|
|
| Oryza_sativa LOC4345234 | ||
| organism | Oryza_sativa | |
| locus name | LOC4345234 | |
| chromosome ⁄ contig | 8 | |
| snoRNA list | U54, U54, U54 | |
| snoRNA position | 6070..6149, 6504..6576, 6964..7043 | |
| length | 8903 | |
| sequence |
cgctcgtcgacgtcgtgcggtggcgttcgacgtgtggcgtcccacttggcggcgatgga
gacggcgtaggagacgagcgggaggaagagcataatatactatactagaagtatatgagt cgatgtgcttgccctggttcatggcgacgaacaccttgttcacgtcctcaccgggcgacc gcgtcgatcttcttcccggtcaagtactctgtcctgagctccttgcagacgaaccggtag agcgagtacgacttgcactcggtgatcctgttcgcctttgcggcggtgccgttctccacg gccgcacgggtagcctccacctccctgggcagcgccgcgcggagcttctcctcgaacatt gcgaccttggcgaacactgaggtgttgacgttgcgctccgcctcgctgttggccagcgcg tgctcgatgaggacggtgcgcatcttctgcatcagcgtacgcgaacgggctctcgccgtg cggtggcgttcgtgctcgacggcctcctcggcgaggaggagcgggacgctcgtcgacgtc gtgcggtggcattcgacgcgtggcgtcccacttggcggcgtaggagacgagcgggaggaa gagcttggaggccgcccagacgaagaggcggagcgccgagtggccggagcggctgcggta ggagctgagcatgacgaggagggcgagtgagagagagaagaggaagggagagaagagggg aaagaaagaggaggctaacatgtggggcccacgtgagtcccacgcttactcaacagccac ataggataaaactaggatcaaaaccgccgaggaacctattgtgaccggtatagttaaggg acctcgcatatctggttttgcgatttgaggatgtttgtttattccgatgacaagttgagg gaccttcggtgtacattttcctttcactttttccttgtcccaaccgactcacgaagttat tggaccaggcgagcccagcaactccgctattatgcctaccgtcccgcgcgctctaccctg ccagcacaaaatccccaatccacccgcgagctagggtttttccgcgccgccgcaccccac tcgacccagatcccccaacctcctcttcctaaccctaccacccttcctccccggcggcgg cgagaagcagtagcccgacagcgaagatgaggccgatcctgatgaaggggcacgagcgcc cgctcacgttcctccggtacaaccgcgacggggacctcctcttctcctgcgccaaggacc acacccccaacgtctggttcgccgacaacggcgaccgcctcggcacctaccgcggccaca acggcgccgtctggtcctgcgacgtctcccgcgactccacccgcctcatcaccggcagcg ccgaccagaccgccaagctctgggacgtgcagaccgggagggagctcttcaccttccgct tcgacgcccccgcccgctccgttgaatttgccattggcgacggcctcgccgtcatcacca ccgacaacttcatggagaacgtgcccaccgcccaggtcaagcgcatcgccgaggaccccg atgaccgtaagacgcgtctccggtctccttctagttggaagcttctggatgtgttctaaa gtgtgtggttgtggatgcagagtcggaggagtctcttctcgtgattactggcatcaaggg gaggatcaacagggccgtgtgggggccgttgaacaggactatcatcaccgccggtgagga tgctaccatccgcatttgggacacagaggttagctcggattacctatttgcactagttct accgaccattggtgctacttctactcatcactagtactaggtgcttggtgctcgtcagga atataccatttgcttataattatggacatgtttgcttataattatgaacacgtagttctc ttgtataggatcatttgacgtacctggactgacaagtgaagtttgatagttaaatatgtt gccggatatgattgaaaaatcactgataagcatgtgtgattgtcacagtttgttattgat ggcaacattatgcattaacaagacaaatgttaactcgttgaaccggcgataaataccttg caggcttctcgatttaaattgactctgggaatatatataggcaatggcaaaatggtgttt tgtgttgtttgcacactaaccgaaaacatgctacatttaatgcataaatgcataacgtat actttccaggttatatgttgccatttgaccttgtattatattatacatgcaagctatcta actgtgggggaatgtacatgcttctcggtcaactttatcatggtaatgttttacattctg tttggttttggcatgtacagactggacaatgtctgaaggagtcagacaaagagcaaggac atcagaaaacaattacttcactttcaaaatctgcagattggtcgcatttcctaacaggct ccttggataagtctgctaaggtgatattttgttgaagctgctagcataatcatgtcttca attgtttgtactttgtacttcaaatatgattatttactgacatgcacattgctatctgga tagctatgggatacaagaactctgacgctgatcaagacatatgtcactgagcgacctgtt aatgctgttgacatttctcctcttcttgaccatgtatgtgcctatgtcacaatacgtaat attcttctataggtgcaattcttttataatcacgttacatatggtcatgccttaagttac ttggttttatgtcttgctaattggatgtgttcccaatatgttattgtttggatagaaatg cctatggcctccatttctttattttgctttgaagaaaacttctttatttgttgaagttgg atattacttcattttttcgatgattttggctgtcacaatttttttcttagttttgagtcg ttttctttctatgattagtttactataagacagtagagcaacaaatgatccattcacata cttattatctgcaattagtacttctacatgtatagataacaatgaatatacagcgggaag tgcaaagcacctatgtactgtccagcacatcttttgaccctggatttaccccaattctat ataatttatttgagtaatgttggctgtcatggatttgtatttgtactaacactggaaaaa tgtctaattggccacatctgtattgttcacctgtaatttattactgtaacgagtagtcag tcttgttctcactagtaatatgcccatgctaatgctacggaaccattatatttttgaaaa aaactatgaaaattgtcatgttagtgaaaacaatgttcatatgtccaattgagattttaa ttcgatttaagttgtatatgaaatatatttaacgcaaagagcagtaattatattgcctga agataatgattcatgaccatcgataattatatagaatcgcgtcaatatacattatacgag ggcaatatatatgcacaataaaaagaatggtgggaagttattccattaattcgttccaag tccaaaaataaagcatttgatacaatatagaatataacctacaactaattaactaatcct aactttgaatatttggtattgacttagaaattcttaggttctctatcaaggggtgcaagt tggctggcccactaacccacttatagtaactgagtaacctggcgggttacccacttgttt gtactattagtgggtttgcgggccggcccacttgcacccttaatttctaataatacctat tataggctggggaaatcctaataacacctttaagttggaggttgggatgcttgggtgtga ggaaggcaggtcacatgctgtcaggaatcaggaacttcagtccatgggaaccattagtgc gtccatcttaatggttcaccaaaaataagctttattagccatcacgaaggtgtaaaataa aatctttttacttcatctaccaaaagcagtggatggcagaaacatcaaccttcggtcagt tcatgcatcttgaaaaatataaggcttgatgacattttatatgcacggataatttaacct gccattaatcattatcttggccctagcttatttgtattccacaaatttctgaagcagaag aagcatctctgcatatttatcctcatagttctgaatacacataggtaaaagagaaatgca ttcttcagtcttggtgagacaaaatgaacagttaagaagattaggttcctttactatgga cttaaccaaaacacaatttattactacacagctttagtaccgctaatatcatcaatccat tttgtctattatctttgctgttacagcattgctgcaaattactcatcagttgtgacaaga aaagctgtattttctttgagtgatggcagtttaaatttataggaacatgagcatgccatt ctcaagtaagatatcatctacaatgtacaggagactggtcatatgcacattatctttttg tcagtagtacctttctggctttctcccaaaattcatggcagaaccagagtaggacaatga taattataaaaattataccttcattggattgacttatagcacatacaaatagaaaggtta ggcactgcaatttagtagtatttaactgttgatctagaaagcaatggggaaacgatatag ctagataagggtcagggttgccatggaggtgatgccatggtgcccaattctggatgtttc aacctttgaataggagaatctagttttcccaaataaatcttaaacctaataacaaactgc agccatgtcatatcggaccaacatcagtgagctcaataacaaaatgtggcgactcgtgga tgccacagaggatcgttgccggcatggttttggacgatgggggagctatgccagtagtga tcttgaatgtcgggacctggcagcagccgcggcagagtgagagagtaagaggcggcacta cggatcggggtcggcggtggttgttgaggcgtcgatgcagggttgacatctggtctccga tcggcggcaccccgcgtctgtgcaaccggattcggcgacggtgatgggatataggatatt agggtttggcggagaaggcgtgatttgggggagaagtggggctgccggggctgggggggt gaagtgatagaggattatcgggtgcgggggaattgataggtgtggccatgtggtggtggg gggcaccggtgcgggtgagtgaggggtacgatctaggctgttgaataatagtattgataa atattagctgttgcatttgtaagatgtaagaaatgtgagtctaaaaatgagggatgagta aaatgagttgttgaattgtagggtaggctcgtatttcaactactaaccataagggcatca ccaatgtatatggcaaaagtgatccatatagatggggcccacataaagagactttaacta tagcaaccttcacaatgtatatatatatagcaaatagtattaggaggagagaagaagtag agacaaataatatattttattctctatgggtagcccatatgcttatgggtagcttttgtt atttctttgctatggactagttccacaatgttgctaggtagttgaatgaaatattatatt gcttatggaccacttttggactacattgtggatgccctaagaaatcttgttgtgttaggt ggttattggaggtggtcaagatgcgatgaatgtgactatgacagatcgtcgtgcaggaaa atttgaagcgaaattttttcacaaggtcagttcttcgcacatagtttccatcttatgttt tagtgagaacaatgatcgtgtggttatcttttcaaagttatattttgctgttcaagaatg agagttctatatttttctttagattttgcaagaggaaattggtggtgttaaaggccattt tggaccaattaacgcgctggcatttaatcctgatgggcggaggtaatattcttaatacat gtatttgtatttacgttctgcccctgcacttatgttcttgattagctttttcccatattt gtgtgctttttgctcaatgattaacccatgcaccatggcaatacacgctattctgaatca tattaagatgccataaacattatgagagcagattctattttgtattttatctgaccatgt agatttttaatacattcttgtggttctagtggttattatgttcccatgggcatctctcct tttacttgaagctcttacttttgtattgttgtacaacaactcatcattcacctttgccat tttaatccaccacctctctagttttgtcccttaaattgattcattggtcatgtttgccat agttgttctctattgaattcttatgctgctgtttgtacatatgagaaccatgccatgtcc aatatttaatttgataacctgttagtgcacaattgagttgcattcttagatgtttgaagt gttgtttatgtctaatgattttgaagctcaatgcaatcaagttggttttatacgctattc tgattggagtgtttttttattaggacttatgagagctatctttcctcccaacatcggatt aattaattatttgccacttttacggatggtgataaatgatttgccattggacccacatgt catagacacatgagggcccacatgtcatagacagcgagtggcaaataattaattgccaca tcttaaaagtggcctagagttaaatgtcccaggtgtttttgtattgattcaatgtatgtg caggagtcttcattactattccaatgcatttttcattgggagccactattactgtatctg aaaattgtatagtatttcagcataaaagaagtttaaaaaattgtaaattagatttgacga tatctcagtgggggcaccgctggccttctaatgattgctgtatactttgattttatctca gggtggctcaatgattgttgccaatcacatttggtcatatatgctattctgatttctatt ggtgaaaacgaatttatgagagctgctttatgtgatgactagttctcttcaagcatgttt tttttctctcatgtgatggttaattaaagtgtttttgctttgagcttcagttattcatat ctatgatgcgatgttaaacagcttttcgagtggtggtgaagatggatatgtaaggctgca ccattttgattctgactacttcaacatcaagatttaaacctagaagttctgaaactctga ggtaaaatgcccttcggcagcaaagctaatacactgcatcttactgagttcttttttttt tttcttttgcaactagtgaagtttccatttgcaattatttgtgatatactccgtattaga cagtgtaccgttgggcgttggcctaaccagcttttcttgaacttgtctccaggctgcact tgagaaaggccaaaggtataccttctggttgggcattgttgtttaatctccatcaatctc cgtcgtgtggagagtctcaggtgcagtgtttagcaactgatggagtacttgtcggacttt cttgttgcactggacatccagctttatagatgcttgagagattttgtacattcagcaatc gaaggctccttatactgcaaaactagcttaatttgcttttcatcattcttggttcacttc ttccatatatcaagttttgggcagatgatttgtctatacgatgttgtgtttcggttcacg ttctaatcatgtgcatatgcttcacttgggtgaattgtaagatgtctcatcgcatagcaa tttcatgacttgaagcatgcacggtgaagtgctggcactctcaactgtgtcaagtttact agcataatcctttaataatctacgggagcagaattctaacttaatatcagtgtaatacta agaaagaggaaagaaacaaatcagaacaacttggttttgtatttgccattgtctactacc cctgtttcatattataatcataatgttttgacatttttctagttaaacttttaaccaatt tttatagaaaaatatatattatcaaaatatattaactatttgttttaataaaactaattt ggtgttgtaaatattgctattttttagaaacatagttaaccttaaaaaagactgattaca gaaaaaaagtataaaaaagacttataatataaaatggataaaaaagtttgattagaaaaa aaagtaaaaaagacttataaaatgaaatggatgaagtattaatgtagaaatgatgacggt aacaaactgagggcatgatcaatgcaccacgctatctgttgatattgatcatgtcctcat gctggctattgatatttcttaacgacattactataaacgattctaaagttgctagaaata ttaaacgttaatcttataggttatagaagtaaatccgcaaacggtaatcttatgggtttt aataaaactaatttggtgttgtaaacagctttccaaggtattgtaaacttcattctaatt tgtttatttatagaaataaatcaacaagcacccggaagtatttccaaggtatcgtattat ttaatcctaagagaagatatggtaaaaaaatattatggtataaattcttatcacacttat atgaatcaaagtcttatacatacgttaatcaattcaggttaaggataggtttgacacaag taatagtttagaattctctcactaaattataagtctagcgacatattactacagcctttc tcatgcttcaggaatgatctcatttctcgtctgctggaaactggatattcttctacaaag agcatttgttttgcccatcggaaagaaattggagaggatcgcagttgagcacttattcca ggagtccgattgatgcacggttcc
Untranslated Region
Coding Sequence snoRNA |
|
| exon position | 1001..1565, 1640..1767, 2360..2479, 2583..2672, 5698..5784, 5902..5981, 6563..7027 | |
| CDS position | 1166..1565, 1640..1767, 2360..2479, 2583..2672, 5698..5784, 5902..5981, 6563..6605 | |
| accession no | NC_029263.1 | |