|
|
| Mus_musculus Rps3a | ||
| organism | Mus_musculus | |
| locus name | Rps3a | |
| chromosome ⁄ contig | 3 | |
| snoRNA list | SNORD73, SNORD73 | |
| snoRNA position | 2896..2966, 4726..4793 | |
| length | 6633 | |
| sequence |
aaacaaaaccaaccaaccaaaaacccagggctgtcgagatggctcagctggtaaaggca
cctgcagagacctctcaggcagtgaggaggcagggcacattgtatggcagcgctgcgggc cagtgtgcgcaggatggcagcctctccctgagccttatacccacatagtggaagaagaga accaactcttgagaataggtctctgacctccacacagagacctgtgaggcacaggaccac acacatagtcatacaaaaaaaaaatgtgattacaaatgtgtaagagttacatatgtatat atgtgtgtgtgtgtatatatatattctctcctctccccttcccagtctgtcttgctaggt agttcaggctagtactcaccatatactccaggctctcctccaacttgctgtcctcctgcc tccagagctctgggattgcacacacggctaagcctcttttttcatgaaagttcacaacac agccaagcccaagagtagtcagcacgtgaacagcgtgcccgaagtcatgcttattgaatt acactaatgttttgaaatagatcacatgaatattcccgttttacacccgagggaactgat ggctaaagaggtcagaaggctaagtactgttggaatcaccatttgaacatggatttgcta tctctgattcaaagcccatggtctagggaagaaacgtactctcaaaattagaaacagaga gttcccaccctcggggcaacggaaaccacaagaaacctgaagtgggttgagcatctctga caatctgcaggctcccatgcacagcctagccagcccgcggcccgctgcgcgacctcccga cacacgagggcgctgtcgcagcacggcgggaaacgagccgccagctagtgtcgcgagatt cttaaagccggaagggcgaaagagcaagggtcacgtagacggcgctccccgcccggctcg cgttaagttctcgcgcgagttgtacttccgcccttttggctCTCCGGTCGGCACCATGGC GGTCGGCAAGAACAAGCGCCTGACGAAAGGTGGCAAGAAGGGAGCTAAGAAGAAAGTgtg agtggcggatcgcgcgggtccccggccgttgggctccgcaggagttggtgggcgggttct ggggtgcggcgtggggcggatggtgaggatgcggggtggattgcgcggcggtgctgcgct gcgcggctggcgggtgcgtcccgggcggccgcctctccgccacccggccgggtgtcgcgc gccgcgtgtgatctccgccctgcgtctctagcagtcgctcgcgtgtcgcgcgcgaactgt gggctcctgggttgctggaagtccgtggcactttttaacaccgctctacgtcagtcactc tggctgtccatgtcgggaccccatgtcaacttgtgtgctgggctctcgtgggaccgacct ggagacccgggacacttgtttagcagcagtttgtgctgttgcggaccagtcactgtcaca ggtccctgaggttccagggcagtgtgtatatagtactgcctgtgtgatggaggagtgggg aaggcatggcttcgaacttactgctttgtgcactggcagaccagccggcctcgcagacgt tcaccccacggggaggacgtccgtcgtgttaagtgcaggccgattgcaagatcgtgcctg ggaaactgttaacagaagtctgaaggataagaagcgtttaaaagtggtcgggagtgttgt tacaatttacagagaaacttgaggttatttttctcccatccagGGTCGATCCATTTTCTA AGAAAGACTGGTACGATGTGAAAGCTCCAGCCATGTTCAATATTAGGAACATCGGGAAGA CACTAGTCACGAGGACTCAAGGAACCAgtgagtactgtgggccccttttgctttgttcct aagctgtggcatgtgcatattaaccggcgccttggtcaactctgatggggcgctggattg aaatgtcagcccagtggttggagggcctggcattgggagtgcttggtcttagtacagatg tggcagcaatgaagtgtttgtacagctgtccaagagaacgtttaggtgttggcagtaagc cactggtgtgaaggtgggtttggttaacaagttaacagggtttgtggttcttttttagAA ATTGCCTCTGATGGCCTCAAGGGTCGTGTGTTTGAAGTGAGCCTTGCTGATCTACAGAAT GATGAAGTTGCGTTTAGAAAATTCAAGCTAATCACTGAGGACGTTCAGGGCAAAAACTGT CTGACTAACTTCCATGGTATGGATCTTACCCGGGACAAAATGTGCTCCATGGTCAAGAAG TGGCAGgtgagaccaaaagctgcgagtgtgagtgctgtggtgtgggtgtgcagatgtgtc atgggtgtgttggttggtaggtagtatcaaaacatggaatggagaagttggtttcatttc atttgagtatcactgttaattcttgagtgctggaggtagaatccagggctttccacatgc tgggacatcagtcctaacattgagctgcatcctttaacttggtattgcttgttacggcca cattaggtgagttgggcagctttgccagtttggggactgttctagggttaacatcgttag agttgatagagaaaaggtgctctatctagctgactcagttgtctgacagtggagtgtggc tagagtcagattcggtccccttctgtccttgaaagtagtaacaagctttgatagcttaat ttcttcaacatcagcccctggggttgtgaagatgaaatgacatgtagggaaatgggctta gcatggtgaccagcaaagaaggctgattcaagggaaagctgttcagatgtatcctgatat tgacattgtatatgggaatgagtgatgacaagatgtttcggtcccaaatgaagcctactg attaccgtaacatttattgctgacattcccttatactttatgtaattttggaaataatag gctatttagtacatactgatgtatatactcctttgcagtgaagtggatgccaggattttg tttccgggcagttctgctggtctcaaattcttgagtgataggattgaaggcatgtaccac cgctcacggcaaatattgggtatatttgagaacttaatatttgtaaaattcaaagaaatc agatcgctttgccacaaaaatggtcctctaaaagatggtagtatggtctaattacagatt ttgtttagctttggatcttagctttggaattatgtttttaagttctttgtgtaacttagg aataaaaaggcatttagaaaatacagttttacagcagaacttctccactgccctctttca agaaaggatcttcaggtctggagggatggctcagcagttaaaagcactgactgcttttcc agaggtcctgagttcaatttccaggaaccacatggtggctcaaaaccatctgtaatggga tctcatgccctcttatggtttatctaaagacagctacagtgtactcacataaaataaatt ttttaaaataaaaagggtctccaacctgttgtgatctggtacttgctatgtagacctttg tatactgagtgcaaggattgcagacatctgtcatgtacagcttattgtgtgtttggtttt tttgggctcaaattcctaaaagatccaacatttttgtgtgtcctgcttggagtactgaaa ctaaagccgccacacacaacctatttttcctttctaacaggatctttcttttcttccttt tgtgatttttttttttttttttttttttttttttgagaccgggtttctgtgtgtatccct ggttgtcctggaactcactttgtagaccaggctagcctcgaactcagaaatccgcctgcc tctgcttcctaagtgctgggattaaaggtgtgcgccaccacacccggctatttttccttt ttaaaagataatattcagtttcattctgtctatactatcttagaatttaacttacaaagc ttttatgtttgagggatgttgacataaatgtaaagggtatgggtccagttgattgtttta aagggagggcaacaatgattttggggtatcattttaatttcactttaaggaagtgccata aacggtatatttgtcacgtgggcttgacatttccaaggttttacattagcacttaaaatg atttaggccgtgaaaaacataaaagggaggggaatctctgagttcaaggctaaccagggc tatgctgtgagaacctgtctcagaaaacagcaaaccccaaaaccattatgagctgacagt atccttttctcactagACCATGATCGAAGCTCACGTTGATGTCAAGACGACCGATGGGTA TTTGCTCCGACTTTTCTGTGTTGGCTTCACTAAGAAACGCAACAACCAGATAAGAAAGAC ATCCTATGCGCAGCACCAGCAAGTCCGCCAGATCCGGAAGAAGATGATGGAAATCATGAC CCGAGAGGTGCAGACTAATGACTTGAAGGAAGTAGTTAATAAACTgtaagtgcgtttctt ttctctcctctaaaaatgttcagaatgcctgttaaatcatccttctgttaaagaagaggt ggagttggacctcagcttaagcacttctaacattgaagttatcttacagtggacagtgaa aattagacttaatacacaatgaataacaactttaataatgcatgggaacatgtgatgaga aactgtttcggtcccagttgatggccactgataacattacatttttctgatgttcccatg cagtatacaggtggttaagcgtgttagacaaaaaagcataaggaagacttaaacgttgat tttgttgctaggtgttaaatttagatactaagattgtttttttgccatttaaagaaaatt gcttcttgtatgagagactttggtgggttttttgtttgcgtgtcttttaaaaaaagttta ttgttcttgcagGATTCCAGACAGCATTGGGAAAGACATAGAAAAGGCTTGCCAGTCCAT TTATCCTCTCCATGACGTCTTTGTTAGAAAAGTAAAAATGCTGAAGAAACCCAAGTTTGA ATgtaagtgggaaatcatgtttcatgagatagaagtttgtggaaccaagtacgtggtttt agaaatgactggttaacattcttgatgggtgtatgtgtatgagtgatttgcctctgtgtg tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtacacacgttcctggagacgttggtgtt gaggggctgcggctgcagatggttacgagccacctgtgggtgctgggtgctctgcaagga caagtgccacctcttcaccactgagccagcctctgcatgaaggttttcagggcaaagtaa cggtcgcttccttcgggctgtagtttaggttctgatacttgtttctaacaggatcctctt ccttttcctttcagTGGGCAAGCTCATGGAGCTGCATGGGGAAGGCGGCAGCTCTGGCAA AGCAGCTGGAGACGAGACGGGTGCTAAGGTTGAGCGAGCTGACGGATATGAACCGCCAGT CCAAGAATCAGTGTAAAATCCAGATTTTTAATAGTGACAAATAAAAAGTCCTATttgtga tcgtttgcttctgtccattgatttgaaacacgagagcctggtgaatcaggtgttgatttt agtgggttttatccattaagttagaagccaggttagtaatgagacagggtggggctctgt ctggcctccaacagatttgcatatatctggttttaaggcgtgtgccacaacaccctgaaa atagaaaccagcatactcccaaagttcttttctccctttaaataaccacactgctcagta gcagagttagttataaagtagcagcaacaaagatggttttatcatggcaaaaagggtcac agcattagggtggttaggaccactgggttagactatatatacttggtgaaccagaagact gaaaactgaaaatcataagattttatgaagcccagggatcatccagatctcgggccttac atgtgctaggtaagtgctttgccactgagcgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgtgagaga gagcgtgtgtaaatgtgtacatgtgctaggtaagtgctttgccgctgagcctgtgtgtgt gtgtgtgtgtaaacgtgtgcatgccactccagaaagttcatatttatggagatccctaga tttttccaatagataactcagtttcttaattttcattaagcagttcccccccccccccag ttttagcctatacattcacagggtaaaattttaataatcctctaggcaaatagtcttgtt taaagtattaacaaaataggtgccttagacatggtagcaagcaaatactatcacaactac ttttctagctgtgaagtattagttgatagatgtatctcaggcgagcctgttgatgtaata gctgatttcatttgtgggcttgagtcagataaccagcatccttcctgggtgaataggagt cagttggtgtaaagttgggtcattactaggaattgaatttgtgtgaaagttggtcttccc cttactaccatgaggctggatatttgtaagattg
Untranslated Region
Coding Sequence snoRNA |
|
| exon position | 1001..1076, 1783..1886, 2158..2345, 4336..4544, 4992..5101, 5474..5633 | |
| CDS position | 1015..1076, 1783..1886, 2158..2345, 4336..4544, 4992..5101, 5474..5595 | |
| accession no | NM_016959.3 | |