|
|
| Ciona_intestinalis LOC100178199 | ||
| organism | Ciona_intestinalis | |
| locus name | LOC100178199 | |
| chromosome ⁄ contig | 14 | |
| snoRNA list | SNORA16B/SNORA16A | |
| snoRNA position | 4073..4211 | |
| length | 5542 | |
| sequence |
CCCACTCTCTTTATCGCCACCCAGCGATCTTCCTGTAATACCCGGGGCAACTGCACCAG
CGAAACGTCGCCCAAAAAAGAAATCTCTTGGTAGGTATATAGTAAGAAGGTATATCGTTA GCACCTAAATCCCATTTCCTGGTCATATTTTTAACAATTAACAACGCTATTTTAGAGACG AAAGGCAACGGTTATATAATTCTGTAAATATTCTTTATTTACTATACCAAATTGGACGGG AAAATAGAATTAAAACATATGCAATCTTACCCCACGTACCCTACTATATGTATGAAATAC TAATCCATGTACAATACCCGAACTTTGAGTTTTGTATTTACGATGCATTATCCTATATAG AAAAAGTGGATTCAAACATCTCAAACGCCTCTGCAGCTTCATTCACCTCGAACGTCTCGA GCGCCACCGACGACGAACATAAGCCGTTATAGTTGCGTATGATTTCCCAGCTATGCATGC TGTTGTGTACATTATTTTGCAACGAACGAACGAAGAGTTCCGTTTTTAAATATTTATTGC TGTGTTGCGTGTGGTCAAAATAAACTTGAAAAATGTGAATTTTTTCTGTTTCATTGTGGC CATGCAGAGAAGTGTTTGAAACAGTATATAACGGAATGTGGACTACTCTACTAGTTGGTA TAGTAGGATGGGGAAGACAGGACACCTTTAGCACATAATATCCAAATATCCTGATCGTGT TTTAAACATTTTACAACGGTCTATGGAAGTCGTGAGGATACGGTTTTATAATTCTTTAAA TGTTCTTTGTTTACTACCATATGGGTCGAGAAAATAGAATGGAAAGGTGTTCCATCTCTC CCCAACCCTGCTACTGCCTCTAGTAGTGTAGTCTGTGACTAGGAACACGTCTTCTTGAAT GGAATAAAATGAAAGGTGGTTTATTGAAAGTGGGGACGATTAAATTATAAGTTTGACCAC TTACGACAGCAAAGAGCAAAAACTAAGCGGGTACCATAAAATGTCAGTCTCGTTCTTTTT CCGACATCGAAGCTTGATTCGTGTAAGTTTGTTTGTTGCTTTCAATCCATTTTAATCTCT TAAATTAAGACCACATATAGTTGCAGAATATAGCAGTTTAACCTTGAAGATGTTATATTG CAATGTATTCAGTTAGATCAGGGTATTGTATGCTGAACGAGTCTGACCCGCAGTTTAAAA GACTACATGTGAATTTCAGCATGTCCCTTAAATGTTGTTGTTCAGGTGAATCAGTTACCA GGTAATAATGTGATGCAAAGCTAGTTAATTTAGGCAACTAGTTTAGAATACTGAAGCCAA TAGTTCAAAGAGTTTTGCCAAAAAAGTTCAGAAAAACTTAAAACGTTTATTTTGTAAACG CAAATAAAAATACAAAATTGTATTTTTTTGCAGTGAATCATGGCGCCACGAAAGGCTAAA GTCGAGAAGACTGAAGAAGTTGTTCAACTCGGCCCACAAGTCGCTGAGGGTGAAAATGTC TTCGGAGTAGCCCATATATATGCTTCATTCAACGATACATTCGTTCATGTCACTGATCTA TCTGGCAAGTAAGTTTTATTTGAAAATTGGTTGTTTTCGTTCTGATTTGTTACAGAAATG GCATTTTATTATCTCTGAGTGAATAAGTCTGCCGAATATGGCAGTTTCTAATACATGCGA CTATACGAAGAAGTAGGTACACTTTTTCCGCTAGGTGTCGGTAATTATTTAAATTAAAAA ATACGGAAAAACGCACAAAACAACACTGCAAAGTGTTAATAAGTGTAAAACAAATTAATT AAATAATAACAATACCTTTCTAAATACATAAAACACTAGTAAGAACATCTTTCCCACATT AGGTCGGTTATATACGCTCTTTCATTCTGTTTACTCTCGTCGAGTCTGTGGTGTAACGGT TTGCGTGCGATCGTTTACTCTCTTTGTTTCATTTTTACCGGGTTCGAGTCCCGCACAGTG GAATACATTTTTTTTTGAAGTTTTTTTTGTTTGATTAGCACGAGTTTGGGGTTAGGGGTT AAGGGTTTAAATCTTATGTGTATAAACCGTGAAACTAACTGCTCCCCATAGAATAGAGAA ACGTATTTGTCATCGCCTCCTAGCGGAAAAAGTGTACCTACTTCTTTGTATAGTCGCATG TGTTTCTAATCCTGAAAAAATCTCTCGCGTGCTGAACATTGTTTTTCGCGTGCGAGTGTA CTATCAATAAATATCGACGTGCAAAGCATGTACATATCCAAGTCGTAATTCTGCTTAATA AATAGTTGTGCGTGGGACAACAATTATGGCGTACAGCACCAGAAATTTGAAATTAAAATC GTCAGTGCACTTGCCATGCTCTGCAGAATGCTTAAAGAAAAAATATTAACTTTAGTTCTG TTTTTCTTACTCCATAACGTAACGGTCTTATCGAAGCCAGTTATTTCGTTCCAATGATTT AACTGGTCATATCTGACCAAAAGAAATGTTTTAATGACGGTCGCTAGTTCACCAGCTTAA TGTGGATATTGCATCACTACTGAAACGAACAATACTATTTAAACAGTCCCTTTAATAGTG CATGTCCGCTAGGGGTTATGGGTTTTCACCATTATGTCATAGTTTACTTAGACGTGCACT AGGAAAATGGCCCCCTGTTTAAAGGGTTAGTTGGATATGCAATCCTGTGAAACAAATCTA ACTTATTGCTTCTAATGTTTACTGAATAATACAGTGTAGAAAATACCTCGGGAAGCCTAA CTACCCTGCCACCCATGGTTTGGCGTCTATGTCTGTACCCCAAAGAGTATAATGCCAACT ATAAAGCAGGGGTTATTTTTAATAGTCTTGATGTGTTGCTCAAAGTAATGTTTAATTGTT TATATTATAAAGTGTAGCTTAAATATAATTTTAACCTAGCCCCTCAAATATAATTTTAAC AGTCTTATGTGTTAAATTTTGTCTTAAACGACTGCCAAGAGGATGTGTAGTGCTGATGTT ATTTCATAATTTAATTTTCTTATTGACAATTACAGAGAAACAATCGTCCGTATTACCGGT GGAATGAAAGTGAAGGCAGATCGTGATGAGGCATCTCCTTACGCTGCTATGTTGGCTGCA CAAGATGTTGCTGCTAGGTAGGTCTCTATGTTTAACTGTAACTTTAGTTTTAGCAGTGGT TTGACTTGTATATTGATATAGCATAAATTATGATCAACATCGGACATGTTTTTGTATATT ATACTATCTGTGCTTGTATTTATGTTCATTTTACTGCAAAATAATACTCCCCAGTATATA CACAACTAGTTTTGTGATAATTGATTAAAAACTCCATAATGCACTGTGAATGTCTAAATC TCTTTACAGCATAGTTTGTTGTAGATTACTCTGTTCTAAACACCGAATGCTGGATTTACT GGTAATTACAGATTTTCCTTAATATTATACACATTGAAAATCTACCACAAGTCCAACTGT TAACAATCTACCACAATCAATATTTTATCTTCAACTTGTAGGTGCAAAGAGATTGGAATC AACGCCCTTCACATTAAGCTGCGTGCAACTGGTGGAACCAGAACCAAGACTCCAGGACCT GGTGCGCAAAGTGCACTCCGTGCTCTTGCCAGATCTGGAATGAAAATTGGACGCATTGGT AAGCCAATAACTATCAATACATTGAAGTATTGTCCAATTCGATTTTTGTGTGGCCTTTAT TTTGTTAGTGTTGGTCCTATTTAAAACCATGTAGCTTTAGGAAACTTGGGAATTTTAAGG GTATTTGGTAATTGTCTAATGTAGTGGAATTGTCGGTCTGTAGCTCGGTTTTGGAGCACT CGCATCATGATCACTGCTGCGTTCGATGCTCTAGAATTCCCGTGAAGTCTATCGCACAAT GACACATATGCCCATAATAGTAGGATTGGTAGCAGGGACAAGCCTTGAACCCGTAACCTC TGCCACAGTCCTGGACTACCCACTTACAAAAACTGTTGTTGCCCAAAGATAAATAAGTGC TATTTATAATATCGGAACAAGTCTTTGCTATAGAAAACAAACTAAATATGTATTTCGGTC ATTATCGAAGCCAGTGGTATTATATCAATTAATTTCACTGGTCAAAATATGACCAACAAA AACGGTTGCTTGACGGTCGCTGCTTTAATTCTATTAATGTGTAAACCAGCATCACTGAAG TACCCTACAATTCATTTTGACAGACTTAAATATCTTAGTTAATTGTTATAGTTTTGAATG AATGAATGTAACTTACTTTATCCATGCGTGGCTGGAAAACGACAGTCGTTATAACACGGT GTTCTGTTTCGGACACCTCATGCCAGCTTAGAGTTACAATGTATGTTATTTTGTGGGTGA TTTTTTATGTATAGTTTTCAATAACATAGTTACAGCTAGATTAATTTGTTTTACAGAGGA TGTCACACCCATTCCATCTGACCATACCAGAAGAAAGGGTGGCCGCAGAGGACGACGTTT GTAAATGGTCGTAAAAACATTGGAATAAATCGAATGCGTGCAATTTGTATGTGGTTTTTG TTGTAGATGAGATGTAAAATATAAATGGCTTTTTCCAATCAAGCCATTGGCAATGATGCG GATTGCATCAGTTTACTGATTTGTTTATCTATTCTACACCAAAGCAATATGCGTAGTTAG GGTAGTGCAGGTATACTTCTTTACTGACACGGGTGTCTTTCACTAACTGGAACCTTCTCT AATAGCCCCCCCCGGTTGCTTTTGTCCAATCAATGTAGATTTTTTACAACTTATTAAAAA GGCGTTAGGTCGATTTATTTATCAAATTGTTTAGGTTAGGACAAAAACTCAACCTTGTGC TATAATGTATATATGTTTATATAGGCTAGTGAGCTATTCAAAAACCATTGTGAACTGGAA TTTAAAGTATTTCTGACCAAATAGAAATGTGAACTTGACAGGCAATATGGAAACGAAGCG AAATTCGTTTAAGAATCCAGTGCTTGCTTTTTGTACAATCGATTTTCGTTTTTATTGGAT CAAGACTTTCGTGCTGTTTACTACAGTTTTGAGCGTCTGAAAAAACACTTATAAATTATA AATCGTATACTTGAATGCACCTAAGCCAAGCAGTATAAATATTTAATTCGAACTTTGCCA TTGAGCAGGTGCTGTCGTCAACATATATCTTAAAATATTTTTGCTATTTTGGGTGTTTTG ATATTTTTAATCATTTAATTTGATTCGGAGGACGTTAATCATTTAATTTGATTCAGAGTA TAGAAACTTTTCTATGGCTTTGTGTATTTGGATCAAATGTATTTTCCTGGTTAGAAGATT ACCGGCCACAGATTTCGTACAAATGTAAAAACGATTATTCTATTTTATATATATACTAAA ATAAAGAATTTTTCCTATCTGAACGACGATTAACATTTAATAATCAACAGTTACCCAAGT TTAATATATTTTTGTCCCCAAGAAAATGCAAAAACACATTTTTCGCTATTCTGATAATGG CGGGAAATGTGACAAACGCAAAC
Untranslated Region
Coding Sequence snoRNA |
|
| exon position | 1001..1041, 1413..1567, 3035..3136, 3521..3657, 4436..4542 | |
| CDS position | 1419..1567, 3035..3136, 3521..3657, 4436..4503 | |
| accession no | ||