|
|
| Ciona_intestinalis ENSCING00000003982 | ||
| organism | Ciona_intestinalis | |
| locus name | ENSCING00000003982 | |
| chromosome ⁄ contig | 12q | |
| snoRNA list | SNORD111, SNORD111, SNORD111 | |
| snoRNA position | 1174..1251, 2286..2367, 4626..4707 | |
| length | 5978 | |
| sequence |
TCACATATCGAACAACATCAGCGATTGATTGGCTGATCAAAACAATTGCAATGTCTTTG
CGTGAAAGAAACAACCTGAAATACGAGCATTATTGTGAGCTTTGAAAGTGGGCGAACCCT GGCATTAAGCATAGGGCCCAATGGTGTGACTTGCCGTGGGACCACACTCATATAAATTAA CAAAAAAACACTGTTTTTAGTTCTTATTTTGTCTCACAATTGAACTTTAAGGTTAAATAT ACAAAGCAACAGAGCATAGATAACATATTGGCTACCCAGCGCAAAAATCATACACATTAA AAGGGATAATAATGCTGTACATTAATTGCAGCCTTTAAATTTTAAAATGGAACAGTGTTA AGGTATATTATGCGATAACTTCTTACCTTAATTGTTCTTCAATATCGCCCGTTGGTGTAT CTTTCTCAACGACCATGAAATTCGGTTGTCTGTGCTTATTTAATTCACCAATCCCACCCA AAAGAAATCCAGTACAAGTATCTTCGTCGCCAATAACTGCCAACAACTTTCCTGCTCTTG ATGCGGCCATTTTATTGTTTTATTAAAGAAAATATCAACAAAGTTTGTCTTGAAGGATTT TCAATACAATTTTTGCTGACTGTCATATGATAATGAGTCAGCATTATTCGTTTGGAATAG AAATACAATTAATAAAATTATTTAGTAAAATTGATACAATTTTTCTACTATATATGTAAA TAAATTTTAAAAATGTAAAAATGATGGTGCAATACGTGAAAATATGTACAAAGTATGGTG AAATCCAAGTATGACGCACTAAAAAATATGCGTTGTCACGATCATCCGGGTTTGTTTAAC GAAAACCGCTTAGTCATTCTCTTTCAACCGACGAGGTACGTGGTGTGTTGCGTTAATTCT TTGCAATATTATCCGCTTTAATCTGTAAAGTTAGGACATATATTCGCCAGATATTGCTAA ATTATATTCAGTAAACAGGATTTGTATTTATTTCAGGCAAAATGGGGCGTCGTCCGGCTC GGTGGTGAGTTAATATCTGTTATTTTACCTTGCATTTAATATTGACCAAATATACCCTTT GTATACCCCTGTAACTAGTTGTACTTGTAATTTTTACTGAAATGTAACTTAAGTTAGGTA TATATGATTTATTAGTGTTCCGTTAAATGTTTACTTGATCACAATGATGAAACATTTCAT GTCTCTTCTCTGATAAAGAATGAAAGATATTTTTATTATTCTGAGTGATCTAGTTAGAGT TAAGTTAATTGGTATACTAATGTAAAATTCATTTATAACAGCATTTAAAAATTTGTAAAA CCTCAAAAATTAAAAGAAATGTAGGAGGGTAGGACCTAATGATTGGCATATAATGTATCG GGTGGATTTTTAATACTTTGAGTCAACCTTTAAATAATACAATGCTGCATTTTAACGAAT AAAACATTAATTGATTGAATATTTTCTCTCCAGTTATCGGTATTGTAAAAACAAGCCGTA CCCAAAATCTCGTTTCTGTCGTGGTGTTCCCGATCCAAAAATCCGTATCTTTGACCTTGG AAGAAAAAGGGCGGATGTCCGGGACTTCCCACTATGCATGCATATGGTGTCCGATGAACT TGAACAACTGAGTTCCGAAGCTTTGGAGGCCGCGCGTATCTGTGCCAACAAGTAAGTTCG AGGTTGGAATAATTGTGTTTTTTTCTTTGTATAGTAGGTTGGTGGTGTAATACTGCCGCT GGTGACCAGTGAAAATTTTGGTCTCAAAATGTTCCTTACGTCTCCCTGTTACCTGCTGTA TAATTTTTTTTAAAAAAAAACTTGGGCGTTCGTGTCGAAAATAAACTTTGAAAACGTGCT GTTACACAATCTGCAACATAGAAATCCAACAGAGTAATTCGCATTCTATGACGTAATAAT CTAACCTTTAACGGCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNGCACGTGCTCATGCTATTGAAGCTCTACGTAGAGCTAAGTTTAAGTTTCCTGG GCGTCAGAAGGTTGGTTGATGTTATGTACTATTATCCACATGGTTGATGGCATTGTGTAT TGAGGTCTACATTGGCCAAACCTCCGGTTGTTTCTGAGATTTGTAGACTCAAATCTCTGT GCCTCCCTTGCTATTCTGTATTAGCCAAACATTCACTAGTTTATTAGCTTATATATATAT AAGATTTCTTAGTGTGTTTATTAGCTTATATATATATAAGATTTCTTAGTTGTATTTCAT TTGTTTTCGATCACAATGATGAAACATTTCATGTCTCTTCTCTGATTAAGAATGAAAGAT ATTTTTATTATTCTGAGTGATCAATTGTTAGTCTACCTTAACATTAAGAATGAGGTATAT ACACTTCTGCTTTGTGTTTAAAGTATAAAGATTATATTTCCATTTTGTAGAATGATTTTC GCTAACTGCCACCTATTGTTTCCACCCAGATCTACGATTCACCAAAGTGGGGATTCACCA AATGGAACCGGGAAGATTACGAGCGTATGTTAGCTGAAGGCCTTCTCATCCCTGATGGTG TCTCATGTCAATACAAACCTAACAAGGGAAAACTTGATCTGTGGAAAAAACGACAGTAAC CGTTCTTCGCTGTTAATAAAATATCACAGATTTCATTTTTAGCCTTTCATTCTATATGGT TGAGAGCCTAAAGCGAGGCACGCCAGGGAAGCTTGAATACAAGGTCACTGCACATTTTGA GCAGTCACTTTGCGATTAATGATACCTTTTTGTATCATGACGAGTGTNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCATGGAGACTTAAGGAACATTT TGAGACCAAAATTTTCACTGGTCACCAGCAGCAGTATTACCACAACTCCTATAGACCGTT GTTAATTGTTTGAAACACAATTATAATGTTTATATATTATGTGCTAAAGGTGTTCCATCT TACCCCACGGTACTATATACTAACCCCTTTGTATATGCACTAACCCATAAAGTTAATACT TTTGACATGGTCATCTTAGACTGTTATTGCAGACAAATTGGCCACTAACGTAAAAGCAGA AACATCTCGGGATTTTTCTCGTTATATTCTTCGTACCAATTGCCTTCACAAAAGAATGTT ACAATGATGATATTTTTTTCTTCTGATTATTTGTGAAGAGAAAACTCTCTCTTTCTGAGT AACATTTATATAATACATGTTGGTTATAGTATGTCGGGGGTTTACACAGTTTCTGGGTTT TTTCTCATACTTAAATTTCACACTCAAGCTCTTTATAATATGTGAAAATCATACGAAACA CGACTTAATGTCAGTTTTAGTGTATTTGCTTTAGCATTCGCCATTCATGGTACATTATCT TTTAGCTGTGATTTTGTCAAAGTATGGGTGCTGAATCCCTATTTGGTACTGATTGTCCCA AATTTCAAATGACATGGTCTGTAATCTATTCCCCTTTAACCCTACTCTTCCCATTTATTG TACAACATTATAGGACATGTGTTTGAAATGACATTTATTGTATATTCCTACTTCCCTAGG TACATGGTTAAATACTGTGGTAAAGATTCTTTCCATCTTCGTGTGCGAGTCCATCCTTTC ATGTGGTTCGTATCAACAAGATGTTGTCATGTGCCGGTGCTGATAGGTTTGTTGCAAACA TTTCTATTCTATAATATGTATAAATATATTATTTTTACTTTGAAACTAATTTGCACCAAA TATTAACCAAGTATATATTAAAGAGTTGCACACTATTACCTCAATTTTTATTGAAAGTAG TTTATTTAATGTTACTTATTTCGAGTCACAGGTTTTTAAATTTTATCAAAGTTAAAATGT CAAATAAAAATTGTTGTGATAGTTGTTGTTACAAAAAGAATGTTACAATGATGATATATT TTATTCTTCTGATTATTTGTGAAGATAAAACTCTCTCTTTCTGAGTAACATTCTTAATAA CCAAGAAGTGCTTGACCACGCTCGTACTATAGATTTTGAATTTAACTTTTGTGGCTAAAA AACGGAATTGTTAGGATATAAATTGGTGTAAGTGTGTTGTGTAAAAGCTGGTGTTAATTG AAAGAATACGCTCAACAAACTTACAAATTATTGTTAGTGTTAGTTAGCTGTATCTACAAT TGGGCTTAGTAGTTTTGTCCCCCACTTCATATGTATTTGGTAACTTTACTTAAATCCTCA GATTGCAGACCGGAATGAGAGGAGCTTACGGTAAACCACAAGGGTTGGTTGCTCGTGTTA AGATTGGTCAACCAATCATGTCTATGCGATGCAAGGACAGTGCACGTGCTCATGCTATTG AAGCGCTACGTAGAGCTAAGTTTAAGTTTCCTGGGCGTCAGAAGGTTGGTTGATGTTATG TACTATTATCCACATGGTTGATGGCATTGTGTATTGAGGTCTACATTGGCCAAACCTCCG GTTGTTTCTGAGATTTGTAGACTCAAATCTCTGTGCCTCCCTTGCTATTCTGTATTAGCC AAACATTCACTAGTTTATTAGCCTATATATATATAAGATTTCTTAGTTGTCTTATTTCAT TTGTTTTCGATCACAATGATGAAACATTTCATGTCTCTTCTCTGATTAAGAATGAAAGAT ATTTTTATTATTCTGAGTGATCAATTGTTAGTCTACCTAAACATTAAGAATGAGGTATAT ACACTTCTGCTTTGTGTTTAAAGTATAAAGATTATATTTCCATTTTGTAGAATGATTTTC GCTAACTGCCACCTATTGTTTCCACCCAGATCTACGATTCACCAAAGTGGGGATTCACCA AATGGAACCGGGAAGATTACGAGCGTATGTTAGCTGAAGGCCTTCTCATCCCTGATGGTG TCTCATGTCAATACAAACCTAACAAGGGAAAACTTGATCTGTGGAAAAAACGACAGTAAC CGTTCTTCGCTGTTAATAAAATATCACAGATTTCATTTTTAGCCTTTCATTCTATATGGT TGAGAGCCTAAAGCGAGGCACGCCAGGGAAGCTTGAATACAAGGTCACTGCACATTTTGA GCAGTCACTTTGCGATTAATGATACCTTTTTGTATCATGACGAGTGTTTTAATGCCTTTT TAAAGGTTGTTGTTCACCACTTTTTTTGGCTGTATTTTTTAGCCCAAATTGTGGGCTTGG TTTTTGTCCTTTGATATAAGTTGAGGTTGACATTGCAGAAGTATTTTGTCAGCTTTCATT GCAGTTCTGATCTGCTTTGTTGGCTGTTGCACCTTCCAAGTTTTGGGTGGAATTCTGAGT GATCATTTCAATTTTGTTCACTTAGAATAAACAAGTTTTTCAGTTTTGTTTTCAGAATTT GATCTTAAAACACTGTTTTTTAAGTGAAGAGGGTTCAACATAAAACAGTGGATTCATTTT TCACTGTTTTTGGAGAATATTACTCAATGTCGTACTAATGTAACTATTGGTACAACATGT TATACTCCATCGTTTGTGTATGGTCTCAAACTCGCGTGTGGACAAAACGCAGTTGAACTG GTTGTACCATAGTTTAATTAAGCCGGTTTATTAAACTATGGTGGTTAGTAGTGTGGAGGA AGATGGGACACCTTTAACACATAATACCCAAATATCCTGAACGTGTTTTAAGCAATTAAC AACGGTCTATGGAAGTCGTGAGGTTGCGGTTTCATTTTTATTTAAATGTTCTTTGTTTAC TTCCAAATGGAGCCAGAAATCTTCTCCCATCCTACTAAACATGTATGGCTGGTAAACGAC GTACTTCGTGGCATGGCAGCGTGCGGTATCGTATAAGTTGTACTAGAAATCAATGTTCGG GACAAAACGATTGTAAACGTAAATCGGATTATACGCGTGTGTTGCGATCGTGTTCGTACG AACTATGGTCTCCACCAGTACGTTTGGGGGCAAGGCTAT
Untranslated Region
Coding Sequence snoRNA |
|
| exon position | 1001..1023, 1473..1670, 3599..3656, 3659..3705, 4261..4423, 4829..4978 | |
| CDS position | 1001..1023, 1473..1670, 3599..3656, 3659..3705, 4261..4423, 4829..4975 | |
| accession no | ||