Pongo_pygmaeus MPCP_PONPY | ||
organism | Pongo_pygmaeus | |
locus name | MPCP_PONPY | |
chromosome ⁄ contig | 12 | |
snoRNA list | SNORA53 | |
snoRNA position | 6831..7077 | |
length | 9790 | |
sequence |
AAATGGTATTTATCACACACCACGCACCAATCCTGCCTATCAGTCACTTTCAGTAGTTC
ATCGCCGTAACATCTCAGGTGTTCAATGTTTCAACGTGTTCTGTAGATTATTGTGATAAC GCGGCAAGCTGTCTTAAGACCTCTTGCTGCACATTTCTTTTTAAAATATTCTCCAGGAGT CTGATGAAAAATACAGACAACTTATGTTTAATGTCAATGGATGGAACTTATTTTAAAAAG TACTGTAATGGCAGAAGTTGTGACACAAAGTACTGCAGTGATGTTCTAACTCCAACACCN TAAATATATTATCAAGCATTCGTGTTTGTTTTGTTTTTTAAGTGACTACTAGATACTGTG ATTCACTTAAGTGAAGCGAACTGAAGCCCGTGGTCAAGGAGAGACACCTGAAAGTGAAGG GACAAAGCGAGCAGGATAAGAGCCCGAGCCCAGCCCCTCTCAAAAAATACAGACCCGGAA CACGCGCCTGCGCAGAACGATTTCTCCTGCGCACAAGCCGGGCGGAAGAGCTGGGGCGGG CAGGGGCGGGAATAAGGTTGCTAGGAGAACGCGATGACGCTCGGGCTCGGCGCTCTTCTC CACCAATGGGCGACGCGTACTTGCAGTGACGCGCTGTTTGCGTCACGCCCGACGACGCGC GAAGGGCACACATTTTAGGGGCCGGAAGGACGTTCGGGCCTCTGTGAGCCGCAGCCCTTT CCAAGGGAGTGGTTTGTGTGGTTCGCCATCTTAGGGAGTGAGTGTGGCCGGGCCTTCCCC TGTGGCGGGTGTGGGGAGCGGAGCCCAGAGCCCCTGTGGGGCCGCTGCTTTGGCGGTGGG CCCAGCCGGGAGCAGCGTCTTTCGAAGGCCGCCGTGACCTCTTCAAGGGCGTGGAGGCGG GAAAGGAAAAGGGCCCCGGTTTGGGGGTTCCAGGGGCGCCGGTAACATTAACCGGCCGCT TCGCCTGTCCTCTAACCGTCGCTCCCTCTTCCCCTAGAAAGATTGTTCTCGTCCGTGGCG 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GCTTGTTAGTATCCTTGTGATCTATTCATAGTTAAGAATTTCCATGACCACAACATGCTT CCTTAGATCCACCTTTGTGGATGAATCTTGAACTGAGTTCCACTTGTAAACTTCTTGTTT CTTGTGGTTCCAGTCAAAGAAACATCCAGCAACTTTTTTGGTTGTATAGTCAAAGGTGCA TGAGTCATTGGCATGTAAGAGAAATATACCTGCATGTTAGTCTAACGTTCTGATAGAAAT GACATGCATTTATGCTGCCCATTTGTTACTATCAGGACTCGACTCGTGTGCGGGACATTT CTGTTAATAATGACCAGTCTCTGATAGNATGAAGTACATGCAACTGTGTAAAAACAAGTC TTCTTTCGTTTTATAGGATTTCTACAAAGGGGGTTGCTCCTCTCTGGATGAAGACAGATA CCCATACACCATGATGAAGTTCGCCTGCTTTTGAACGTACTGTTGAAGCACTGTACAAGT TTGTGGTTCCTAAGCCCCGCAGTGAATGTTCAAAGCCAGAAGCAGCTGGTTGTAACATTT GTAGCAGGTTACATAGGATATGAATTACTTAGAACACACTTGTCTGAAATTATGTAACAA ATAATCATTCCTTTATTGGCGTTTTTTGAGAGGGAAAAATATTCCAAAGGTCATAAAGCA GTGTTTTTGTTTTTTTTGGTTTCCCTGAGGCATAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAG TGCAGTGGCGTGACAATAGCTCACTGCAACCTCCTCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTTCT GCCGCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACAGGCATGCACCGCCATGCCCGGCTTATTTTTGTT TTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTTACCCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGC AATGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCC 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TGACTCCGTGAAGGTCTACTTCAGGCTCCCTCGCCCTCCTCCACCCGAGATGCCAGAGTC TCTGAAGAAGAAGCTTGGGTTAACTCAGTAGATGGATCAAAGCAAATGTGGACTGAATCT CGCTTGTTGATCAGTGTTGAAGAAAGTGCAAAAGGAACTTTTATATATTTGACAGTGTAG GAAATTGTCTATTCCTGATATAATTACTGTAGTACTCTTGCTTAAGGCAAGAGTTCCAAA TTTACTGTTGAAATAAACCTAACTCTTCATGATTTGCCTGTGACTTATTTTAAAAACTTC TTAAAAAAAGATTTAGCTTTAAAATAGTTGGAAAGAATGAAGTATAAGTTAAGGAAAAAA ATACAAAACTGAACCATTGTTGGTTGAATATTCCAGTTGCTATTCAGAAATTGTCATATG TCTCAAGTTTTATCAACACAAAGTTCCTGTATTTCTAGGGAAGCAGACTTTAAATATTCC ATAAAAACTTGATTTAATTATAGTTAAATATGTGTAGTCATTTGTGGTTATTTTGGCAAG TAAATGTTAGTGTATACTTTGATTTTTGCAGCATGTCCTACACTGTTTTTATGTTGGTGA GTTTGCTAATCCTTATTTGTAAGACACCAAGGTAACCCAAATTAGGCTGATTCTTAGAAT GATAGTAATAAGGACCAAAGTGATTGACAGCTGAAAACAATTTTCAGGTACACTAATTCT CTTTACACAGATCTCACTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCGACTG GAGTGCAGTGTCGCGATCTTGCCTCATTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTGT TCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTCTCAGGCATGCGCCACCACGCCCAGCTAAT TTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCCCTGTGTTGGTCAGGCAGGTCTCGCAACTTCC AACCTGCAGGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCC ACTGCACCCGGCTCTGACTTTTTAAATTACAGAAAATTAAACTATTTTCAGTCTGGTATT TTAAGAAAGGT
Untranslated Region
Coding Sequence snoRNA |
|
exon position | 1001..1002, 1004..1024, 1026..1148, 1150..1155, 1157..1161, 2807..2825, 2827..2833, 2835..2841, 2843..2921, 2923..2932, 4965..4974, 4976..4988, 4990..4998, 5000..5005, 5007..5029, 5032..5039, 5042..5053, 5056..5062, 5064..5067, 5069..5074, 5076..5081, 5083..5085, 5087..5090, 5092..5094, 5096..5102, 5105..5108, 5110..5118, 5120..5127, 5129..5162, 5164..5167, 5683..5747, 5749..5766, 5768..5771, 5773..5841, 5843..5871, 7156..7156, 7159..7166, 7168..7190, 7192..7201, 7203..7230, 7232..7299, 7301..7335, 8414..8426, 8428..8439, 8441..8448, 8450..8456, 8461..8464, 8472..8489, 8491..8511, 8513..8517, 8520..8526, 8528..8543, 8630..8790 | |
CDS position | 1001..1002, 1004..1024, 1026..1148, 1150..1155, 1157..1161, 2807..2825, 2827..2833, 2835..2841, 2843..2921, 2923..2932, 4965..4974, 4976..4988, 4990..4998, 5000..5005, 5007..5029, 5032..5039, 5042..5053, 5056..5062, 5064..5067, 5069..5074, 5076..5081, 5083..5085, 5087..5090, 5092..5094, 5096..5102, 5105..5108, 5110..5118, 5120..5127, 5129..5162, 5164..5167, 5683..5747, 5749..5766, 5768..5771, 5773..5841, 5843..5871, 7156..7156, 7159..7166, 7168..7190, 7192..7201, 7203..7230, 7232..7299, 7301..7335, 8414..8426, 8428..8439, 8441..8448, 8450..8456, 8461..8464, 8472..8489, 8491..8511, 8513..8517, 8520..8526, 8528..8543, 8630..8787 | |
accession no |