Ciona_savignyi ENSCSAVG00000003294 | ||
organism | Ciona_savignyi | |
locus name | ENSCSAVG00000003294 | |
chromosome ⁄ contig | reftig_132 | |
snoRNA list | SNORD83 | |
snoRNA position | 1286..1361 | |
length | 11327 | |
sequence |
ATAAAGTATTCATACTGTCTGAGCTGGTAAAATAATTACATCACATTCTCAACTTAATT
ATGTTTTTGTTTAACCTGATAATGTTACTAGTTTAATTTATCCAGCTGACTGAAAAACAA GAAAACAATTCACTGAGTTTTTCTGGGCCTATGGGAGACGCCCCTAACAAGAGACCTTTA GAAGATGGTGGTAAGTAGATATCAAACTACTTCTGCTAGTAAAAAAGCATTACCACTATT TTTAAATATAAATTCTCTTGTGGTCAGTGCTGGGAAAAATGCAGAGCAGCGTTTTTGTCT GCATCGTTAAAAAATATGTCTTTATGTCCCAATTTTTATTTCAGTTGTGAAATTTCGATA AATGTGAGCATTGCTATTGTATTTTCCCATCACTGCCTGTGGCATTTGTAGTTTTGAGTG AAGCACTGATACTGCATAGTACAGGATATGCGCCACGCAATCAGGAAGTTCCTATTTCAT AAAAGGCGCTCCCATTACTGTTCTTACTAAACCTAAGCTGCGTATTAGTGGAGCACACCA TCTGCTTGCCACTATAGTTGGAAATAGCTTTAAAATTAACTCTCTCTAAAAATATATCAT CAGTGTTCAGTTTAAGTTTATTACTAAACCAAGTGCATGTCTTAATATAATAAAGTTTAT ATAATTTTAGAAGAACCTGGACCAAAGAAACTAGCTACTCCTCAAACATTTGCTGCAAAT AGTAAGTTCTAGATCTATTAGGCTGCTGAGTTGATTGTATTACAGTTTTAATGTTTGTAT TGTTGCTTAGGTGAATTCGCGGAATCTAATAAACTTGGAATGCAAGAAAACCCGTAAGTT TGTTATGCCTTTTTTAATTTTCATGTTAATTTTAGCTATGATGAAAACAATTTCAGTGCT GAAATTATATGATAGTATTTGTATTCATACCCTGAGCTTTATCTTTTGCAATGTATAATT AACTCTTTAGTATTACAAATCACTATAGTAAGTTTTTTGGCAGGGATATTATGTCCGAGA CAATCAGATTACCAGATGACCTTGTTGGGCTGAGTAAGTTGCTGTTTGTGTGATTAAATA CATGCATTTGGCAGTTGTTTAATTGATTTGTTGCTTAGTTATTGGCAGAGGTGGTGAGAA CATCATGAGAATGCAACGCGAAACTGGTTGCAGAATTCAGATCACGCAAAGTATACCGGG CACTAAAGAACGACCATGCACATTATCGGGCACCCCAGAACAAATTGAGTACGTTCATTT TCTGTAGTAAAAACATGTCCTTTTAAGCCACATGATGCTTTTTAGATACCATAGCATTAC TGCATTGATGACCTTTTATCTATCACCCATTAACTGATGGCGTATTAAACTCACCCTCTT GTTTTCTATGAAATAAACCGAGCAATGATAACAAAGCGCTTCCGTTACAGAGTGTGCAGG AACATGTTAAACGAGATCATCTCGCGATCCCAAGCGGGAACACTGGGCAATAACTTCAAC CTTGGAGGACAAGGGGGAATGAGTGGAAGTGGCATGGATGGTGGAATGGGGGGAGGTATG GGAGGGGGCAACATGGGGGGAATGGGTGATGGAGTCGAGAAATCAATCGAGATTGCCGTT CCTCCTGACAAGTGTGGGCTCATTATCGGCAAAGGTGGCGAAACTATCAAAATGGTGAGT ACCGACTTTTCGTATGGTGCCACAATTTTAAAACTTTCCATCTTTCCCACAGTTGCAGCA GAGCTTAGGCGTGAAGATGCTTCTCATCCAGGATTCAACCGATAACATCGGCCAGAGCAA ACCTCTCAGAATAACAGGGGCACAGATGAATCTAGATGTAAGTAAAACTACATTGCAAAA AACGCTGTTTTTTTGCACTTCCTTATTTTCAATTTTTCCATGTTTTCACTTTTTTCCATG CTTCCGTATTTTAGTTTCTTTTAGATCTGGGCGAAATTACAAAATTATGCCTCTAAAGTG AAGTTTAAAGGTTAATTCTCTCTGTCTATCATCAAAATACATCCAAAAATGCAATAATTT TTGGGTGTTGTTTAAATCATGATAACGTCATAAAAATTACGGAATTACGAGCTGCCGTAA TTCCGTAATACAACTTGATCAATTACGCCCAGTTGTAGTTACTTTCTTAGTTTCCATGTT TTGGTTTGTTTCTATGCTCACATATTTTTGTTTCGTGTGCGTACTACAGAATGCTGTGAA TGCGGTTCACCAACTAATGGCGAACAGAGACCAGCAATTGGCCCAGCAGAAAGTGGACAG AGATGGAAGTGGAATGGATGTAAGTTCTCAGAAATTCTGTGTTTTAATTCGGTTATAGCG AAACCTGCATCATTCAGCAAGTTTTGTGCAGGTTTCAAAATAATAGCAATGATGTATTCC TGTGGTTAAGATGGTCTTTCCAACCTATGAAGACAACTTATTAAACCGACTGAGCTTAAT TAAACCCCTATGCTAATCATCCCGGCCAGTAATTTTTCCATCCTTTCTAAGCATTGATAT TCCCACAGCCCAACATGTTTGGAGATGACGTGAACAAGACCATCATTCCGGTCCCCAAAG CAGCTGTTGGCGTTGTTATTGGGAAAGGTGGTGACATGATCAATCAGATTCAAAATGTCA CCGGAACCAGAATCCAATTTAAACCAGGCAAGTAAATAAAATAGTAAATAAATCTTAAAT TAGGTTTAGTATTACCGTTCACAGGTTCTAAAAAAAGTTTGTGCTTAAGTCCTTGTTGTT AAGCACTACTTACAAAAACAATAGTTCTATCTATTATTGAATCCGACTGATTAGTCTGTT GGGTTTGTGCGTCCCTCAACCAAACCAAATGGTTGCAGATTCAAACTGGTCACTAGCTAG TCAGTTGTGTCCTCACGGACATTAGCTGAACCCAGTGGATTAATGGGTTCTTGAAGGAAC TTCAACACACTGCAATAGCTGTGGTAACCCGATGGTGGGCGCGAGGTGATATGACAATTG CCCATGTGTTATTAACCCTTGGTTTTTCCCATACACAAGGATAAAACTTAATATCCTATC CTATTTATTGTTTGCAACCAGCCACATGATGCTTAGCATAACATAGCTCACGCTTTGATG ACTCAAAGTCTATCACCCATATAACTGATGGCAAGTTGTAATTTTCAGCTTCATGTGATC ATGTCATTAATTCCTTGCAATTTTCATTTCCCAATCCATTGATTTCCTACAGAGGATCCT GGCTTACCTGAGCGAATGTGTAGCATCATGGGACAGAAGGAAGGAGTGGATGCGGCTATT AGAAGAATACACGAGATAATACAGAACGTGCAAGAGCGTGATGGTATGTCCTGTTCATAC GTTAAATATAAACAATTCAAAATAATGTGATGAAATTGTAACCTGCCAGTTCTGCTTCTG AATACCTTGATGTAAAAAGTTACAACATATCTGATATTTTTTCGCTAATTCACCATTATA GACTAAGTTGCAATGAATATCGAGTAATTCTCCCACTTCCAGGCAACCGTAGCGGGGGTG GTGGTGGTGGTGGCCCTCCAGGGGGCATGGGGAGTTTCGGACAATGGGAAGGCCCCAACA TGGGCCGCGGCAACCGTGGGATGGGTGTGAGCTCTGAAGAACACTTAGTGCCTGCCAATA AGACCGGACTTGTCATTGGAAAAGGTGAGGTTGATAAATTAGTTTTGAAAAACCAATATT GAAAGCAACAAAAGAGAAATTGTGATACATTATTAAACTCTAATACAGATTTATGCATGG TGCTTATTTTTGTATTTAAACTACAATTTATTTTTGAACCTTTTATAAATTATTTTGTTA AATTGGTTCCTTATGTTAAAATTTATGTTTCCCATTGCACTACAATACAATATGATGAAA TTGTAACTTGCCAGTTCTGCTTCTGACAAACATTGATGATACAAGTTACACTACTTCTGA TCTTCCTCCAATCACACTATGACCAGTATTAACTCTCTCACATAAATAACCTCATCACCA CCATACAATACCCACAGGCGGTGACACGATAAAGCAGATCAACATGCAATCGGGCGCTCA CGCTGAGATTCAAAGGAATCCTCCGCCTGGTTCCGACCTCAACTACAAAACCTTCATCAT CAAAGGTGAGTAGTGTAAAACCAACCTAGAATTGTTAGTTGCCGTCAAACCGTAATGCTG GCAATACTGCTAGCTAAATAGATTTTTGAATAATAAGTAGCCTTGTTAAGACACTAACTT AAGGATATTTTATATTTTTTGGGGGAAAGTTTCGTTTTATTTTGTATTATAAAAATGTAT TATTTTTAAATGAAAAATTTTCCAGTGAAGTTTCCAGGAGTTTTGCAGCTCTAATTATGC ATTTGTATAATGGCGACTTTTGACCTGCATATTTAAATACGCGTTCACTAACGAGCTTCT TGTTACTAAGGAACTCCGGAGCAGATAAAAATGTGTCGACAGCTGATACAAGAGAAGGTG GACGCTGGACCTGGTGGTCAGAATAATGGTCAGATGCAAAGTAGTCACATGGGTGGTCAA CCCCCGATGGGCAACTTTGGACCACCTCAAGTATGTTGTAGAAATATGTAGTAGCAATAT ATACCACAAGTATGTAGTAGCATTATGTAGCACTGTATGGGACTTAGAGAAAGTGTACTC TCTTTAACCACATTTTTGTAACATTTCGATAGAGTTTATAATCTTTTTTAGCGTTATTTA TAACATTTCTAAAAAGTTACCTTATTTACGATTTTTTGTAACATTTCTAAAGAGTTAAAA TCTTTTCTTTCTCTACATTTTCTTTACTGCTTGGAATATTAATTTTTGGTGAAAGTTGAT TAAATCTTTGTTTTTTCCAGCAACAAGGTGGATATGGTGGTCTTCCACCAGCTGCAAGTT ACGGCCACCCCAACCCACTGCAAGGCCCTCCTCAGGCCCCACAAGCGCCCCAGTCGTACC AGCAACCGTGGGGGAGTCAGTTCCAACAGTGGAGTTCACCCAGTGTCTCAGCCCCACAGC AAAACGGTGCAGATCCAAGTAAGTTGATTCACCCAAAACAACTCTTTCTTGCTGTGCAAT GATGCTACCCTGTGGTTAAGATGGTCGATATCAGGCCGATGAAGACAACTCTTACCTACT CTGAGCCAATATAATTAACCCTCTAACATATAAGCTTTATCACAAAAAACTCGAAATTAA TATCGATTTTTCTTCCAGCGAAACCAGTGGCAGATTCGAGCAATGCAGCAGCATGGCAGT CTTACCTTCAGATGTATGGAGCCCAAGCACAAGCTGCATACCAGCAGCCAACTGCTGCAG CTGCAGGTAAAGCACATTCATCACTTTAACTCAATCTGTGATCATAGCAGCCAGCCATTA TTGTGGGGGGAAACTAAAAGAAGGGAAAGCAGGAAGGAGGGAAACTGCACACTAAAAAAA GCAAAATGACATAAAGTTAGTTTTAAACATAGGGGTTGGAGTTAGGGTTAGTTCTGTGGT TGAGATTAGTGTTTAGGGCAGGGTTTAAATTAGTTTTCATAGTTATAGTGAGCAATTTCC CTCATTTTCTCTTTCCTGTCTTCCCTCTTAGTGTTGCCCAGTATTGTGGCCTTAAAGAAA TAAAACTCAAAGAAATCTGGTCGTATTAGGAAAATTTCTATAACTGAAGTGAATGACTTG ATGGTGCATATTGTCCTCCGTTCCATGCATACAATGATGATATTGTAACTTGCCAGTTCT GCTTCTGATTTGAAGTGATGATAAACATTACAACCATTCTGAGAATATCAACTACACATT TATCAAATTCTTTCTACTTAATTTGTATTTAACACCAATAAACCCCCACATTCCAGTTTC TGCTGCCCCAGCCAGTCAACCAGACTACTCCAAACAATGGGATGAATACCTGAAGCAAAA TGGTGAGTTGATTTTGTTGCGAATTAAGTAATTTTCAATGTCAGTATTTTTAATTTATCA ACCCTCTAAAAACTCGCGTCTGTTATCTAACGTTTAAAGCCTCATTTGTTGGTAGAGAAA GCTTTTGGGCATTCTTAACATAAACTAAGTACATATAGAACGCTGTTTAATTTAAATGAA TTTGAATCTAATAAACTACCTTGTTAACATTCTGGAAACTCCTGGAAGATCAGTATAAGT TTTATTACTTTAATCGAAAACGTAATGGTAGTTAAAACATATTCAGAGGTACAACGCTCA CGCAACTCAACATACATGTTATATAAACACAAACGCGTCAAATATATGCAACACTTCATA ATCCCAGGTCTCACGGCTGCAGCAGTTGCTGAGCGTCAACAGCTCGCACTGGCTTCCCCT GCCGCGGCTGCTGCCATCCAACAACAGGTTGCGGCTCCAGCCGCCGCGGCTGCTGCACCA ACTGCTGCCGCCGCCGCAGTTGCCCAACCCGCCACCACCCAGGTAATGTGGGGTATTTCA AACTGATGTTTGATGGTAATCACTATATTTTTCAAACTTAATCCATATTTTGTTAAATTG TTTGCTCGTTGTTACCAGATAAAACTACCGTTAAATTTGTAATAAAACATGTAACTACAT TGCCTTATGATGAAACTGCCATACAATATGATGAAATAGTAACTTGCCAGTTCTGCTTCT GACCAAAATTGATGCTACAAGTTACACTACTTCTGATCTTACCAAAATCACACCACTCGT TAATCAAGAAGTCCCAAACGTTCCAAACCCCCATCATAACCCCCCAGGAGTAATGGGCCT CCTATGGCCTTAATTCCTGGTCCCAGTGCTACCGTGGACCCGCCCATACTAATGTAATGT AATAACCCCACAGGCGGACTACTCTGCAGCATGGGCTGAATACTACCGACAATACTACGC CATGCACGGCCAAGCTGGATATGCGGCCGCAGCAGCTGCAGCTGGACAGGCACCTGCACC AACGTAAAGCGCTTCCTACACAAACACATTGTATATAAAGGTAAGCCAATGTTCGGTTGT ACGAAAGTAATACCTTTTTCATCTTTGGGGTAATACAAGTGCTGTAATTATGTTGTGCTT AACTTAGTTCTTGTGTACAATTTGTGTACGACAACATATTTTCGTATTGCGTTCGTTATA TTTCTTGTTTTGTCAATTGTGATTTCTGCGGACATAAATTGTGTTTTAACTGAATAAATC ACAGCACATTTAACTGAACTTATTATATGTGGTTTAATTTAACATTTAGAAAGGTGTACT TGCATACAAAGTCTTAATTATACGTTTTAATTTAACCAGTTAAATATGTTCCTTTAATTT AATTAATAATTGTACACCATGAATTTGTTTCCACGCCTTGTATATTCATGTATATTTTAA AAACTGGTTGATTTGCGTAATATTAACTTGTTGTACCATTCATTGCATAGCTCATAAAAT TGTTTTGGTTATTGGTAACACTGTTGTCTTTCATTGATGCAAATTGTTGATTGTGTTCAT GTCTCGCATTTGTGTGTTGATGCCGTTTTCTAACTTGTTGTTTTTGTGTGTCCAGATGCA GGCCCAGAAGAACCCTCCTGTACATATTCTCTCCTTTTGAACATAGCTACTTCTTCCTCA GTACGATGCTTTAAACATGAGCATCCCTTATAAACCCCCAGTGGAGTGCCAATCCATTAG CTTTGCACTTTGGTGCCAAATCATAGCAAACCCTAGGCGGTCCACACAAGCGCAGCTCAG ATGAGCGTCAGTGCCACATATTAATGTTGGCCACACTTGCCAAAGACAATTGACATTAAT TTGCATGCTTTGCGCAAAATATGCATTTTTGAAGCGCCACATCTTTGCCCACGGTCCAGC CCAAACCGTGGGTAAGATTTAAGTGGTGACTTGCGACCACTCGCAAAAATTTGCGAAGCG ACTTGTTAAAACCCCTAGGTTTGCCCGTCATAGCAATATAACCAGTTATCTTGCCTTAAC CATTTTCCCACCCCAATGTGTTTGATTGTAGCAAGCAGGAATCTCATTTTGGTATTTGTA TTTGTTCGGTTTTGCGGATTGTGTGTCGAGTGTTATGTGTTGTCCTTCTAATACGAGAGT ATTCCTACCCGTTGGTGCAAAATAGATAACGTGCGTCGCCTCACCCCGAAAACCACTGTC ATTCGATTATCGTTACAGCGGCCGTAGTTCACATTTTAAACTTGTCATAGCGCTAATTTG TTCAAATCGACCAATTAAACTATTTATTTCATGCTCCCTGTTATTTTTTAGTAACGTCAT TTCAGTTTTCCGTGTTTCATTGCAATCCTACCCCCAATGCTTTTTCCGCACGTTTTTAGC GATAAATTTGAATGCACTTCAAACAATAGTTTTGTGAAGCGTTTCTTGTCGAAAATATCC GAAGGTGTGAGAATTGTTTCGTGACGCGCTGCTGTGTAACTTAAATCGTTTGCTGTGTGT ATTTTATCATGTTAAACCCAATGTTACTTGCCTAATTTTGAACAATACTAAGAGCGACGA CGTACCATTGTAAAAATTCATTCCGTGTATATAGATATACATATATCTACTGTATGCTTA CCACTACAAGTTTTTAAAAAGTATTTATTTTCAGTAAATGATTTGCCGATTAACTTTCTT GCTCAACAACTCTTATTTGTGTGTGCCTTGTGTGTCTCCTGTATTAGACCCGATGAAACC ACCAACTCAGCTTGGATAATGGTGCCCCTATATGGGGATTCCCCCTATACGGGGATTGTA TATATTTATATGTGGTGAACTGTCATTCCATAATCTCTCGGCAGGTATATAGCGCCGCTT TAATTTAAAATGCTCTGGTAAGTTATTCAAACCATGTAAATCGCATGTCGGTGTGGCAGT TTAAACCGGTAAACCAGATGCTGATTTTAAAAACCTGAAGAAACCTCCCAAAGTTTCCCT GTGACCTTTGCTGGCAGTCCTAGTGCTTCTGTATTTTCGCGTATGTTTTCAAAGTAATGT TACCGCCTCGCTTTTATTTTGACCCCTTTTTTATAGAGTTAATCTCCTTCACACACCCCC GTTCGCTATTTTTAAAGTCGATTTTCTGCATTTTCTAATTACATCAAGTTCGCCGTGGTT TTTAGTGCGTCGTTGTCAATCATCGTAAACTGTGTCAATATGCAAGCGTGTTATCTTTTT TAAACGTTAACTTATCAAATTTTTCTATTCCGCCATGAATACCTAAGGTCCCCTGTGTAC GAACTCTAGTTATTATGAACGCCATTTGCATCATTGCGGATTAGTATTTCAGTGGTCTTG TTATATTGTCAGCAATGTGCCCTGTTATTGTGTTTCGTTAAATTCGAATATGACTTCCCC TCGCCGCAGTTTTAACACGCATGTCACTGTGACCGCTTCAGAAATTGACTCTTTTTTTTC CGCTCGATAATGTTGCTACTATTTCGCCCGGTTTTAGCCATTTTTCTTTCCCTGATGAAG TGCAACTGTCATTTACCCTTCCACCACCGTCACCTAACGTCGCGATATTCTTATGTATGC TACTGCCAGCATCGGTCACTAACTGCAACTGGTTTGAACCGGTTTAAACTGCCTGCTGAA TTTACCCTCTACATCAGCTTTTTGTCATTTTAGCGAATACTGTACACCTATGTAACCTGT GTTTTACAACTAAGAAACACTTAAAATTGCATATTTAGTTAAAGCTTAACTATCTGCTTA GCGTAATGTAATAATGCATGTTGTGTGAACCCTATGTTAATCCAGAGTGTTTAATATGTA GCTTACTGCCGTGAATCACAACTGATGGCATATAATGTTAGTGTTAATATTTGTTGGTAC TTTATACACTGGCTTTTTTTTCTGTATACAAAGTCAATCAAACGCGCGTTTAATTTTGTC AAAGTTTCTGTTGAAATCTGAAAAAATGCCTGTAACTTGTGTGTTATCCTGTCTCTTCTT AATTTTGTGGACCTTTCTAGTTACCTTTAAACGGTTTTGTGTTCTTGTACAAATACATCT GCTACATGCTATTTGTTGAGGGGTCTTTAAATATGTAGGGAAATTTAGGAAGTTTTGAAA TTGGGTGAGTAGGCAGCTATAGAATGGTAAGTATTGCTGTAATTTCTATTGGCGTCCACT TAATCCGGTGTTTTTACCTTGCAGGGGGATGGTCTAGCACAAACGCAGTTGGCGTTTTCA ATCATAATTTCGATCCAAACTAATTTTTCAACCGTGCTGAGAATGTACATTGTTACGAAC CATTATTACTCATTGTGCCGTGTGCTCTGTCGTTTTCAAGTAGCTCTAAATAAATGCTGT CATTGAAATGAGTTTTCGTAATATCTTTTATTAAAACTGATTGAGATAAACAATTATAAG ACACCTTTCATACAATTTGTTACATAGCTGCGTATTATTACATGTGTGTTGTGCATAGGG GGGTCAATTGCATGGACGTAAAATTACCGAACTGATGATGGCAAATAGTTTTAAATGGCA GAAGAAGCGATTCACTGGACAATTATCTGCAAAGCATTGATTGTAGAGGTTATTTCCTTA AGGTTTTAGACTTCATACTTTTGTCAGGTAAAACCCATTTATCCACTTGGTTCAGGTGGT GTGCTGTGAGTTACCAATGACAACAGCCTAGGTTTGACCACATCCGCCTTGGCTGACAAT GTGCTGCCAGTGAAGCTAACCAGTGGGAATGGGTAGGAAAGGATATTCATGTTTATCCCC CGTGAATGGGAAAACCAAGGGGGTTAACACACGGGAAATCGTCAGATCACCTCGCGCCCA CCGTCGAGTTACCGAAGCTATTGCAGTGTGTTCTGTATGATAGATACGTTCCTTCGATTT GGTAGAACCCATCAATCCATTAGGTTCAGGCAATGTCCGTAAAGTGCCTTGCCCAAGAAC ACAATTGACTAGCTAGCGACCAGTTTCGCACCTGCAACCTTTTGGTTGAAAGGCGACGCA CTAAACCGCCAGACCAAACGGCCGGATGGAATGATTAAACATAAAACCTGGTAATTTAAC TCACTTGAGCAAGTGCGGATGCAGGATCAGTTATATTCTGTATCACATTAAAGTGGTCGA GTCCATTCAGAAGTTTGTACGTCACATGTACATTGTTGGATTTCAATTCCTATTTATTTT CATGGTTAAATAACGAATGAAAAAAAAAAACGTTAATGTTTAACAGTAGCCTAAATTGTC AGACTACCTCATGCCCACACTTTGTCAGATGATGCACAGTTTTTTATTGCCTAATTTTGT TTTGGATGCTTTTAATATTTTACTGCATGTGTAGAGCTTTACCAAAAT
Untranslated Region
Coding Sequence snoRNA |
|
exon position | 1001..1052, 1118..1265, 1529..1673, 1732..1836, 2209..2271, 2528..2670, 3439..3683, 4037..4144, 4450..4596, 4887..5057, 5253..5345, 5876..5954, 6439..6466, 6853..6999, 10164..10327 | |
CDS position | 1001..1052, 1118..1265, 1529..1673, 1732..1836, 2209..2271, 2528..2670, 3439..3683, 4037..4144, 4450..4596, 4887..5057, 5253..5345, 5876..5954, 6439..6466, 6853..6948 | |
accession no |