|
|
| Xenopus_tropicalis rpsa | ||
| organism | Xenopus_tropicalis | |
| locus name | rpsa | |
| chromosome ⁄ contig | 4 | |
| snoRNA list | SNORA62, SNORA62, SNORA62 | |
| snoRNA position | 2914..3066, 4763..4917, 6108..6260 | |
| length | 9767 | |
| sequence |
acatattatgtagcactgtacagtgaaagggtgtatacatcaaacatattgtttacaga
atcattatgcttctataaagcatggtcttttaaacctcggcttaaatatttgttgcttgg tctcagcttggtggctggtttctataaaccagttacatgacatatgctgcatctataaat ctgacaggcagcaacaaacaatacccagtgctgaaagttttaaagggaacttgtggttat gacattttggatatcaaggtctgtgcaacaaaaccagcatccacatatgtaaatagtatt acatttggtcaccagtaaatatcatgctataaaacaacaaactagtccctgactagcaac aggtaacaacttataaattgcaatgtaacccagctatgggagtgacgcagtgtgcccata gcctctgtgcaagcaagactagtaaattatggaagcgctatttctgttattagttacatt atatggcagtatctagcaatagattgttcaacttctgtataaattatgcttaatacaaaa aagtggcaatcctacctatttgtgttgttacagaaaaacaccctcaaacactaacatttt atataacgcctgtttataactccatgtgcgaagatccttgcctgtttcattgacaattat agttacctcagctgtttgagtatgtttattaagagcgttattagccagcgagaacactaa aataaataaagctccttcagttgagaccatgtactatccgcgcctatacaccaccagaac tacacctatgtgcctgactactaaggcttcacaggcggagtaccaatgtggccgactcac cccggaacttcctttcccagcactctgaatataccgccatgtaattggacgactgctgtc tcaaagctagcaaagtagtgtgtgatttgtcggctcagaactatttaatgacgtcacgag cgccgatacgttctcttttactccagctatagcaggaggatctccacacggctttgtctc ccgtgagtggcatatatagcggttgatcgtacagattattttgtgtagttctggcagtag aaatgagcgtaacattgtccgaaagtgtttatgggccggtttacagcgttaaagttgcga ggcctcggcgcctgtgtttgcgtagtctggacagacgtacatgtgcttgggctcgccttg ttgctgtggtagtgaccgccttaagttacacaatgaaagaagggtcctataaacagtagt ttagtcgttagaatgttgtacaagtcttgaagttctatttggttaaacgttttctattgc ctgatggctgtactatatgtgacccgaccaggcccgccctgtgattcaaaataggagatc ctgccatttcaagtacccagaggcccaaactgttccccaccagcccagtaagcagtgact atggcaccttacagcagcccttctggcatttgtcagaactcagactggcagtttgggcca gaacctgacgggacttgccttagtacatcatattaacaattggctttttattaagtttat gccagatatgttatatgtgcaagtagtattggttttattgtgcgttaataaaatacttgc atagtctgcagtgtatttcaattggagggaatgtgcaaccatacacttaggggtatattt atcatgctatgtaaaagtggagtgaagcattaccggtgatgttgcccagggcaaccaatt agattttaacagaaaaccaaagcatctgattggctgttatgagcgacatcgctggtggtt ttactctactttttccacagcatgataaatataccccttaggttgcatagaaatacttgc cagtacaggaggtgaagtctgctctgcccaacagaggttatggtttaaatatcttcaact tgttgttataagagatgggttttgcaggtttacacagcagcttgtaatctactgacagtc cccaactgctgaacgaccaggacagggacccactatgcactgaccaaacaggcttttctt tacccccagaaactaatcttttgaatcctataatgtatcctcataccttggagttatgtt attgcagttggctgacttagattttctctatttcaattacaccccttcggctccatcctg cttttaatactcttgacctcttactgttagcaagaagcattttattgcctgtattatata tattggaagaatggccagatgacatgattggaattgttcgaatgtaatcagttgtaatgt aatttattgtaagtctgttaatcagctggcttctgcattttcaggccacaagtgcagaga acataaactagacactagtttcacaactatacaaatgccttaaaaatattgcatgttaat tagttttaattggttccttttacattggaatcctgtagatctgctggtcttaatacaagc ttgggttttttgccttttgttataggttccccatcgtagctttaaaggggtaactcacaa tgtccggaggtcttgatgtcctgcagatgaaggaggaagatgtcctcaagttcctggcag cagggacccacttggggggcaccaatcttgacttccagatggagcagtatatctataaaa ggaagagtgatggtgagtatatgctatatttgacttgcttaaattaatttctaggatcta tacccactgatgcagtaaactataaaataaactagtccttgaattgttaggtgtaacaca agaaaatgcagctcatgccaatgcaagttaagactgatggatacagagtgttattacagt tgtgtgatcagagaatgatttgctgcttgtttacaatactcagcttttaggttagcctag gaaggatactgtacacagccttatttctataatcacagcacactgttaaagcttggagct gaggctgtccagccagtgaactctcaagtgtcggaagtgtgctaaaataacatggcaggt ctttcgctaacaccgtcagagcatcacgctcaatgatcggggtttgatagtagtctctgc cacaatgggaagcaataccttgctcatacttttgcacttactataatacatatttgctta ttgagtttacatagtttaatagaccttagtctcatcctggatgattgtgacttgggtgcc ttatggttttgggaacctctgctttgagggaatgtagtatgtggcgctaggggaagaaaa tattgttgcatttgcatattagaatttaggctttttctctttataatgaacttggtacat cctgtataccagtgctgtccaacttctgttgtaccgagggccggaatttttccgacctac atggaggagggccgataatggaagccagttttgaccactcccctttttaaaaccgcaccc acttgaaaccacacccatgttatcacatgaccatacccatattaatggttgtagtacagc aaaaacctgccacactctgccttccctaccatgcctgtgtgccatactctgccttcccta ccctgccttttttgtgtgccatactgccttccctaccctgcctgtgtgccatactctgcc tgccctaccctgcctgcgtgtgccatactttcactgtgtgtgccattcttggctggtttg tgccaaacttggcctgtgtgtgccatactctgcctgccctaccctgcctgtgtgccatac tctgccttccctaccctgcctgcgtgtgccatactttcattgtgtgtgccattcttggct agtttgtgccaaacttggcctgtgtgtgccatactctgcctgccctactctgcctgtgtg tgccatactctgccttccctaccctgcctgtgtgtgccatactctgcttgccctatgctg cctgtgtatatggcacacacaggcagcctacagtgacacaatgctggcactactcctaca gtctgcacaataactatattaaaaacgttttaattgcagtaccacctcagtatatgttct ttttgtagtgtgcagggtttatttgtgggtttctactgctcctgaggtgtgaacagggga acaatgggggtgattacagcctgagcctgaggtgtgaacactgcaggggttgaacaatgc aggtattaaaaggtgtgaaaaacacaggggattacatatttaaacaatacagcctgatta cagcctgaatctgaggtgagaaccatgcagggggggcagttaatcacagtactgatacca tttaaagcttacacaggagtaagccatcaaagcagccagacaggtggggggccacacaga ggggggtcgcgggccgccagttggacagcactgctgtataccatctgttggctgcccaga gtatgcattttgaaattggtttttataccttaggaatctacataattaacctgaaacgca cctgggaaaagcttttgcttgcagcacgtgccattgtagctattgagaatcctgctgatg tgtgtgtcatttcttcaaggaacactggccaggtatgcagttctttgcattggtgctgct tgtatagttagaaaattacttgcttagtagctgttttgtcatatatatcagaattaatct tgtactgttctacaatttacaagttatgcaaatttatattttgaattgtcctctaattga aaatacagctgcactgtcagtgttaagcattctccccctttagtgttttgtacagtggtg tatgcactactcttaattcctttattgcacactgttaaagctcagatgaagccatgctgg ctaatgaactcttgagtgtcggaagtgtgccatagcattattgtggcaagattttcgcta acaccgtcagagtccttggctcaatgatcggcgtttgatagtgatctctgctacagttta cttccaggtaaaactaggctgtgaatactaactgtcttttctccatagcgtgctgtactg aagtttgcttctgccagtggtgctacgcctattgctggtcgcttcacccctggtaccttc accaaccagatccaggctgcttttcgggaacctcggttgctagtggtgacagatccccgg gcagatcaccaaccccttactgaggcttcatatgtcaacattcccaccattgccttgtgt aatacagattcaccactgcgctatgtggatattgctatcccatgtaataacaaggtgagt aaacctaaaagcaacatcactttaaatgagatttctccagtgttaaacagcactagattt tttcctttaactaaaacatgtgtgaaattgctcagaatgctcttgagcattttggtaaat tgtttgcttagcaagttacttatctagatttacattttaaaacagacttattaacgagca tttttgcaggtaagtgtctggaaacacttctgcattagacatgtaactcttgctttttaa atctcattagcattataaagttgcaaatatcaagactaaaacatttattgcagtgggcaa atatttcccctttttttttaaaagggaatttatttctagaatccagtttattacattaaa gattccagttgcttgttatgctacatttataattgttatatttaacatagttaaacatat tcaacaaaatgattttggtctgcctgtctctagttggaaagcacattcagactgattttt gatttgtgctttgggaccccagaactacaaagctggcaccatagttctacttgttaatga tgacaatcaaatcattctgctgctagatttatttctatatactcagtccattcctatttt ttttagttcaaacaaactagataacattaaattcagaagtaggaggaggctgcagggcaa aattaaaaattgttttaaagtgttcattgtctactctacatcaagcttgttcagttggag acctgcaacacaggtttgtccctctaaagaattgctatagcacccaagcttcccggtgta ccactgaattttgtatggtataaatttctcttctggccacaatacagtatgactggcccg ctacaattttagaagtattctataactcgtgtagatacctgttttcgctttgcacacagt tagaacttagagctgaggccttctcggccaatgaactctgagtgtaggatgtgtgctaca gtaacatggcagacttttcgctaatgccacaaggtgctttaaagctccagtgactggttg taagtaattcctgccacagctatttacagtgcaactttctattacctttatcttctaatt ttcagagcagttgtaagtaaaatatggaggtatgtcaaaagtacattatcagaattcctt tttatgcatttaggtattctgacaagtgttaggggaccaactttttatgtttctctgtta tatgcttacacactgagcacttaaaaggaaagttacaatcactgggggtgccaaaatatt gggctccccccccagtgattgtaatcacttacctggcaggggggaccaaccccctgtgag atgggtctgtcaatctgctgccttgttttacattatttcaaaagtcagagccaccagggt agagaatagaaaaggacagacaaatgttgcttttaatagcaaatatacaaataacttatt aaattgttatttacattaaacattaaaaatgtatcttgcaaagttgtttagaattgtgtt attaggcaaaataattttttgggttgacttttttaaagatttagtcagtttgcaggctct tgtttttatggttacatcttctgaatgacttaagtttggcaagtgtctgctgttccatgt aatggcattattctggagcttggtacaaatgtgagctaaaaagcaacttacttataacca gctcgactgagcaccatatatttatttatttttaaacttagggtgctcattctgttggtc ttatgtggtggatgttggctcgtgaggttctgcgcatgagaggcacaatctctcgtgagc acccctgggaggtcatgcccgatctgtacttctaccgtgatccagaagaagtaagtggtt ttgtatattggtttcaactgcaggtaaaactgatgttttatcacaaacatctttaggaat tgatggcttctaatgcattcattgactgaaaggagaaggaaaggctaagtcacttggggg tgccaaaatgttaggcacccccaagtgacttaaatcgcctaccttttagcctgggctggt gcccctgttaggagaaaccagcaccagcccggggtacctgcagcgcttccttctggcttg cgcacgcatgtgcagtacagtagagtgaaaaagctgaacgtaaactataaagttggcttt tcactctactgcgcatgcgactgtccagggaattagcggcagaacgaagcaggaagcgct cgctacaggtaccccctgcttgtgctgtttctcttctctttgcagaaactggcagatgtt actcctcccaagtttatttgcaccattaaactcattagctgttttgcatcagggttttat tcacatgagttaggatacttcataaaataactttagagggttagtaagtttgtcccctag tcctgatttctagtccttaatgataaatttgccttattaatgactagctggtagtataag attctcccttcctctttccaacccctagattgagaaggaggaacaggcagctgcagagaa ggctaccaccaaagaagaataccaaggagaatggactgcacctgtggcagagttccctca ggctgaggttgctgactggtctgaaggtgtacaggtcccatctgttcccatccagcagtt tccagctggtaagatattactactttcaagaaattttcatactaaaattagcattgaagc aattctgtacagtagaataaatagcatttgagccctcaagccagatttcctaggttggta tagccgtaaatgttttgtaaaaactactactggattgtcttcagcaaacttttttttttt tttttttttcttattgaaactattttcacataagttatccataattctgttaatttttgg acagttactgagtaaatacatttgcaatagtaaaaaacaaacatactttagtagatgtga gcctaatacattttatctattacagaacgtccagaaattccagcagcaaaacctgcaggt aaacttgatttacatttaatgcagacttcttatctctgcttttggggttgtgaatggata ttcactttggtcatagattaacttaatttgtgatgtatccaagtgcagtgaacattactg caccctttgtatataatctggcgtctttcattgtaaagacaacagtcccataatttgcca acattatggccccataatagaacactctggtatatagcttttaatgccagtgtttattgg ctgtacattgctacatttttaattacacattttaaatttgctcagctatgaatatgccct gtctttactggtaaatccactttagatgttcttggtagcttttttaaaaaaaataaacta accagtgttattgtcattagctgaagactggagttcacagccagctagtactgatgactg gtctgctgcccctactgctcaagcatcagaatggactggaaccactactgagtggtctta agaacacatatgtcccaagtgtgtacggtcatgaaaagacggtgaaataaaatttcattt tcacttttcacttgtgcgtctgttaatttcttactggcacccatcagatgatgtaattaa acagattaaaagcattttaagagattttattatgtaatagacaaagttgctgccatgttt tcccctatacacaaactgtgctggagggaccagatataaatattctaccattgtagagtt ttgtaataaaagccactagtatgaggagtagtagaggaagaggaattaagatccacattt atacatttaatgtatataaaatgtatgaacatggctgaaatttgcagatagtagttagca aaacgccttggcactgttttgagagagtgcgggttccccaatggccacttcccattggta tatctaagcaaagacagtctgggacagcaccacttgtattccaaaaatgcccaaaaagat gtgtgcaataaaggcattttaaataagaatacaagtggtgctgttcaggactgtctttgc ttgaacatggctgaaagtcaagccaaaatgtcaacatttgcagaagttatttacacaacc atcttcacttgggatttggtaaattttactaaaagttcagaaattgtagccatcccctgc actgtcctaatcaatgggtgtatgggccacagttacttcactgcatgtttgtcatgtata atatgctatgcatttcgcaaaaccaccttaatactgcctatctgctttgggaagtatttt gctacacctccaagctttgcagtgaatgtctgaaatacagcagaaaattttgaccctctt gtgaatctgtacccattacattaatagatttgtgcaaatatacctgggctagtaaagccg agctgacttttggctccccactctctaccatggagttaaaaccctgcctatagcagtatt acttagcagagggagttgtaagctttggccactactgcacatgccccttcctgttaattg cagtagttagcactgctgctctttagctgtggggtgctaggttcaatt
Untranslated Region
Coding Sequence snoRNA |
|
| exon position | 1001..1021, 2485..2651, 4413..4531, 4968..5213, 6941..7069, 7708..7867, 8185..8217, 8600..8767 | |
| CDS position | 2519..2651, 4413..4531, 4968..5213, 6941..7069, 7708..7867, 8185..8217, 8600..8700 | |
| accession no | ||