|
|
| Xenopus_tropicalis rps12 | ||
| organism | Xenopus_tropicalis | |
| locus name | rps12 | |
| chromosome ⁄ contig | 5 | |
| snoRNA list | SNORD101, SNORD100, SNORD100 | |
| snoRNA position | 1671..1744, 2235..2317, 3927..4017 | |
| length | 7417 | |
| sequence |
gtattggcaatctgaaagtcatagaattttcgtaccgaaccattgcaaacagcggcaga
gtctttccgaatttttcacacgggcacgcggaaaaaattgcagagaatacacccggagcg ttcgcatgaacgctccgagcgttcaggtctttgtaaatctccccctaaagctggccatac acgtggtgatctgacgatgttttgtgcgaccatcggtcgcacgaaacatcgtcagatccg ccacacaccattcagggctgaatcggcaggtaagaaggtagaaacaataggatttctacc tccttctgccgattcagcactgaagggagattttggtcaggcgccttctatggcgcccga tcaaaattttcaaactggtccgatatcagcagcttcctgcgatatcggtcgactcaccga cataccatacacgcaccgaatatcgtacgaaacgaggtttcgtacgatattatcggtgcg tgtatggccaccttaaggctaaggtcattgtcatgaaattgtcacagtgattaacacgaa cacattaacaaaacaaatacatactttgtttacatttaatcgatattgcagttaaattat agtactacagttaaaaatgataaaaaatgaatgagctgctagaccacggtgcataactac catcagctaaaacaactgcgcttttgaatcattctcaataaagttgttacaaaagttgtg ccaaggctgtatcctagcaacaaggagtatcgatcccttttcgttagccctatcatcctt tactcaaaacactttagcaactttctacatctcagactcagtatacacacccgctttgtc tggaaaataaagttgcaaagcggaaaacgaacctatagtaatctttaagccatgacagaa cgtgtccaaagcttccgcatttgcgtgcatagggtagaacgtaagaagggggcgtgtttt aaaatgcgtagtataaatatgtgacgtcagcgccgttcgttctctttccacagttgttct ggatgtggcagggtgagtgaatgagtgggaaggttggggatggcatgcaatccgccttat atctttggcatcgctctgtcccgagccctgtcataaggctgcacagaagggcctaagtaa cgatttcccttttatgtcttcatttcagcgatttgacgccttactcccactcctgatcca acgatggccgaggaagggtgagtgccgaggcccgctgtggcctgctgtgtgaaagagtaa tggcaacacgttacatttctgtacgtaccggtgtaaagagcgaatgcatctgccctgtgt cttttctttacttgcttgtatgtgtggctcatgtgtttggggtatgagtgaggcattctg ggaaggacgctgttgaatttgttcttatacagctagttccttttatgtgcacgtttaaat gtccagtctcctagttataggaaaagtggaattacacgtagtgatatattcagtgtgaac atccttttgaatcttgcgcctatattttccttctattatagtgttccttttattgggtca ttgtaaataaaactgggattttttgtttgacaggaaatgcggttgttataatgctataag tggaataacaaatctgagtaaaagcataatgtcttcagttattgctgcagtgtttgtgtg atgattttactgtaaagtcggataccccttcactctttctgagtgataacttctatctga caaacctgcagcagcctcagatgtatttgtgttgggtgcaactgcagaagatatttgacc agcatttgttttttagcatttctgctggaggtgtaatggatgttaacaccgcactgcaag aggtgcttaagactgctctcatccatgatggtctagcacgaggaattcgtgaagctgcca aagctcttgacaagtaagccttccaaagttttgaaatccctactgctgtgctgtctaata catggccttttctcgatgggtttccaaatgtgaaaatattaaatgaagatactcaaattg atatttaaacttttgctaattttgacacatcaaaaaactttctgcatctttagctttcat gtagaatgaaacttgagcatcttgatgctgttaatttcttgtagcgcatgaaaagttctg caagtgccaaagataatgtaaacttaatttaacacaaggcttcatttgtctctgctccca catatccagcccacctttacctatgatgagaatttggctccctcttctgaaactagtgag gaaattgccaattgttacccaataatctctgaggtgcatggggggaatatagcaaacgtt cttagctgaaccaaatatgtgtataggtaactcttagatcttgtcacctatctgacagat aatgtaacttaactatacatcagttctaaaaaaacggtaaactacctttaaagaataagt aaaccttattttaaaaaactcagaataaccgctaagagctgtggttgagctgcttgtgat aaaaaaaataaaatggagctgaatgtagggagaaaggtatgttctggggctttttgggct caaaagacatgctaaaaactactttaaattttttaacatgtatagtcaaagtgaaaaaac aaatgtgttgcctgagctgttggaacttttttgaagtcactttaattttttggttctcat gaaacctttttttttttttttaaggcgccaagctcacctgtgtgtgttggcttccaactg tgatgagccaatgtatgttaaattagtggaagccctttgtgctgagcaccagatcaatct tataaaggtaagtaaaaaaaaaaaaaaaacttaaatgtaaatgatgtgaggaaaaataat gctttattacccgaaacggtattttaccatgtgattgcagttaaaatgtgtttcagggga gtggatatgataaagaaacctgcccaacggactagcaatactatacttgaagattgtaag ctcttttgggcagggctctccacctcttgtaccggttattgattgctttatatgttactc tgtatgtccaatgtatgaaacacacttattgtacagcgctgtgaaatatgttggcacttt ataaataaatgttaatactatagatttacagaaacaaggacagtgcaataactagggttg tgacattcacacctgagtttgtgttaaagcacaaaggttgatcaaagaagctttggatat tttgagaggaaaaaactaacccccccccccgatttgaatggggcaattttcctgagtaga ttaggcatgcatatatgtaaggtccttccatgtagctagctgagtttaaatagatactga actgtgttaaagtagcccttccttgaattttgtctatttgggattatagagaatcttctc tctaaggattatagcacgcaggcactttgttccatgtgagaaacttagctacctgcaggt gctgatagtgacagaccttgaatgggaatctttcacctgcggggagtgagatttcctaca gactagtgtgctataagtcatcacccttatgcatctctgcactggtaaactcgctacttt tgaaaacatggagaagccagtaggcaaagtgttctgtactcatggtgagcagtgctcaaa cactgctaattgaattgtgttgaaaatagtctttcagtaaagggtaacattgcaacctta ttcagtgctaacttttgtagttggctaatactggcatgcttgatcctatctatgcactat acagggtgctattttttgctatggaatgtgagatttgggtgtttttacagacttattaat ggtgactataacagttgttggccttttaaatcatgggatcagtcttattctctttattct aaataacttgtggaagttaccttttcagttgtatgctatgatgataacttggctccctct actgaatgctatgaggagaaaagcctaaatgttacccaatacttcctgagtttacagcta gtgctgtctttttttgcttcctctgcatcattgtgactggttaataaaaatatattgtct ttaaggttgatgacaacaagaaacttggtgaatgggttggtctctgcaagattgatagag aaggaaaaccccgcaaagtggttggttgcagttgtgtagttgtcaaggtaagcgctattt taacttgctaatgccattgtgagcagctgttggcttaaatgctcttcagacctggctcaa atcctatggcaataataaagccatcgtacgagccttgaggcctccctatggcattcaagg tccctgaaaatggcaacatgtactgctaatacagcaaagttgtatgggatggctggccat ctatgtttagtgttaaaattactttcatatagtatatcgtgttatagacacagagacaaa actggcacacctgttgtggttaaaatataacttttacttcaaagtatttaaaaacgctta aaatagatagaaaataaaagagaggaaatttgtttaaaatgtacacaatcacaccttgag cctgttacaattctagctcttttactcctgaagattgttacttaataaagtatctttagt gtcgtaatttgtttggttacatttgtaacgattctatcatttggtctgcacataatatcc tgtgtggtttatagaggaaagtcgtggttctatcacctaggtaagtgagctgctctatac agcatatcttttatgatttgtgatcggagtcataatcctgttacccaggtaagtaattag tctgcataaagcactttgtaaggtttgtagagagtcgtaattatataacttcggtaagtc ttggtaggggaaagttctcacagagagttggaaataatctcaccatccctgtaataaact ttattccacagtcatgtgttgtgtctttatttgatccacgtttactttatggtggggatc agtcaaggtattcactgtgtaaaccggtaagtgtctttataatgctcgttgcatgaggag tgataaatcacctggctattgcccaatacttcacccaatggtgcgatgtttctagatagt actcgtatataaaagggaattattaagcgccctgagatagggaattctctgataaatctg atatatgagtactatctagaaacatcgcaccattgggtgaagtattgggcaatagccagg tgatttatcactcctcatgcaacgagcattataaagacacttaccggtttacacagtgaa taccttgactgatccccaccataaagtaaacgtggatcaaataaagacacaacacatgac tgtggaataaagtttattacacggatggtgagattatttccaactctctgtgagaacttt cccctaccaagacttaccgaagttatataattacgactctctctacaaaccttacaaagt gctttatgcagactaattacttacctgggtaacaggattatgactccgatcacaaatcat aaaagatatgctgtatagagcagctcacttacctaggtgatagaaccacgactttcctct ataaaccacacaggatattatgtgcagaccaaatgatagaatcgttacaaatgtaaccaa acaaattacgacactaaagatactttattaagtaacaatcttcaggagtaaaagagctag aattgtaacaggttcaaggtgtgattgtgtacattttaaacaaatttcctctcttttctt ttctatctattttaagcgtttttaaatactttgaagtaaaagttatattttaaccacaac aggtgtgccagttttgtctttgtgtctataacacgatatactatatgtcaaaactttaaa tactgagcacccaaactagattactgtagtgcgaggtttcctagaacttatttatatcaa aattactttcataacatatttttttttctatgaaaacatagacatttttttaaagaagga aatgtagaattgctagtggtgatgccaaaagattagtattactgggaagtgccaattgct tacggataccctgggcttgcacttctgcaagtatctgccccagcccagggtattttctaa gcaagtacacagagcactaatctgcttttcaggtggtcagtggacctgggctggtgtatg tgggtacagtgaaagctggctttctgcttagtttggattttttgctaacgggagggaagt taagtgatcatgggtgtgtgataccttacttgctaaaacatgctttcttttcttgttgag agtaattatgtactgtctttttgtaggattatggcaaggagtctcaggccaaggatgtca tcgaagaatacttcaagagcaagaaataaacatctaaaataaaaagtattgagcctgatg tgtgtgggttatttttttttttgtcttgtatgtagcatccacttgctatgtgtagtgttc ttgctgcagaattccttctatagtttatagattacgctgctgtgtagccatgggagcact attcaagttgtaaaaaagagaaggtacaggttatacagagataatctattatctgctatg taacctgacatctagtgctatttcagtttcgaattgctgcccccatggctgcacagcacc tttgcttatataaactgattctacagtaaacacagctcttaaccagtgcagggcaacagt actagggatgcaccaaatgcactattgccacataccctgctgaatttgaattctaatttg catatgtaaattgggatatggaagggttaaagagcatgcatagagaaatttttaacttcc atgttaaagtgacacagttatgtaattttaagggttcattttgtccagtagcatggattt tgctaaatcttgctgaaacgccaaatcctggagttggtgcatccctaagtagtacgttct tttaatgtgatatattttatggtggtaatgtttcttaaagatggcagttttagaataaat ttcccttttcttaacagacatatcacatctatacacctagaatacacttcagctgtgggt gagaaattggataaaatacttgaccaaaactgcacaaatggtctgtagcaaaatactgaa tggttagatgagcaggctaaattagattgttgagcttcgtgttaactttgttccagtgtt ttactttattatcatggatgtgtgtagactgcttttgtcagaataactaactatagtact aaatgaaatgcataggctgtttctctagagcagtgctgtccaactggctgcccccactgt ggctgctgtgactgcttacctttctgtaagatttaaatggcatgagtacttagattaact gcccccccctgcatggttaacatatcagtttaaggctg
Untranslated Region
Coding Sequence snoRNA |
|
| exon position | 1001..1031, 1168..1216, 1816..1932, 2724..2826, 4085..4186, 6326..6417 | |
| CDS position | 1203..1216, 1816..1932, 2724..2826, 4085..4186, 6326..6388 | |
| accession no | ||