Tetraodon_nigroviridis rpl4 | ||
organism | Tetraodon_nigroviridis | |
locus name | rpl4 | |
chromosome ⁄ contig | 13 | |
snoRNA list | SNORD16, SNORD16, SNORD18, SNORD18 | |
snoRNA position | 2054..2153, 2432..2531, 3215..3285, 3479..3546 | |
length | 4934 | |
sequence |
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tgcacagtgcatatttatcactggtatttggtcacccttcatttttaatatttgaatgtc ctcctaaacccaacagagaagacagtgacattattatagtacagattcgatggcagtgat gatgatcatttgttttaaatacaattacctcaagtataacgttacaaggattgctgcctt cctccccatcttgtaaagacctttagtgcaaagcatttgacaatagtaattaataacttt aacattatagtaaattgttactggttagcagacgacaagcgcataatcaacaacaaacat cgagatgatttaaaagttagccgagaaggctatgaggttaggagaagcaatcgtgaatca acttaccgtaaaagattgtaaaacgtcttggccctggatataactttagagcccattgag aaacgtcccacgttaaatctccttaacgcgaaaagatattatgggaaaatatataaatta tgtttgacgcacacatataatgtttaggctgctgctgtggttatttgacagtcgcgcgcc cagtgctgacgtcaaaaggtcatagttcaatcttttttataaaaactttacaaggcatgt ctataactgtaaatgtttttatatatgtatacaaagaaaagacatttttacaaaacaata tacatatttaaaaatatatatttagagaaaatcggtttttgatgtagtgccgtcatccgc caacatggcgtaaagaaatagttccatttacaacaaaaaacttttcatatttaaaaatcg taaaatgatctggaatcgcgtgttattatttttatacatgctttatattttttttcaagt ttgttattttacagtaggtaaaacataagtaggaaaacattgtaccgccggaaaaggtat tcgacctgcggaggcataaaccatttagggtgcttagctaacttcctttttactgtggcc gccatagcgagtggagcgtggtcccggcgagccgaaacataactaccgaaaatggtaaag atttttcctattattattatttacaacatacttaaatatatatgtagcaaggatttttat atatccttcacaactatgcaaggtttgtagtcttacgggcgcttaagaatgaattaggtg tagctgagggctggaactgccccggctagcgaagctaacacacggagccattttgaacga ggcgctttagacttacacgtgtcttaagattcagtgctaagtagtaaaaagtcatctttg gtgataccctcctatgcgctctttgtttgtgttataacacatgtatgagcctgccgttgc aatcacactagattaaagataacgtgacattttacctagcaaagctgtgcgtgttagcga agtcaagctaaggccagcagctgcagtcataagagctgtctgttacagtcgctttgaacg acaaaactgtgacaatctctttaattggaaatgcatttttgacgtggatttgtacctaaa tgataaggctaatgagttctctcatttgtttgTAGGCCTGTGCCCGACCCCTGATCTCGG TTTACACCGAGAAAGGAGAATCTACAGGCAAAAATGTTGTCATGCCCGCTGTATTCAAGG CCCCAATTCGCCCTGATGTTGTGAATTTTGTTCACACCAACATGCGCAAGAACAACCGCC AGCCTTATGCAGTCAGTGAACTGGCAGgtgagtccatccattcagacatttgtttgttag acgtaagtggcccatttcccccctcttcaaacaggttctcagatttgacggaggtgtata tttgtttcagGTCACCAGACCAGTGCAGAGTCTTGGGGTACCGGAAGAGCTGTTGCTCGT ATCCCTCGTGTTAGAGGTGGTGGTACTCATCGCTCTGGCCAGGGTGCTTTTGGAAATgta tccttttgacccagttcaaaattttaattccaacttgttgaagctatgctatttggatca atgcagtaaaaacttgcactgatggtgtaatttgcgtctgactctgtgaccggtgacagt tgcctgctgtcaatatgctggcacatacgactgacgagcaacagtgtctgagcaggtaca gtatatttcaggacctacacccacagcctggttggatctccttgacttcactctagATGT GTCGCGGAGGTCGCATGTTTGCCCCCACCAAAACCTGGCGCCGCTGGCACCGCAGGATCA ACACGACCCAGAAACGCTATGCCATCTGCTCTGCTGTGGCTGCGTCTGCCATTCCTGCTC TTGTGATGTCTAAGGgtaagctctcagtttgcgaggcgttacgagatgtatgtaattaaa ggtctttatagcaagccttttaccgtgtagcctgccatgatggtgtaatttgcgtctgat cctgtgaacgctgacagttgcctgctgtctctatgctgtcataggtagttgatgtatgct aaggtctgagcaagcattagtgcttgtctttaaaaagtttgaaggtgtgcatgtgttgac caatactttgaatatatttgttttagGGCACCGCATTGAAGAAATCCCAGAGGTTCCACT GGTGGTTGAAGACAAAGTTGAGGGCTACAAGAAGACTAAGGAGGCTGTTCTGCTGCTGAA AAAGCTCAAAGCCTGGAATGACATTAAGAAGgtacggtggctactcattatgattgctgt tagtgtgctgataagtgtattaaagtgagttgtgggtttagGTCTACGCCTCTCAGCGCA TGCGTGCTGGTAAGGGTAAAATGAGGAATCGCAGACGCATCCAACGCAGAGGACCGTGTA TCATCTACAACCAGGACGCCGGTGTCACCAAAGCCTTCAGAAATATCCCAGgtgacctaa atccgtcgatgtgaaagattcttttaagacaggaactaaagccttaacctttttgttttg ctctattttgaagGCATCACTCTACAGAACGTGAACAAAATGAATCTGCTGAGACTTGCT TCCTGGTGGCCATGTTGGACGCTTCTGCATCTGGACAGAGAGTGCCTTCCGTAAGCTGGA CGATATTTACGGCACCTGGCGTAAACCTTCTACCCAGAAGGTTGACTACAAgtaggtgta gaaatttaacatcaacaccagtctaaatcttctgatttcagtgatgatcttctacttcag gtccgtgtttttgaaacagtgtgatattcatcgaagttctgagttctgagtcaaacaatc ttcagtgtttaccagtagttttcccttgagttgaagttttggtttgtcttttccagCCTT CCCATGCACAAGATGACCAACACTGACCTGAGCAGGATCCTGAAGAGCGAGGAGATCCAG AAAGCACTTCGTCCACCAAAgtaagtaccactgaagcttcaaagtgtgtttcaacctgtc gcctatgatgatgttccacttctggtccgtgtttctgagtcctgattgttacggaagttc tgagcaacactttctttaagcttgtccacctcggtgttagttcacgataataaacccagc tgatgctgtcgttgcagCAAGAAGATCAAGCGCAGAGTACTGAAGAAGAACCCTCTGAAG AATTTGAGGATAATGCTCAAACTGAACCCCTATGCCAAGACAGCGAGACGCCATGCCATC CTCAAGCATAACCCTGAAgtaagagcagcttgaacgggaccttaaagcatcattggcctt gattgcaacttaaaatatgtcttctctccacagATCAAGGCTAAGATGCTGAAGCCCAAG AAGAAGCCTAGAAAGAAGGCAGCACCAGCTGAAACCAAGGCATAAaagtactcaacaggg gttccctgctaaataaatcatttgacttgcataattgagtcacacctcttttattaaaca tttctgattacacatagatggcaccgggattctgggtacattttaggcacacagagctga gtttaatcagacgagtacagcctaacctgaatggagcaaaacgcagaagcagagtcgtac ctacagacagcagtccctgaagcaaatcggggacccttccatgcctcaggacaatagcaa aatacagtttcagaaacctcccataggaccagaacaaccaaagcaaaaaatccaggaggg aaataacagaaaatacaaacttggcttgttccaattacacaacagtatatatatatcata tttttcacactggttaaaatctcacatctggacaacgagtgatttccaactcctgaagca cacgagcagcgcagcttctaagtgattgcatcgttagaaaaacatggcttttcaagcagg cctgaggcttaacggcagtagaaagtcccgtagggcttcatcacaattgaaaactgaagc tttaggaccgtctaaccgttttccgcgtaatgtaattgcagtgatgaccgatagcccgga ggttcgttagcctcacatcgctgtcccatgggtgggcgtcccaggctgattgaggccgat ggtgctgcacaaccagccggcaaaatccacctgctctgcctcggaccgtttgatgaaggg atgcacctgaggaaacagacgtgtgtgatattaaaaagagctgatcaaacggcagagcgc gcacacctaccatcagctgcttcaggtccgctctctctgctgggttcttgatcaagctgc agaggaggcacagagcgatgcggtctaaggccactaggtggcagagtttcaccattgacg agttgggatttctcccacttaccatttattcacaaagtcttgaaattcagcgctaaatat tgcaggcagcttgggcggaggctgaaaatgtacagaaaaactggtttaagttgtttcttt ttgtttgtgtgacag
Untranslated Region
Coding Sequence snoRNA |
|
exon position | 1001..1073, 1595..1766, 1870..1976, 2216..2354, 2606..2730, 2801..2930, 3013..3170, 3356..3439, 3617..3737, 3813..3934 | |
CDS position | 1071..1073, 1595..1766, 1870..1976, 2216..2354, 2606..2730, 2801..2930, 3013..3170, 3356..3439, 3617..3737, 3813..3884 | |
accession no |