Xenopus_tropicalis rps12 | ||
organism | Xenopus_tropicalis | |
locus name | rps12 | |
chromosome ⁄ contig | scaffold_172 | |
snoRNA list | SNORD100, SNORD100 | |
snoRNA position | 3742..3824, 5432..5516 | |
length | 6689 | |
sequence |
tatcgtattggcaatctgaaagtcatagaattttcgtaccgaaccattgcaaacagcgg
cagagtctttccgaatttttcacacgggcacgcggaaaaaattgcagagaatacacccgg agcgttcgcatgaacgctccgagcgttcaggtctttgtaaatctccccctaaagctggcc atacacgtggtgatctgacgatgttttgtgcgaccatcggtcgcacgaaacatcgtcaga tccgccacacaccattcagggctgaatcggcaggtaagaaggtagaaacaataggatttc tacctccttctgccgattcagcactgaagggagattttggtcaggcgccttctatggcgc ccgatcaaaattttcaaactggtccgatatcagcagcttcctgcgatatcggtcgactca ccgacataccatacacgcaccgaatatcgtacgaaacgaggtttcgtacgatattatcgg tgcgtgtatggccaccttaaggctaaggtcattgtcatgaaattgtcacagtgattaaca cgaacacattaacaaaacaaatacatactttgtttacatttaatcgatattgcagttaaa ttatagtactacagttaaaaatgataaaaaatgaatgagctgctagaccacggtgcataa ctaccatcagctaaaacaactgcgcttttgaatcattctcaataaagttgttacaaaagt tgtgccaaggctgtatcctagcaacaaggagtatcgatcccttttcgttagccctatcat cctttactcaaaacactttagcaactttctacatctcagactcagtatacacacccgctt tgtctggaaaataaagttgcaaagcggaaaacgaacctatagtaatctttaagccatgac agaacgtgtccaaagcttccgcatttgcgtgcatagggtagaacgtaagaagggggcgtg ttttaaaatgcgtagtataaatatgtgacgtcagcgccgttCGTTCTCTTTCCACAGTTG TTCTGGATGTGGCAGGgtgagtgaatgagtgggaaggttggggatggcatgcaatccgcc ttatatctttggcatcgctctgtcccgagccctgtcataaggctgcacagaagggcctaa gtaacgatttcccttttatgtcttcatttcagCGATTTGACGCCTTACTCCCACTCCTGA TCCAACGATGGCCGAGGAAGGgtgagtgccgaggcccgctgtggcctgctgtgtgaaaga gtaatggcaacacgttacatttctgtacgtaccggtgtaaagagcgaatgcatctgccct gtgtcttttctttacttgcttgtatgtgtggctcatgtgtttggggtatgagtgaggcat tctgggaaggacgctgttgaatttgttcttatacagctagttccttttatgtgcacgttt aaatgtccagtctcctagttataggaaaagtggaattacacgtagtgatatattcagtgt gaacatccttttgaatcttgcgcctatattttccttctattatagtgttccttttattgg gtcattgtaaataaaactgggattttttgtttgacaggaaatgcggttgttataatgcta taagtggaataacaaatctgagtaaaagcataatgtcttcagttattgctgcagtgtttg tgtgatgattttactgtaaagtcggataccccttcactctttctgagtgataacttctat ctgacaaacctgcagcagcctcagatgtatttgtgttgggtgcaactgcagaagatattt gaccagcatttgttttttagCATTTCTGCTGGAGGTGTAATGGATGTTAACACCGCACTG CAAGAGGTGCTTAAGACTGCTCTCATCCATGATGGTCTAGCACGAGGAATTCGTGAAGCT GCCAAAGCTCTTGACAAgtaagccttccaaagttttgaaatccctactgctgtgctgtct aatacatggccttttctcgatgggtttccaaatgtgaaaatattaaatgaagatactcaa attgatatttaaacttttgctaattttgacacatcaaaaaactttctgcatctttagctt tcatgtagaatgaaacttgagcatcttgatgctgttaatttcttgtagcgcatgaaaagt tctgcaagtgccaaagataatgtaaacttaatttaacacaaggcttcatttgtctctgct cccacatatccagcccacctttacctatgatgagaatttggctccctcnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacttcccattgcagatgactg acacataaattcatatatgttttgttccttacatcagcaatgtccataagcaacatatgg aatgccctaagcattagggtgggggaagtgtatcccattgacggggtatatattcaacaa caaaggagaggcaggaacacaaacacagcattcagacactcgcacaaacacagctaagac acacacacacattcatccactttttagacattagattcatacattcatatattatatttt atggttttggtaggctgtcgatgatatctccaattggctaaatattttatgatttgtatg tatttttctgtaacatttccacacattaaagatacttaaaatatcaccatggtgagtggt gttgattatagaacttacacaaatttgataaatgtacagcaattattatacatttgagca tatttgttagatatggttctgaaccctaattaaggaaatactttgaagggggtttttcct ttcctttaaagcactgtgcagaattaaaagggcagttagagcagtgctgtccaatttttg tggcaccaagggctggaattgttgataacgagggccaataatagaagccagttttgacca cccctctttttaaatcacacccatgttatcacaagagcttttaagaccatacccacatta atggtagcagctcagcaaaaacccaaatggttgctgctcactgtagggatatcatccttc attcatatgtggtattaagacatacccttaaagaagacatatcaaaattaagaatgtacc agtgaattatactctaaatatattgtgcttaaaaaaaaaaaaagtgtgtttccaactgat aaagtgaaaccagcaccatatattattcataattacctacaaaataaggggttccccccc attaaaacaaatatgtctcctttaaatccatatgccaccgccacctcctcccccctgggg acagcacagcaatgtccagcacaaaaaacaccttagtgaccatttaaccgtttccaaagg taacaaattcccagtacaaactcctggcagtttcatggcccacaggcagcatagggtagg cagagtaatgcctgcatgtgccacactctgcctgccctacactgcacacagtatattcaa taacacaatgctggcaccgctactacagtctgaggggtgaacaggtgaacgatggtgatt acagcctgaggtgtgaacagtgcagagaattacagccttaaactgatatgttaaccatgc aggggggggcagttaatctaagtactcatgccatttaaatcttacagaaannnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctagaggatccccgtctct gctcccacatatccagcccacctttacctatgatgagaatttggctccctcttctgaaac tagtgaggaaattgccaattgttacccaataatctctgaggtgcatggggggaatatagc aaacgttcttagctgaaccaaatatgtgtataggtaactcttagatcttgtcacctatct gacagataatgtaacttaactatacatcagttctaaaaaaacggtaaactacctttaaag aataagtaaaccttattttaaaaaactcagaataaccgctaagagctgtggttgagctgc ttgtgataaaaaaaataaaatggagctgaatgtagggagaaaggtatgttctggggcttt ttgggctcaaaagacatgctaaaaactactttaaattttttaacatgtatagtcaaagtg aaaaaacaaatgtgttgcctgagctgttggaacttttttgaagtcactttaattttttgg ttctcatgaaaccttttttttttttttaagGCGCCAAGCTCACCTGTGTGTGTTGGCTTC CAACTGTGATGAGCCAATGTATGTTAAATTAGTGGAAGCCCTTTGTGCTGAGCACCAGAT CAATCTTATAAAGgtaagtaaaaaaaaaaacttaaatgtaaatgatgtgaggaaaaataa tgctttattacccgaaacggtattttaccatgtgattgcagttaaaatgtgtttcagggg agtggatatgataaagaaacctgcccaacggactagcaatactatacttgaagattgtaa gctcttttgggcagggctctccacctcttgtaccggttattgattgctttatatgttact ctgtatgtccaatgtatgaaacacacttattgtacagcgctgtgaaatatgttggcactt tataaataaatgttaatactatagatttacagaaacaaggacagtgcaataactagggtt gtgacattcacacctgagtttgtgttaaagcacaaaggttgatcaaagaagctttggata ttttgagaggaaaaaactaacccccccccccgatttgaatggggcaattttcctgagtag attagggcatgcatatatgtaaggtccttccatgtagctagctgagtttaaatagatact gaactgtgttaaagtagcccttccttgaattttgtctatttgggattatagagaatcttc tctctaaggattatagcacgcaggcactttgttccatgtgagaaacttagctacctgcag gtgctgatagtgacagaccttgaatgggaatctttcacctgcggggagtgagatttccta cagactagtgtgctataagtcatcacccttatgcatctctgcactggtaaactcgctact tttgaaaacatggagaagccagtaggcaaagtgttctgtactcatggtgagcagtgctca aacactgctaattgaattgtgttgaaaatagtctttcagtaaagggtaacattgcaacct tattcagtgctaacttttgtagttggctaatactggcatgcttgatcctatctatgcact atacagggtgctattttttgctatggaatgtgagatttgggtgtttttacagacttatta atggtgactataacagttgttggccttttaaatcatgggatcagtcttattctctttatt ctaaataacttgtggaagttaccttttcagttgtatgctatgatgataacttggctccct ctactgaatgctatgaggagaaaagcctaaatgttacccaatacttcctgagtttacagc tagtgctgtctttttttgcttcctctgcatcattgtgactggttaataaaaatatattgt ctttaagGTTGATGACAACAAGAAACTTGGTGAATGGGTTGGTCTCTGCAAGATTGATAG AGAAGGAAAACCCCGCAAAGTGGTTGGTTGCAGTTGTGTAGTTGTCAAGGtaagcgctat tttaacttgctaatgccattgtgagcagctgttggcttaaatgctcttcagacctggctc aaatcctatggcaataataaagccatcgtacgagccttgaggcctccctatggcattcaa ggtccctgaaaatggcaacatgtactgctaatacagcaaagttgtatgggatggctggcc atctatgtttagtgttaaaattactttcatatagtatatcgtgttatagacacagagaca aaactggcacacctgttgtggttaaaatataacttttacttcaaagtatttaaaaacgct taaaatagatagaaaataaaagagaggaaatttgtttaaaatgtacacaatcacaccttg agcctgttacaattctagctcttttactcctgaagattgttacttaataaagtatcttta gtgtcgtaatttgtttggttacatttgtaacgattctatcatttggtctgcacataatat cctgtgtggtttatagaggaaagtcgtggttctatcacctaggtaagtgagctgctctat acagcatatcttttatgatttgtgatcggagtcataatcctgttacccaggtaagtaatt agtctgcataaagcactttgtaaggtttgtagagagtcgtaattatataacttcggtaag tcttggtaggggaaagttctcacagagagttggaaataatctcaccatccgtgtaataaa ctttattccacagtcatgtgttgtgtctttatttgatccacgtttactttatggtgggga tcagtcaaggtattcactgtgtaaaccggtaagtgtctttataatgctcgttgcatgagg agtgataaatcacctggctattgcccaatacttcacccaatggtgcgatgtttctagata gtactcgtatatatcagatttatcaagcgccctgagatagggaattctctgataaatctg atatatgagtactatctagaaacatcgcac
Untranslated Region
Coding Sequence snoRNA |
|
exon position | 1001..1035, 1172..1220, 1820..1936, 4230..4332, 5587..5689 | |
CDS position | 1207..1220, 1820..1936, 4230..4332, 5587..5689 | |
accession no |