|
|
| Xenopus_tropicalis cct6a | ||
| organism | Xenopus_tropicalis | |
| locus name | cct6a | |
| chromosome ⁄ contig | 2 | |
| snoRNA list | SNORA15, SNORA15, SNORA22, SNORA22 | |
| snoRNA position | 4072..4210, 6676..6801, 8732..8863, 12422..12555 | |
| length | 14790 | |
| sequence |
ttttgccttttttgctttatctttagtgctttgttaacgatacaaacttcaacgataca
cgtgtcattttgtcttccagtttgtcaacaaaatgccaggaaattccttgtcatcatata tgctgagaatctctgcagcaaaaatactccattcacgcaatgcacaaaaagcgctttaag tgtaattttttttgtaattacaccgtttgagtatttctggtgtttgacacaccacaaaat gctatgtgttattgacctgaatgtaaaaagaaacatttacttactttactttacactcgc ccagcacctgatctgggaactggcacttatattgtagtgtcacccactgtgacctacagc acttatatttgcctatttgtgtctgtaagttacccctcccatatagattgtaagctctac ggggcagggacctccatcctcttaacttattgctgctgtatttattattatactttgtat ttatctattatcttattaacaccctgtttgtattaatgtattctactgtacagcgctgcg tacataagtagcgctttataaataaagatatacatacattattggtcattaacaaaagat aacaaatgcatccaaagtctgaatctggttgcgggtgacaccataatcaaactcaattgg ttcgattcagctgcaccatgtatacagtttctgactagtatattccagaaacaagatatt ttaaacatggaaatcagtttgcaatggagagtggcatggtacaaagaaaagcggccatgt aactcttacgccttgcaacccgggtaacgctaccgccacttcccttagacagtttgaact ctgtcaccgaaatcacgcgagaactcgacggatagtagcatgtcgaccaataagcttgta ggagtaggtgattgagccaataggggtctttgctgggcgttccgtgccgacagagcacgt tagattgttctggaatgccggccccttttcttctcgggagcggcgtggtggggaagcctg ggagccgctagctgattcattgtctcatttgcttcggattcgcttcccgagccggtctct acccccgtcactatggccgcagtcaaagccctcaatccgaaagccgaggtagcccgagcc caggcggccctggctgtgaacatcagtgcggcaagggggctccaggacgtgctccggacc aacctcgggcctaaaggcaccatgaaaatgtgagagacgcttgtcatggtgacacatggg ctgggaggattgtggggagttatagtgtgagagttgggtatggggcgatgctctctttta tggctgtgaaaaataaaaactttcagggatgcttttattttataatcagtaaatcacatt taggtctatcaacgggctttgggagggccgggcctcggctaataacgtttattgtcagat agtgttgtgtcggggtacattagaacgctataagtaaataaaactctatttctcccgtct gattatagcttcaaatcgtaattctaacccaggccagagtgcggtggctgcaccccggtt atggtgctttaagttactgaacttgaatattaaccctgtcatttttttctggcatacaat tgtgtattaaaggagaatgaaagttaaaatcacttgtgggggggttgcaaatgttaggca cccccccaatgattaagactggttacctgatacctcagactgatgctcctattagcagaa aatggcaccagccctgggtacaagcaggcgagcaatcctcttccttcttcttttgctgca atccatgcatgcgcagtagagttaaaaagcagactttttatattaaaattatagcataca tttttcactctactgtgcaagcgcagctggtgcgaagaaagaagactgaagaggatcgct cacctgcacgtaccctgggcttgtgcagttttttgctaataggagccccagcctggggta tcaggtaagtgataacaatcactggcacccccctagtcattcaacctttacccttcttta agtcctagatacgtatgctttccagtgattgccagttcccttaaaagtttccaaatattt tgcattttcattaaccctaatctaaaacatttagtataaagttacaatttctggatagtg cataaaaattttttctcaccagagcagtagtttgcaaaatttcctgtaaaatgatttaat acaattaatgtaaaattacactcaaatatatatatatataagaagaaggattctcagaat tctctctagttccagatttcttgtaatttcttgtaagtttacctgacaaaatgtgtaggt ttatgtcatcatcttaaaggaacagtaacaccaaaaaatgaaagtaaataaaagttacta aaatataatgtgctgctgccctgcactggtaaaagttgtgtgtttacttcagaaagtcta ctataatttatataaataagctgctatgtagccatggaggcagccattcaaaggagaaaa ggcacaggcacatagcagataacagataaaacactattgtattctacagaacttatctgt tatctgctatgtaacctgtgccttttctccttttttccagcttgaatggctgcccccatg gctacacagcagcttattatataaattatagtagtgttactgtagcaaacacaccagttt taccagtgcagggcaacagtgcattatatttttattactttaaagctctttcattttttg gtgttactgttcctttaatggacaggtcctcttactaacataaggactgtacatgggacc acagctatgaagattacttataactaatctgaaatcagagagaattctttgaggcttttt ttctgttttttttttttttagtgcaattttagattttattaaaaaaaaaaaacaaattga caatcacactataggttttcaagcctctaatttgtatgttttagatttctgaggaaatcc ctaggcagcagctaatttgtagttaaaaatctgattgtgacttgtgctacagtgtaaaag tgcaatcaaatctagcacagaaaatgacagtagtatgatgtgcgttttaatgccagccag gccagaatcggtatatagcaacctgctatgtgtagtgtggctgcactgaaaagtgttggt tgatgcagagatttctcaaacgtcttgtgggcacagagtttttagataaataaagcttat actgaaacaatatagagggctgctaaaccaataaatataacatttgccagggcatatttt ttacttagaattaatgcatcttttaatattcactgaatcttgtacttcatcattttataa tcatgtttcttaggaaaggctctgaatgcccttgtttgccttgtgtgccataagaggatt aatagaagagagttgagtgaaggaagctaaccagtggcaaaattaaagccaaggcaaact taaaaatgtatattttagatgtgtaagttattgagaccttgaaggaaagttaacctaagt ttaactttgtaacacctagtttaccactgccttaatcaggcagtctttagaatttcagat gttcagcaaattctggggcatcagtgtttgcctttggctaaacttcacctttaacggtta actggttatacacaaacatttaaaggttttaaatgattttagtctagctgagtctgggta gatgggttttcagttttctttaaggttgttcattattgtcatttccattccctgctttcc acaggcttgtttctggtgctggagacatcaagcttaccaaagatggcaatgtcttgcttc atgaaatggtgagtgtaccaaggaatgagttggtttgtgcattcagagactatcctgttt caactcaccgtaacttgatcttctggatcctccaagttttctttaccatttcaaaaactg tcagtcttttcataacatttatttttgtgttttcatactacaataatacaatataaaaag tgtggtaaagaattgatagctataatgaatcattttaatattaatcctggtggcatggat gaattctgctttagcttttgcagtagctattgcagtcagacaccatgctaaatggaattt catttgtactttttctttctgatgcaaccaaatcttactgggtgtcatcagagttacatc tgaatacagtttatacattctaagggttaggtaggtgccagttgttgtgtgtgtttaaat gcaacaaagaagttccagaatgctttgaaatgaaaaattatgcctattttggcctatgtt tagtgatgttcattaaaagaaatctgaaataaagaaagcagtgaaagtaagtgtcctaaa tatttcaactcctgtataaggcagagaaagcaagatctggttaactatatctcaaaaact aactcaaaaacatgctaaaaatctctgggtttggccagatatccctcggattgtacactt tctagacagggctctctgacattgtattgctgtttgcagatttatgttgtattgtggaca ttttaatgcattgctcattactgcaataaatgtttgtaaagtagttctgaatacaatact tatttactttttagcaaattcaacatccaacagcctcgctgattgctaaagtagccacag cacaagatgacattactggagatggaaccacatcaaatgttctgatcattggagagctgc tgaagcaagcagatctctacatctcagaggtatacattttgacataaatcatttttttat atatacattaaagcaaaattgggacttagtatgtggtagaatatcaataacttaaaatgc aatgggggagttaatatttgtttcttgcattattcctaaaagtgtaagaaaccaagcaag cacctttataatagcattccagtacatgtatgggatcccttaaaaatgtgatgttattgt ctttcagaaacctagcagatgtagtgtttttttatgccttgataaccagaaatgtattat ctttgtttggaactatcactgtttacaagacacagtaaggggtatatttatcatgcgctg taaaaaatggtttgaaacattactggtgatgacactttgctttggttttctaactgttga gatcttattgctgatacccctttgtctatacatttctgtttgttttataaggttcagtat ccttttaaaacatgcaatttttacacctgaaagctccaaattaagataattaacttctgt ttagatattaatattaagtattgaaatcttctaagtaggacaattatagaacggtaattt tgaatgtctggtttttatcactagggtctgcaccccagaatagtgactgaaggttttgaa gcagcaaaggtcaaagcacttgaagttttggagcaagtaaaagtgtccaaagaaatggac agggagactctgattaatgtggcaaggacttcacttcgcaccaaggttcatgctgaatta gccgacattttaactgaagtaagtagcttgatttatatgttgtggttttatcattgtctt gtgatatagccagcttagtagtaagtctggatctttattttttcccaaaataaagtttaa ttctaattactttcaggtatacaatacaaacattggttatttgtaaatgttaatgctatt gaaaggatctgtatcaccttgctgttttccttcaaactaggaatgtactgaatccagaat tcggacatttttcagcaggatttggattcgggtaaatcggtgtctggccgaactaaatcc atatcctaaaaatcatgtgacttttgatttcgtggacacataagtaaaattttaagtgcg cagttctgtttagcccttctgcaaattaggattcggtgaaggattcagggtttatccaaa ccccaaaataatggattcggtgcatccctatttcaaaccagactcaatttctcacagtgc cttgtacacttttttatttttttttctcttgtatgttggaaagctgataaaaattagatt ttcttagagcaggtttgtgggttaacaaccccttaattttgcagtagcaattggcacaca aaacatatatactacataactaaatggtgttttttttattaatgtggatttattattatg tctcaggctgttgtggattctgttttggctattcgacaaccaaatgagcctattgattta tacatggttgaaattatggagatgaaacacaaaacagaaagtgatactacgtgagtacca tcctttgtctttcagcagctgggtcttatcttgtgtaacagtactaaccttctgcagaaa tatttgtaaggtatattgtagcatgtacagtcttaagttttttgcttgtggtaatgtaaa aatgaatgatttacacaaggctttatgatgtaagctcttctgactatgcctatcctatct ttattccttatttgtaaagttattttaaagcactgcaaaatttacattgtgtaaagttgg tgacgagaagcaggtgtcatcattttgctacaagtgttttgttgaatttctgaaaaccgt agatatataactataacctatctctcttcatgaaactgcaaaaaaagttttcctaaaatg tctaaagactagctgtgcatggctgaattctgcttaatcgtgcagtggttcttgcagtca gacaccatgctaaagaaaatttcttggtgctgtttatggtggcatcttcatgttgtcttc cacagtccaacaaagtgtacacacttatttttgccttcatatttgccaactgctgcttta cccactcaattgcaacaaaccataacatttgcaatctgggcaacaagggggccagattgc agctctgggtctggaagctgtccctctgctctctagtcacttcaaccccatcctccccta caggccttcccatcagtgttccctctaattacttggctgtaggtgaaaaaaaattgtatt gtgcgcacttaaaaaaactgtgcacaggtccaaataagtacaaaatgatgtggtttcaca cagttctttgtgtgcgccacaatttccatcatttagataaagcagaactctatgtaaatc tgtagcaaattacataaaaagacttagtaggtgggaggaactttaatctttaataaatac tctttaataaatgcactttctagaatatatttctctaacaatagaagactctaaattagt ttatttttccaccgcaggctgataagagggcttgtcttggatcatggagctcgtcatcca gatatgaagaagcgtgttgaagatgcttttatcctcacttgcaatgtgtctctggaatat gaaaaaacgtatgtatgttctagccttgtgtgactgtcatgtcatattcctggcactgag agccaacaaggagcatgtacactgaaagccagcaacaaatgtgtgcatattcctgttatg tggtcagtgccaagccagtgtttaccctactgtaccttttctgcccatttagagggggag cagggtcgttttggggtaggaggagtaggctgaataggatccctgtacttgcaagatggg tttagttttcctggtttttttttttttttttgtttttttttgtttagtagtttcagcacc aaaacataggctaattgtgacatttttatattcaggttcatttcattcatcttccggtca gtcactatctgggttcaataagtacctccaaagaaaccagatagcagttttaatggctaa ttttagatttgtaaaaccaaaaatttactacattggaggagacttaaggcagtcccaaac ctttaaaccgtgctagcatcctcagggcttttgcttaccgtatatactcgagtataagcc gatccgaatataagccgaggtacctaattttacctaagaaacctggaaaaacttattgac tcgagtataagcctagggtgggaaatgcagccgctactgctaagtttcatcaaaataaat accaataaaattacattaaatgaggcatcagtggggtatatgtttttaaatatttatttc aaataaaaactgtaaactagctctgtaagtggagggtcaacaaaaacaattgttttatca acaatgataccttaagagtactcggcaaccaagctaaaacacaaagagttaaaatccttc aaaactatatatagtttatatagaatataaagtgaaatgtctagtgcagaatgggacagg tgaggatggtagatgaagataaatttggcagcgggccagggcactggggggtctggttgc gggtggcctaatttgcacacaaaggacagagggtgctagtttggagggacccatggcacc cgacttgagtataagccaagggtgactttttgagcacattttgggtgatgaaaaactagg cttatactcgagtatatacagtaattttattttggaatttgaagacaaatttttatcttg acaaaaaatgtaaatttttttcacagagaggtgaattctgggttcttctacaaaagtgca gatgaacgtgaaaaactggttaaagcagagagaaagtttattgaagaaagggtgaataaa atcatagccctaaagcagaaaatgtgtggagataccggcaaaggtttcattgtgataaat caaaaggtaaggttatcctgacaatatcttaaatgcacagagaacacccaagtgtgcttt ctagctcccttggccttaaaactgtgctaaatagatgtctgtcctttttcctctgcggta ggagattttattctcttgcacgtattcagaagcacagtacatttgatttatatattaatg tagatcgtgcagcaataattttgtttgcacatgtttaattcagggctacagcggatgttg cagtatcagttatatattttttttttttttatcaaatgttaagcacagctgctagcttgt attttaagctgtgtttgccttcagatacagatgcacttaacagacccaatatttgcaatt gtctctagtttggtgttttgtttcctccatttccagcattatttttggctgcagtccatt accaacaactgtccctgctagagtgttaattaaaattacacagcaaaattaaagcaacag tttaggctggaaagagggactactttgtaaaaggtttctattatggtgcatgaagttgag acaggcaaattgtgaaaatatatacagtggggtgctttggtttttttaggtttgttttcc tttccatcctgtctatggtttagacaggatatattgatcaataaatgcaatatatacatc tttcagattggcaggggtcatttctatccttttttttttttttttttctatgtgagcagc acataggtttaggggcggcatgcccccctgccgcaacggtatttttaaagtttgctccca tatgctcactgccgggggggggatcggttgtttgcgcatgcgcacagggggaggtggggg gcgaccaacagggacggcctcggggcgcccggatcacaaatctggcgctgcatgggaata aaggacagacttgttcagtgctgtgaaactctgcttaatgctcccaactcctgttgcagg acaatgtacagggagccagatttacacagatcagctggggttctcattggaggatttttg cattttaaagcagtcgctggctgtagagatgtggggataagttcagtaaaagttttattg cgcaatattgctttaagaatacaaccatgatgttgcattctgggatttgtagtccagcta caactgagtaaagtttagttgtgcagtgtagcagggtttacatcccctttaaatactgtg ctttaataagcaatattgcatatctacaaatctgtacatgctatatatctataggcaacc acaggtaatttgtagggtatatttgtctcctgtaatctgggtaaacttgtttttttcctc aatgctctggtccaggtttcatatgtgattttacatttatgctgcagaaaatatttgcaa aaaatggcatttagagcatatctgttttattttagggtattgacccattttccttggatg cccttgccaaagaaggaattgtggcacttcgtagagcaaagagaagaaatatggagaggt tagtagtcaaaatttgtttaatgcctaccttggtttgtatatttcatttttgtttgaaaa tataatacaatatataattttatgctgacaagataatccctttggcaaatacagcaaagt gaaaatctacggtagtagtaaactgcaaccccctttatatggaaaagtatagttgcaaac aaaaaacaagctccattgagccatcacccccagtttagtatttgctcagaaggtcttttg cctgcagcaatatgccatgtgaactgatatgttaaaattctgtatttttattggccataa ttttaaaatccgcaagccagtacatcaattaaatccaaaattgcataacatgtccaacag ttaaaggaaaactcgaccccctccccccctggccttcaagtggtgatttttagcaatagt caacttgtacccagccttaaccaatgcttttgatttggcttcaaagtggctactctagaa taatgaagtcagcatcatgtccttctctgcctacttgcaggctgccctcttggtgtactc ctggattctttacaggttttaaactatttactttcccaaccaaattaaaacagaaacctt taagagctttttcaactcttacttctaatgaatgaattatatttgttgtgagcagtagtg tagcttactgattgtagtcacaactgattttgcttaagatacatgttggggttcaggcag aacaagctctacattatctttaaccaaatatgctcatgtctagttgtgcttttattttgg gaatttaagaccagtgataatgactaaggcttggtcctttgtacagattgactttggctt gtggtggcaatgccatgaattctgtggatgacctcacacctgaatgcttaggacatgctg gtcttgtctatgaatacacactggtaggttttgatcatattgatgctttgatttaaaatc tgttaattagcattgcagtcatacacgccacactgtcggtgcaactgaccatgaggataa ggtcattataatttactgtttgtttatttcatcatgatattttttatttttctttctttt tagggggaagaaaaattcacttttatagaacagtgtgagaacccacggtctgtgacgcta ttaatcaaagggccaaataagcacacaataacacaaattaaagatgccataagggatgga cttcgtgctgtaaagaatgcaattgaagattgtaagttaattcatattatatttgggggt gggtgctaaaagcatgaaatatttattgtggctaataaatctggacaaataaaatgtaaa atagtgcattaaaaatatgaattgtcttctgaagcctcagtcaacattcttgattacctt ttaacatttttcttttaattttcttgaaaggttcagtggttccaggcgcaggggcactgg aagtagcaatcgctgatgctcttgtgaagcacaagcctaatgtaaaaggacgtgcccaac ttggtgttcaggcttttgctgatgcacttctcatcattcccaaggtagttataaccaatg aaagtaatgtagttggcagtagaggttcttgtttgccatgcctgcctttgaaacaataat tggctggtcttttttagcaggccaataagcttactccccaaaacaattaacaggtgagcc aagtctaaagcaggaaagcgatttagatgcaaggtaccttgctgtttttgccatgtctcc aattcctgcctagttccagtatagtgtcatggccagtttgcaaaccaatctttcctacaa tctcctttccaagataagtcttcatgttgatttgtcattctaatttgatttgtcattctg tatgccaaacaaaatctgttttaccaccatttatcagcattgtacaatagcatctctgca tgcagacttcacttcactgtaggagtacccagaagagcaaataattccttactgccattc aggaaaagggtgggagagacccagagagctcattcatttttacttaatctggtttttctc tacaatataaaggtgcttgcccaaaactctggttatgacccccaggagacacttgtaaaa cttcagacagaatatgcagattcaagccagctcattggtgttgatttaaacactggtatg tatattgtattgtctgtacaacaattctattttctttaaacaaaaatctgaatggatgct attggcatagagaacacccaagtgtgctttgtagctcccttggccttacatctgtgctaa attaatatatgtacttttacctctgcggtagaaggtggcttttccttctatatgtattca gaagtacagtacagtgttatctgattaacactcaagtttgattttcttgcctttttaata aacaggtgtgttctgtgtaaaatcattcaggggggctttataagtcaaggcaggaggaaa cctatggctaaaacatgatttcctcctagattattttgtgtaacagttgtatatttgtgt atgtttgcgttttgctaattagctgaccacgtggggtgaatagtgccatacctgacatag cacaaactgctggatatttatgcagtttgatcatacaggtagatggcaaaattgtactga actaacagattggcctactgcctcaattgtaggtcagcaaccccatatgctcccagattt ttagtcattatttaccttttcctttgttgctgatcagcagaaaatcagcagatctcatct gtgaaatattgttacatgtgacaaacattagagaacttgttcactgtgccgttacatgtt attccttctctcttttctgttttaatgttctcatcaattctgacactttttgcatttata ggtgaacctatgatttcatctgaggcaggaatttgggataactacagtgttaagaagcag ctgcttcattcctggtaatcacgttaccaatgcatttcttgatatttgagtttcacttga tacacacatgatagaacatgcttttatatgcttatcttttccccaatattatataagcaa catattgactaatgcatttttaaagttaaagttgtatattttacctttgcatagcaagta tatgcattctaaaatttccacttatttgatgacacatcataaaaaggaaaatctagcacc actacttattttccaattaactggttatttttgtgaaattggtgctcatgctaaatcttt cctatgcttttattttttagtactgtgattgcaagcaatatcctgttggtggatgagatt atgagagcgggaatgtcttctctgaaaggatgaatatagccttgttgtgacacttttctt atgattcagttaggaagtttattcaaatctgaaattatttgcgctttgctcccactgatt tgctgaagttacttaataaactttctgtaaaatctactcccacagctgtaaaacgatagc aaatattgaaaactttcaatgtttaacatttatttattcattttttatggcactgaaatg tacaagctgaacccctctgtctttgtacataattaaaaactttgctcttcacttgctctt cagatttttttctggaaacaatggttagtaattttaaagaatcttttaaataactttcaa aggcagtcattgattgatctatggcagcagtgaaaaccatgggcccatcaccaagtcaac aacttattttcttgtgtcaggttgccatagtaatgtagggaaactgcagtgccagaaaca cacattggtaacaggtacacctccaatcagaaatgtgtaactgcatatggagataagcaa gaccttgcttttaaaggaacagtaacaccaaaaaatgaaagtgtataaaagtaactaaaa tataatgtgctgctgccctgcactggtaaaagttgtgtgtttacttcagaaagtctacta taatttatataaataagctgctatgtagccatggaggcagccattcaaaggagaaaaggc acaggcacatagcagataacagataaaacactattgtattctacagaacttatctgttat ctgctatgtaacctgcgccttttctccttttttccagctttaatggctgcccccgtggct acacagcagcttattatataaattatagtagtgttactatagcaaacacaccagttttac cagtgcagggcaacagtgcattatatttttattactttaaagctctttcattttttggtg ttactgttcctttaacagctgaaggagctgccatttctgagaaacttcttacatatataa atatggtacatttctgtttgtttaaagatacttcctacaaaaatagaaatttgttgtcat gaattaaaataagatttaatattttaaccaaatccaaagataatgcccagacttattttt ggtcctgtccttaaaaaaaaaaaaaacatagaactggaagtaatctctctctgcaactag tatgaggaagcaattattccaggtgacttgacaggccattgttttggctattttgtacat aaagggttgtcacactgggaaagcttgtgca
Untranslated Region
Coding Sequence snoRNA |
|
| exon position | 1001..1228, 3784..3847, 4634..4768, 5364..5537, 6186..6289, 7277..7387, 8546..8705, 10115..10197, 11026..11122, 11283..11430, 11610..11743, 12252..12354, 13081..13153, 13460..13790 | |
| CDS position | 1092..1228, 3784..3847, 4634..4768, 5364..5537, 6186..6289, 7277..7387, 8546..8705, 10115..10197, 11026..11122, 11283..11430, 11610..11743, 12252..12354, 13081..13153, 13460..13532 | |
| accession no | ||