaaattagaattaattgctttaaatcagctttggaaggaataatggaagat aaatgtcatttgtatgttgatacattgagtcgctgatctacgatgtgcagcctatttgta agaattaaagttgtttttttttttttattATAGGCTGAAGTCCTGGATTCAAAGATTTTG GATACAGTATCAGAACATCTAAAATAAAAAAATTAAAATCCAAATTgtggtatttgtgtt attgtctgtgtgtatgcatttgtgttgggcgcccaaatagcaggatttacggtttcctta accttaaaggtatattacagcatgacgtgtaatgcagcagtgagactttatcattcgctt gtgtattgggcattaaaaattgacacccccctacccccagccccaatcttcagtggtttt acattcatttgaaattgctactgaaagtaatctgtgtcctttcccagtcactgcactgtg ggttgggattacttgaaccattcaaaggggttttctgccttaaaataaacttctagtatg atgtagagctttgtattctgagacaatttgcagttgatctttactttttattttgtgatt taattatttagctgttggttcagcagcctttcagtttgccattttggctggtatctggtt gctagggtaaaattaccctagaaaccaaggagtagtttgaatgagaaactggaatatgaa tgagaggaaggataggtaataagtattacaataaaactggagcctcacagagcaatagct tttggctgctggggtcagtgacccccatttgaaagctgcaaacagaagaaggccaagaac tataactactcatgtagtcagaacctgcagtgcagacaatagaaagggacaggccagtta gtgctttccactgtaattaacctttaatgtgtggtgttacttacaacaaagtgctttctt tttgtaccttttgtgtttaaaaaccccaaaagcaaatctttagaggtcaaaataattctc actttttttttctccaaaatgagtcaattttattttttttctgacctactttgcccctga ccgtcccattcttttccctgcatcagtttagccctatagcaatctcactttcacttccaa tggttattggttaaaataagtgatgtatcgaaataacagattctgatttgacaatgtaaa acaaagccagtttgcaatttttttta
Untranslated Region
Coding Sequence snoRNA |
|
| exon position | 1001..1065, 2039..2169, 2548..2641, 4671..4765, 6575..6762, 8133..8334, 9509..9585 | |
| CDS position | 1036..1065, 2039..2169, 2548..2641, 4671..4765, 6575..6762, 8133..8335 | |
| accession no | ||