|
|
| Ciona_intestinalis ENSCING00000007592 | ||
| organism | Ciona_intestinalis | |
| locus name | ENSCING00000007592 | |
| chromosome ⁄ contig | scaffold_224 | |
| snoRNA list | SNORD18 | |
| snoRNA position | 3851..3918 | |
| length | 6602 | |
| sequence |
TACCACATATGTAACTTGTTTATCATCGTATGGCGTGGCAACGACAGTCGGTATAACAT
GGGTGTTTTGTTTCATACACCTCATGTCTGCCTACAAGTTACCACGTATGCAACTTACTG AGCAACCATTATTTTGGGATCGGATTTTTTTTATAACTTTTGGCTGACAATTTTGGCAAC CCACGGGACCGCTGAATAATGATTAAGTTTTTTTTTTCAGTCCTAGAAGACGCAAGTTTG GAAGAGTTACATGATGCTCTTGATTTTCTATACTCTCAAGAATAGTTAAATACTAATTAG ACGATCAAATGCGCATAAATGGTTGTCAGTAAAATAAACAATCTCGGTGTACAAGTGTGC TTGTGTTATATAGCGTGGAATGTGAGTGGTAACTAAGGGGCGAACAAGGGGGAATTTACC CCTCTACAAACTACAATTTTACCATATACGTATTATACGGCGGAGTAGAAATGGTCCAGT TTTACCGCCTATTTTTATTTGATTTTTTAAGCTTATTTACACATTTGTTTAATCCAGTGG TTCCCTAAAGTTGTTTCATATTAAACTTTCAGCCCCCCAAAAAATATCAACAAAAATAAT TATTAAAATTGGTTGTTTTGCTTTTTTGATAAAATAAAAACAAAATGTTATTTTTACCCC AATAAAAAACGATTTGTGACGTCACTTAAAACACGCTGCGAACGCAAGTTGGTGCTGTCC ACGCGAGGCCGCTGTTCAATCTGGGGTTTTGTGAAAATTTTCTTCCTTTTTAGAAACCAG GATGGTAAGTGACGTCGGATTGTATCTGTAATCATCTTATGCTACGTTTAATATCCACAA ACAGTTTCTGAACAACTGTTGAAGTCAGTTATGGAAGTTTAGGGTTAAATAGTTAAGTTA CCGGAAAGTTTGGTGTAAATATTGATATCAGAAGCGAAAGATTTGAACTAGAGATCCGCC ATTAGACATGGAACATACATTAGTTAACCTCGGTCTAATTCTTTCAGGCGCGTGGACCAA AGAAGCATCTGAAGCGCTTAAATGCGCCCAAGCATTGGATGTTAGACAAACTGACGGGTG TTTTCGTAAGTAATATTTTATATTTTTCTAAAACCGAATAATTTTGGGATATACGATATA AAGTAAAAGACAGAATATATCAAAATAAGATTATAACTCTCCCTTGGTCAAATGTGTATA TAGATAATTTAAACTGTTGCAACATTAATACAATATATTGAATACCTTTAAAATGTGAAA CCTGAAGTTTTAAAAAGATTATTTTGTTGTACCTTTTTTAAACTATCTATTAGTAAAGAA CCCTTACCCCCCCCAGTTGCCCATATATCTGATCTGTAACTCCCGATACTTCACTTTTAC CTCAAAATAATTTGTTTTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGAATAGTGACAGTT ACTTTGGTTTCTGCCGTTATATGGACACGTTAGGCGGGGGCAACGTTAGTCGTTATAACA CGGGTGTTCTGTTTCATACACCTCGTGCCTGCTTACAAGTTACCACATATGTAACTTGTT TATCCTCGTATGACAGGGCAACGACAGTCGGTATAACATGGGTGTTTTGTTTCATACACC TCATGTCTGCCTACAAGTTACCACGTATGCAACTTACTGAGCAACCATTATTTTGGGACC GGATTTTTTTTTATAACTTTTGGCTGACAATTTTGGCAAGGGACCGCTGGGTTGTAGAAA TATGAATAATGATTACGTTTACGTTTTTGTTTCAGTCCTAGAAGACGCAAGTTTGGAAGA GTTACACGATGCTCTTGATTTTCTATACTCTCAAGAATAGTTAAATACTAATTAGACGAT CAAATACGCATAAATGGTTGCCAGTAAAATAAACCATCTCGGTACAAGCGTGCTTGTGTT ATATAGCGTGGAATGTGAGTGGTAACTAAGGGGCGAACAAGGGGGAATTTACCCCTCTAC AAACTACATTTTACCATATACGTATTAAACGGCGGAGTAGAAATATTACTTTGTGATGGT CCAGTTTTACCGCCTATTTTTATTTGATTGTTTAAGCTTATATACAAATTTGTTCAATCC AGTGGTTCCTTAAAGTTGTTTAATATTAAACTTTCAGCCCCCCCCCCCATAAAATATCAA CAAAATTAAATATTAAAATTGGTCGTTTTGCTTTTTTGACAAAATGAAAACTAGGTTTTT TTACCCCAATAAAAAACGATTTGTGACGTCACTTAAAACACGCTGCGAACGCAAGTTGGT GCTGTCCACGCGAGGCCGCTGTTCAATCTGGGGTTTTGTGAAAATTTTCTTCCTTTTTAG AAACCAGGATGGTGAGTGACGTCGGATTGTATCTGTATTCATCTTATGCTACGTTTAATA TCCACAAACAGTTTCCGAACAACTGTTGAAGTCAGTTATGGAAGTTTAGGGTTAAATAGT TAAGTTACCGGAAAGTTTGGTGTAAATATTGATATCAGAAGCGAAAGATTTGAACTAGAG ATCCGCCATTAGACATGGAACATACATTAGTTAACCTCGGTCTAATTCTTTCAGGCGCGT GGACCAAAGAAGCATCTGAAGCGCTTAAATGCGCCCAAGCATTGGATGTTAGACAAACTG ACGGGTGTTTTCGTAAGTAATATTTTATATTTTTCTAAAACCGAATAATTTTGGGATATA CGATATAAAGTAAAAGACAGAAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNCGTAATCGTCTGCATTATGCTCTCACTTACGATGAAACGAAGCGGA TCCTCATGCAAAGATTGGTGAAGGTTGACGGTAAAGTTCGAACTGACACAACATATCCAG CTGGATTTATGGGTTAGTTGTAAAGTTTTCTGCAGTATATAAAAGTTCCTGAACAATTCC TGTCAATCCAATTGTTTAAAATCTGCCGCCAAAATAAGTATTTTAACAACCGAAGTTCTA AAATTATTCGGACAGCAAAATAGTCTTGCCCTGATTGCTTTATAATTTATTTGAGACCGG CTCAATACCTTTCACGCATTTTAACAGGTAAATTAATGTTACTAGTTTTTGAAATTATAC GTTGGGTATCACTGAAACTTAACAGAACTTATTTTCACCGATAAAGTTATACCTAGTGTA CAATTTTGATAATTGTATTTATGCTGTCTTTCAACAAAAAAAGTTTTAAATTTGCCATTT TATTTTTAGACGTAATCACCATTGACAAGACAGCTGAGTATTTCCGTCTCATCTACGACG TGAAAGGACGTTTTGCTGTTCATAGAATTACTTCTGATGAAGCAAAGGTATATGTTTGAC ACTACCAAGTATTGGTGGTGCCTAACATGGGCACACTGTGTATGAATGACCTAGAATAGC TTAGGTTATGAATCCGTTTATGAAGTATATAAATTTAGGTACACACAGTAATTGGCAAAC TCATGGTAATGAATCATTTAAATAAAGCAGTATGGCCTAAAGACACCCCTCATTTTTCAA AAGTTGGTGCCTATGCTGCCAAGCGTGAGATAAATTCAAAAATATCTGTTGGTAAAAAGT TTCAATGCCCTGCTAAGATTGCAGAGGTTTAATTTCACTTCTTATTCATGATAAGAAATG TTGGTTTAAAAACTGAATTGCCAGTGTGGTTGTTTTAGAAGAAATTTTAAGTTAAAACAA ATATTGTTGTCGGTTAATGATGAGTCAACTTCAGGTCCGTGTTTTTGAAACTAATGATAA CAACTGAAGTTCTGAATACCGACGTATTGTTATATTTAATACGCTAATGTGAGTGTGGAT AATGTAACAGACATAATTCAAATCCAGTGAATTGATTGATGTGAAAGATATATAGTTGTC CAAAATAGCATCATCAGTCTCTTATTTAAATAGAACCACCTAAGTTTAAGAAGTTTTACT TTGGTTATTCAAATAAATATGTTTAAGTTCCATTTACTGATGGAATAATAATGCAGAAAA ACTCAATTTGGAAATATTTTAGTACAAGTTGTGCAAGGTGAAGAAGGTTGCCACGGCGCC CAAGGGAGTCCCGTACCTCGTCACCCACGATGCACGAACCATTCGTTACCCCAACCCCGA TATTAAGGTACACGATACAGTGGTTGTTGATATCGCGAGTGGAAAGATTACTGGTTTTGT GCATTTGGACAGCGGTGAGTGATTCAAACATTTCTCTAGTAATGCATAGTCTCTTGTGTG GTAATTATTAAAAGTTGTATTTTGCAGCTGTAGTGAATATTTTATTATGCGATTAGTTGG ACTTGATTTTTGTCAGTTATGTTTTTGTAGCACCGGATCCCTATAATATTTTTTAGGTTT TATGCTTGTTTGGTTTGAAACAAATCACAGTACATTTATTACTGCATGTTTATCTGTAAC AAACTTATAGCACCCAAGTGTGTTCAAGTCTGTGATCATGGAGGGAAAAATAGCCTTTTG CATATTTGGTAACTTGTTAGGCATGAACAAGGTGTAATAAACAGTCAAGTCACCATTGGA ACTATTATGGGAGCTGGCCCACCACGTGGAATATATGATTATATAATAAAACCCATGTAG GTAACATGTGCATGATCACTGGAGGTCACAACTTGGGGCGAGTAGGAACAGTTATGCATA GAGAGAGACATCCAGGATCATTTGACATCATCCACGTAAAAGATGCGCTCGGCCACACCT TTGCTACCCGTCTATCGAATGTTTTCATCATAGGCCAGGTTAAACATACTTGCTAACCAA ATTTGATAATATAGTTTTAAAAAATTTAATGTTTACCTGGGTTATTGAACAGTTTTATTT CACTGGCTCCCAGATTTTAGATATGTTCTGCCACAGTAAATACCAAACTTATTGTGAACT AGATTAAGTAGCATACTGAAGCTTATTTCTTGTATGAAAAATACAGTTTGAGAAGTGATG GTTAAAATATCTAACAATATTACCTACATTATCAATCTGACAATTCTTCACCCAAGCAAA CTAATTCACAATATTTTGTTGTCGGTTAATGATGAGTCAACTTCAGGTCCGTGTTTTTGA AACCAATGATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NCATTCAAATACATATATTTTACCAGCTTGTATAAGAATACTGAGATACAGTTTATTGAA ATAACTTCATTAACATTTGATGTGGAGGGGTAAAAGTTACACCAGTCGGTAAAGTTACAC CAGTCTAAATTCGTTCATACTTAACAACTAAACTTACTGCAAGAAATATTAACACAATCA TATTTTTAACAGGCCAACAAACCAATGGTTTCCCTTCCACGAGGAAAAGGAATCAAACTG ACGATCGCTGAAGAGAGAGACCGTCGGTTGGCAACAAAGTAAATGCCATTGAATTGAGCA TTTCAATAAATATTGAAATCGGATTTAGTTTTGTTTCTTTATTGTGTATAGCCACAGATT GCGTAAGTTCTAAAAGCAGGCAATGCAGCCTATATAGTATGCTGGGAACAGACTTAATTT TATCCCAGCACAGCATAAAACTCTAGTTTGTATTCTTACTTTGCCAATTGAATCTGAATT ACGAGATTTTAAAATCAAACCCTGCTTTTTCTAGTTGGAAAAAAATGTCAAGTGTTTACA CTTATGTAGGCTGTTGGGGATCGGGTTTTATTTCTAGAGAAAGTTTTAAAAGGCAGGGCT GGCTGTTGTTGAATGTTTATTACAATTTTAATATGACTTTAATTAGTAAGTGAGCTACTC TGCCAACTGAGTCTTCATATGTTCAGTAGAATAAACACAATAATAGTTAAACTTGTTTCA ATGTTAATTATTCATAAACATGGAATACACAATAGACAGTATTGGTTTACAACTTTACAG TTATTGCACCAAATTGCAAAGGTTTTCGGAACAAATCAAAGACACAAAGAAATTACTTAC AATAATAAACCCAAAATGCACCTAATTTTACCACAAATAAAAACACACGTTATCATAACA TCATAGGCGTCCTACACAACGGGCAAGTGGATTGATTACTTGTGTCAAACCACTTGTACA AGCATTCTGCATGGTATTTTTTCTTGCATGTCTTGCATTGTAGTTTTGGTAAGGACTGTG AGTTGGAGCCGTGCACTACAGAGAAACATATCATGCATTCCTCAAGCCCATGGAGCCTTT TGTCAACCTTTTCCTTCCACAAATACAAAGCATCCAGTATTTGGCCGTTCTGGTGTCGTA ATAACATTGTCATCTGCAGAATCCAATATCTCCATTGAGTTGCTTTCACTCCTGCTTTTC TAACCGTGTTTACTTGTACAGGGCTCAGAGGGTAATTTGTTGGTAGTTGTATTGAAATAA CAAACTCTGCGTCAGTGATTTGATATGTCGCAACAACTTCTTTCGAAGCTGGACGTGCAA CAA
Untranslated Region
Coding Sequence snoRNA |
|
| exon position | 1001..1078, 2081..2120, 2476..2549, 2936..3011, 3369..3466, 4162..4333, 4740..4897, 5472..5602 | |
| CDS position | 1001..1078, 2081..2120, 2476..2549, 2936..3011, 3369..3466, 4162..4333, 4740..4897, 5472..5558 | |
| accession no | ||