Danio_rerio rps20 | ||
organism | Danio_rerio | |
locus name | rps20 | |
chromosome ⁄ contig | 7 | |
snoRNA list | snoU54 | |
snoRNA position | 3926..3994 | |
length | 6382 | |
sequence |
agaattaataattcttaaaattaatatattttaataaaaaatattttggttgtaataat
aacaatcaaattattaaccctggttaattaatcttggtttaaccaatctctatttgcagc cctattttttatttgctaaaatgtcctgcccatcatcaccagccaacccctgcgaaatgc tctctcttccgttctttttgtttattttttatttttttattaactcaatgccacaagaac gagaggtattacatttcacatagtttctgaaagagaaaaaaacacatatgtatataaaaa taaagcaaaattatatttacattaaattaaatgttttcagagcatttcatgttttctgtg cttttttgttttgttatggttttaaaagatttacatatactagttattcacaaaatgggt caagtttggtttacagtgagcccacttttttcttacgtatatggtattttcctaacagca taaacaaattaaaaatatattgtcctttacagttcaagttctcattatcagaataaaaca gtatatcaaataaaccaatttttatcttatactccatttttgttaataaacaatcttttt aaaatatttttgagtaaatacagtgaaaaaaaacatgcaaacttgattctttttcttaac cacaaaattcacacatatttaaaatattaagttcaaatctttctaaaacatgtttagctg gataaattatatggagtattttgtacgacacttctttaattttgtgatttaagcaaaact tatttgtcaacttccaacgtttaactcaagaaatattatcaaataatgaaagccaaaaat gtcttgccaacgaagggagagcatttctcttccgttctggctgaagggttgacgtgatgt tgttgtcacgcagtacccggatgaattcatataaatgcacgagcaggccctttatccctc ctctttagcagaagcacagtgagctcgcgtggttcctggctCACCGCTGTTCGCCTTTCA GCTGTTGATACGAATAAGTCGGTCAGGAATTTGCAGTCATGgtaatttaacgttttatca aacattgtattaacaaagtttagcgttttgggtgattttctccgtctatttaataaccga tttcgcgaacgcgcgacagaagctttgtgatggcatgtgtttcacaaagtctgccagtta gctaaaagaacattattttattaaaaaaaacatgcaagttgctttattattattttatgt ttgtcaatgatctccgactttaatgtgttgacgatttacgtttgtccaaatttgagttct actattctctgaatgtaaacgttataacgaaggtctaaaacatgataatggaagctcttg atataagcgtaatgtgcttaaactaagccatgaagtgacaaattaaagtaatgaacgtat tcgaaaacgcggggcttgctttcactgtctacggaaacagtggagcacgatcatgtcaaa ataagagtctcagtcgtttgagcttttgtaccgttaaagtgttcatatgcatgacgtctt tgcacaagttcgctgtatttggcgaacagttaacttcatggctaaaccaacgaaccaaca ttagtaaataaataaaaaaaataatttgatgtggtgcttttcaagagaaattaaatatac agaaattaaataaaaatttactttaaagtggtttaaaacgtttattttgcttcgctgacc actaaaaattattttaaagaccgttggaaagtgttatctgtagacttatgcagtagatca gtggcatagaggtgaaattggttttatattcggatattccgacattctccttaacaattt aagaaaagtatttgcaaattctaaatagtgaaatcatataagcagccaatagcccctttc acacagtgataccggtaaatatccggaaagtttccggaacgactttaccggtatattcaa aaaagcgctgttcacacaggcgaggacgttacggaatttttccggaaaagagcgttcaca catccattccaaaataccggtaaattctgacatcattcaccacaaatgagctttaaacgg ctacgcttgtatttgtaaacatttgcctaaattacaaactctgtggatgatcaatattgt gaacaactttcgcaggatcactttcgcatgtcgagatgttcataatatgtgcgtgtgctg gcgctcacaggcacacgcaaagcttgaaggtaaacaaacaacggcttatcataagcatct catcgatgattatttacacagttggcataaagaagaacatataaacgtgatctgactaac ttctagcagctaaatgtgtctgaaaaaatattcaaaggtttttattctcacaaaccgcgc ggacgtaaatgcgtctgactgttgtaattggctaaagcagatgtctcacgtcagcacgtt ctagacgtgcacgcgcttattacggtaatcttccttttgcgttcacacagcgcagcattc cggcaaattgccggtaatgttacagcttctctttccggaaaatagccagaacgaatttac cggtattttcaaaaaggacctgttcacacatacaacggaaaggtctgtatgtgtgaaagg ggctaatgactatttaagtacaacattgttcacagtcaattagacaatagcccctttcac acatacagacctttccggaaaattaccggcaattttccggaaaggttgtatgtgtgaaca ggcccttttgaaaataccggtaaattcgttctggctattttccagaaagagaagttgtaa cattatcggtaatttgccggaatgctgcgctgtgtgaatgcagaaggaagattgccgtaa taagcacgtccacgtctagaacgtactgacgtgagacacctgctttagccagtcagaaca gtcagacgcattcacgtgcgcgcggtttatgagaataaaagcctttgaatattttttcca gacacctttagctgctagatgttagtcagataatgtttctgttccttcttaatgctgtgt aaaaaattatcgataaaatgtttatgataattcgttgtttacctttaagctttgcgtgtg cccgtgagcgcccatagcgccagcacacacgcatatcatgaacatctcgacatgcgaaag tgtttccctatgttttcattagagttgtactcaatactgatccatccgaagagtttgtaa tgtagtcaaatgtttacaaacacaagcgcagccgtttagaggtcatttctggttattgat gtcagaatttaccggcattttgcgatggatgtgtgaatgctcttttccggaaaaattccg taacgtcctcgtctgtgtgaaccgcgtttttttttaatatattctggtaaagtagttccg gaaattttccggatatttaccggtatcgctgtgtgaaaggggcttttgttaatgttgttt tgaagtcatccttgcatgctaattctgattgaatattcagagtaacatggtaaacaatat agatacttctaattgaatgaatgtgtgcgaaatataaaacaaactttacctctatcattg tctactgatttacagctttctttaaaatcttttaacaggtttagaagtgaagggagagta aattacatatttcttctgaactatctttttaattgtggttccctgagtgattttacgatg tcaaaccagcctttggattataagtttgtaaagtgagttttacaaaacactcctaacagt atgtttgatttacagGCATTTAAAGACACTGGCAAGGCTCCCGTTGAAGCCGAGGTGGCC ATTCACCGTATCAGGATCACTCTGACCAGCCGTAACGTCAAGTCTCTGGAAAAGGgtgtg tttgtccttcatgtctactaaaccaatggctatgaggataaaattgtatgaacgacttaa acatgagttatatcatacgctattctgagcccttttttttaatcaagttggtcattatgt ctgaatacgcccttcttgacgtccttaaactttccctctttttttggggtagTGTGTGCT GATTTGATCCGAGGTGCCAAGGAGAAGAGTCTTAAGGTGAAGGGGCCTGTGCGTATGCCT ACCAAGgtgaatgccagtctttacatttttagtttaacaggttgcaatttaaaaactgtt taaatatgcacatttctaagatgcttgtcaaattaagcctggcttacactctgacttaat attcctatacacttgtggcccctatgttgctaagatctgttgtcaatgtcagactgtaca ttaatcaaaatgcatgcaataagacttttctaaggatcacgtgtcccattatcccacatc gtaaaactcagtttctggagggccccagctctgcacagttaagttccaactctatttaaa cacacctgatcaagttgagtcctttaggcttgtatgaaattaaaaggttaaacattggtc acactagagtttgagcttctgaaattctgtcatatggtgctgtgaaaaggggttggatta gacattaaaaaaagcaagcgattggtccatgttttaaattcctgtccgcaaaggtcatgt tttgatctttgattggtctcacgcagtcaagtgatgcgaaactttcatttccggtctggc gcattcatgtgcatatgaatggaagtttatggggcgaaaagtctagtgtgaccgcagctt aagtgtgttggagaagggttggaactaaactgtgcaggactgtggccctctaggaactga gtttgacacccctccattaacctgtacctaactgcaaatgtaaaatctttagcattaatt ttgcttgttacatgtcataaatttaagctgcaatcattggcttgaatgcatttggttttg tgttaataagaggagaacgctaaacgaaagtgtttatagttatgtggaaatgtcaactta acaaaaataataaacatatttaagtctaggattacaggaatcttttaggtttcacaaaaa cggtctctgtccaaaatattgccaaaatcacagtgtgaggtttgtttgcgttttatgatt gtcctaaatcctgtaatttctcatccccaaatcagACCCTCCGCATCACTACTCGCAAGA CTCCTTGTGGTGAAGGTTCCAAGACCTGGGACAGATTCCAGATGAGGATCCACAAGCGCC TCATCGATCTGCACAGTCCATCTGAGATCGTCAAGCAGATCACCAGCATCAGCATTGAGC CTGGTGTTGAGGTGGAGGTCACAATTGCAGATGCTTAATTGCTGTCTGCACAATTAATCA GCTTTGTATTTCACATCTGATTAATAAAATTGGAAGTTTTGGAtctctgtctgccctttt tcttttccccactccagattgaatgtcacacttatttttgtcatctactccttgactatt tttatggaaaacgatgtaaatctgaattaatctttcaaattgtaatttaaagttgatacc aatattgcaattgtttaaagcctgatgtccagaaaaaaaaagatttttcttaaatgtagt caacatttgaagtggactgaaagttgtcccaagacaaaactgggtcttctgttcttttag ggcaactgtgatcatttttttctgatatgctgattaatgtagttctgaacatgcatgtca gtcaatttgaaatactcttaaaaattagcagattagcatgaacatgcttattattgtaga tctgagaaaattaataatgtttcagtttacatctataaaatgtgtatgtaagcaatatta acagttgttttgcacaaacgggtataaggctaattcatgtggattaatgtaagcacggga cattaattatatttgcagtctcaatatttgatcaaatattttatatgtactttgattaaa aatgcaaagctcatatgcgggagaaaaaaaaaagtgaagatagcatgggtacctcaagcc cttaaaacattaacttcactcgctactcttaggcttagtccgtgatttagtaggggtagc cacaacagaataaatcatcaattactcaggcaaatattttctttgtggttaatgcttttc caaccatggtgacttcagtgattttttttattatataattgaaatgttacataaatatga ttatacaactaaaacatttgtgttgcaagtgatttgtttttgtttcaagcgtaatagaaa agccctttcaggtaaaaaaaaaaaaaacaaaacgctcctgcaactattgatcgcaaaagt gtgtttaaatgcacatcataaaagatgtcgcaggtgtgtaggatactacttaaggaaatg attgtaaacaggtgtgccaaatt
Untranslated Region
Coding Sequence snoRNA |
|
exon position | 1001..1060, 3795..3894, 4072..4145, 5135..5382 | |
CDS position | 1058..1060, 3795..3894, 4072..4145, 5135..5317 | |
accession no | NC_007118.6 |