Cavia_porcellus LOC100715556 | ||
organism | Cavia_porcellus | |
locus name | LOC100715556 | |
chromosome ⁄ contig | scaffold_2 | |
snoRNA list | SNORD45, SNORD45, SNORD45 | |
snoRNA position | 1969..2047, 2447..2529, 3033..3104 | |
length | 7852 | |
sequence |
atgataataaaataatgtttatgttaggacagtaaactaaactactagaaaaaaaagtt
aaaaagagggtgactggagtgttccaaagttcttatgttgtggacaaagagagttctatt aactttagattttctttttcagtcctagggacttttaaaatgaaggccttcacattcagc tatatccacagttttttaaaattgattgatttattaagcccgggccttttcactgagctg catcttcagccctgttttaaaaattttattttgagacaggatcgcgctaagttgctcaaa ctgggttcaaagttgccattttgcttgcttcagcctcacatagttctgggattagagacg tggagtacaccaaactaacttcagaaatttttaagtatacaaggtaaatttcaaaatagt caccaaaataacagaattgtagtttgtaacttataaattcaaatacttttaaatagaatg aaccccgattttaaacaggaaaaatcatcagaattataaagatgatgaaatccataatca taatacgatcaacatagtccacgtttcattatgtaaatagtgcttctccaaatcataaaa taacactttacaggatgccaattcttttttaataggtggtcaaaaacacaagtgtaaaag ataagaacacgttaatgaaaatagctagcatcttggaattctgcaggaagttcccaaaat gctttattcaaaaagtaatttccaaatattttaattactgatagcacggtctcagggaca gaggaaacaaaagtagcgtgaaaatccccttactctaaaaatgcttattttgaacactta gtatccagaagcaggcattctactaattaaccccccccttcccgcctccaaactacagag tgccaaaaactattttttaaccgcatttgaaaatttacatgttacttaaaactgacttac ataaaaaaggttgaaaatgggcgcaggcagcgaggacacctATGAGAAATCCTAAGGGTC CTGCTTCGCCCTTCAGGCGAGAATGTAGTCAGCTATGCCTGGCGTGGAAGGGCCCTGAGG AGGGGCGTCTGCGCAGGCGCGCGGCTCCTAACTTTACCCAGGGGCTTGCTGGGTTCTGTC TCTTTGGCTCTGCGACATGGTGGgtataggttgtccttttggagctgtccgaaggggtac aggagagacaaggtggtgtgctgttgagtgctttggtcgccatatacagttgtctgctga gtattagagagtgattaaattaagacgcgggccttggaatgtttgtgagagctcggagaa tgtattactcagcgttccctgcagagctcgccgccttagtagcggcttctaattttgtgt aggcttcttccttttgggcgggcctgctaggatttagcggtccgatttcttaatcctaaa aagccgaggctgattcgttacttatcccattctatacatatatagctttaaatattttac ttacatttgatttttggctcaaggaaatccaaaagtcattagtaaaaacctctgggttga agtctgtaaattttaaattggatcgcccggaaatttgctgcccggtcatacttgttaatc gtgaggatctacttagtaactgcagtgtacttttagttacgaagatgtaggtgcgtgaaa accagatcagtacctgtagcaaatacagagcctctggttagggcgaacatgggagccaag actgcttactggtaacttgtaatttagagggagcacagaagttcccgtggaacctgattt tttataagccgaaatttgtctgcaaattttggctagtcagaccaaaaataaaaatttccc tttttttgtgcgttgtacgacatactaacttattggtaagctttgatactttatagtgtt tatttaactgactgaaagaataaatatcaaatgcaggtggtaatttttgggtcagtgatg agatggcatgtattctgaatctaaagttgattattactgctttagctctagaattactct gagacctgaaaaatacctgaatttggttaagtattagtacatttaactgcttttttcccg tgtgttgaatatatgctaagaagcaggatataaaatgtggctaaaacacatctttttatt ttgaaagGGCACGCCACAGAAGGATGTTACTATCAAGTCTGATGCACCCAACACCCTTTT ACTGGGGAAACATGCGGATTATATTGCATCCTATGGGTCAAAGAAAGATGATTATgtatg tataattttatattaaaaagcttctcgtaaaaagaggtataagcagtagggcaatattta tgtactgatcttcccagtaattagaggcattgccagagcagagggtagatcaggattttg ggatacaaaattggtccctgtctttataattggggtaatactttcaaggtcaatgatgta ttggcatgtattatctgatttactgctgatgtgtaataacactttagctctagaattacg ctgagaccttgaaatgagtttacctgaagtttaaatacttaataactttcttttctggga gagtcttagattattttgcttaactcatttttctctggcttttggtcgatgttaagctct atttatagtaatgctaagtttgtaactttgaaatatgaaatatgtcttgtcaaaaattca aagtaacccatttaagaaattactattttagGAATACTGCATGTCTGAGTACTTGAGAAT GAGTGGCATTTATTGGGGCTTGACAGTAATGGATCTCATGGGACAACTTGATCGCATGAA TAGAGAAGAAATTCTGACCTTTATTAAATCGTGCCAACATGAGTGTGGTGGAATAAGTGC CAGCATTGGGCATGATCCTCATCTTTTGTACACTCTTAGTGCTGTCCAGgtaactttcaa attctgtcttgatactgttttctgggagtcaggagttgaaattgtattaggaagaggaca gaataaattttgttgatcaagcctgttctgcaaggtcagtgatgtcatggcatgtattag ctgaatgtgcagttgatgtgaattctgaaattaccctgagaccttggcgaagttagttta attacctttgatatatgagacttggaaataattggttttattttgatattaatggatgta cacattatggtttaaaaatccaagtactgggcctgggtatgtagctcagcggcataagcg cctgccttgcaagcagacagtcgtgagttcgattcccggtaccgataaaaaggaaaaaat aaaaaaaatccaagtactttagaatgccaagtttatatgtagaaaaatgctttaaatgtt tggaaatattgctaaaatgttttaattttattgaataaccatatagtctacatatttgag aatagctgacaatattaaactgaagtgtttcctttgacaagttagcatagcaatagaatg aacttgaaaagttatttactaaattacttgtctttcatattacagATTCTTACTCTGTAT GATAGTATTAATGTTATTGACGTAAATAAAGTGGTGGAATATGTTCAAAGTCTACAGAAA GAAGATGGTTCCTTTGCTGGAGATATTTGGGgtaatgtcagatttagtctttgctaccct aaatttaatactaaaacgttctggccttggtagtgaccagttgatgagcagatttaagtt tttcatcttttcaggtcccactaagcagctggtctaactggagttaatgccccagcatgc tctgtggtagttatagcagcatacaggagcactggaacagaggggccaatctaaaacata cggtaggtgaaatattttccccgcatattgggtaactttaaaattaaacatgctaaaagg gaaaaataaaaaatttttacaaaattactatttgatggagagagtgactcagattttatt tggtaaatgtagataatctctgctttagggctgaacacagtacaggccagagagaccagc tgcttcatgggatgtgaaaatctacttttataaaatagggtaagtttatttatgttatta gaaattaactaatgtttcgcttcagtttcttaactttctgatataattgtaagtttgaga ttatttgcagttacttttgacagttttctgctagtttctttagggataaagacatctgag attgtgcttcctaatgtgatagttgcataagttttttttaggaacttgcagtatgaatga tcagaagactagtaacatgtatgttgacactttcattttagGAGAAATTGATACAAGATT CTCTTTTTGTGCGGTGGCTACCTTGGCTCTTTTGgtaagctttgataaattctacattga aatgatttcatcatccatgaatactctggaatttagtggggttttttttcccctcccttt tgtttatagGGCAAGCTTGATGCTATCAATGTGGAAAAGGCAATTGAATTTGTCTTATCC TGTATGAACTTTGATGGTGGATTTGGTTGCAGACCAGGTTCTGAATCTCATGCTGGACAG gtaatttatagagattattaatgtaaaatagactgtgtttgtagtaaattttactgtgtg tgggatagtaccgaaaaattgtgtaattgttacttaaggaaatgtttttataatatacat taccctgttaagtacttctgacacaagcaaagaaaactaggataatagttaaccgaaata actttgggggaggcagctaaacccccacccacccccacatcatgctagacagcagtcttg acaccactgagccacatcctagctctctagtgatgttcatttaggtgaattcagttctag ccttgtctgctctatgagtaagcagatcttaatgtcagagaacataggtaaacagttttg aataagctgtgaagagattctgaccatgtttaaatacaaaatagctttagtaattgaata gttgttaccacctttactttcaagaaactatacacatgtactttatgtctgtaattttag ATCTATTGTTGCACAGGATTCCTGGCTATTACTAGTCAGTTACATCAAGTGAATTCTGAT TTACTTGGTTGGTGGCTTTGTGAACGACAGTTACCCTCAGGTGGACTCAATGGAAGACCA GAGAAGgtattgtttcttagctgtgctctgtagcacttagctttctaacctttggtaatt actactttatcttcacattttatgactgttcttgtatattgagtttttctcccttcctca atgaagcattccacaatgtcaactcttggaaaaagtagaaccttcctggttgaaatgatt gtggattctggtatcccatttccataagttcactactgggtgctctaccgcatagctgca ccctctttctcagccttgtgttttgtttgagccagggtcttggaaagttttccaggtttg ccttgtgttttttggacttggaaatgagaagctctttgcaaaccttttagtcacacatta aaggtttgaaaactgagactagtggctttacttttacacgtgctgtatatgtctattata gctctgaaaacaattgattttaccaaataatggactttttaaaaagctaggcagtttttt taaaaacccaacagttaattgagggttactaatttttcttcatggcctctgtcccatgaa ttgggacatgttatctgagctcgtgtgtctaattgtaaactttgctttctcaatatgtat tttgagtaccttaatgagtaggaaaatggtgtctagataggatctgatgttttttaaatc ctgcagaactgtcaaaattgctttaatgtgcttgtgaatttttcagggctcattaacatg gagagcactagggtatcatgtacacatgatcgcattgtgaggacccaggttcttggcaaa tttcaagtaggtgctacatgcacgagagtaacaagtccttgttgctacccttaggaaaca acatatgcccatggatttcatgaactgctattagcctgagttgtaaagggctgagtcagg cattagcgggggtgctactcactgagtacctgaaacagcaggggcacctatgaccttgac atgggcattttttttgccaatcatctatctgggcaaacgttagacacttcatgttcgtcc tcttccccctgtttggatatgagattagatagaatttaaaattatttttcagcataagaa aacaaaggaataacattgtggcaacattggtgacctttctcccccccccccctttcagTT GCCTGATGTGTGCTATTCATGGTGGGTTTTGGCATCCTTAAAGATAATTGGAAGGCTTCA TTGGATTGATAGAGAGAAACTGCGTAGTTTTATCTTAGCATGTCAAGATGAAGAAACTGG AGGTTTTGCAGACAGGCCAGGAGACATGgtaagtgtatttctgataagtttgattaagtt gatttttttcagtgatgggttactttcatggttctagtgatttgcagaagtggatgtggt gtagtttggtgggccatgcaagtgttgctttgaaaaggagtatttaccattacttccata gtaaaatatgaagaaatttatcacctattgccagaaatacttagaaatggttttttttta atagttgtcttcatttcttagtagtgtaaatccttttgtttttcttaaatagGTGGACCC ATTTCATACATTATTTGGCATCGCAGGATTGTCGCTTCTGGGAGAAGAACAAATTAAACC TGTTAGTCCTGTTTTTTGCATGCCTGAAGAAGTGCTTCAGAGAGTAAATGTTCACCCTGA ACTAGTGAGCTAGatttgttgatagatggagaaaagtatgtgtagtagtttttgccatct taacgtttctgtttttaaagtgcttactgaacctaaaaatgtctactgttgttaatattt tgtatattgtgttaaattaatttgaataaattatatagttatacatattgtaaaataaat tattgtattttcagcttttgtgaagtgctgttttgagtattttcttgtacatgtgtttta tgtctgcttagcaaacttagggacttgggttctttctgcttttctttcccatgtatttct tcagtgttctatgaaagtaaatgtattaagttggtttttgtcaaaagtgtcactggtaaa agtggataaatcccatatatgaattaaaacatgggcagatatgggaataatttataggtt tgcctataattactctgggttagtgacagttaaggtaaatggcagtgtaccatcttgaat agctttacagttttcgacctcagagcattttattgagtgtcacagaagaggtggtcctcc cagtaatgaaacagttttccattgccacaacagggactatcaaaaagaaatctatgattt tgtagtctgtaccttattggaagtttactagaaattgaatccagggaactgccttctctg cttcatgcctccacccagagtctgatcctaccatgccggacagccacagagatgctattt tgtgataactgtttgctcacaagacatagataggcacgcaaaccttactatacttagaaa tgtgagtgggtaaaaagctggttggagattttttttaatgtagtggtaagctgcattgag ttgggctttccatgtgtctgggggtagccagtagcagatccctggggagagagggccgga tgtgggccgtacttccgcccgtctgcgcctgcgcgcttgcgcgccgtcttcccgcccttt ctgtgggccggtacccgctcgcctcgcggctcgctgagggccctcggcctggg
Untranslated Region
Coding Sequence snoRNA |
|
exon position | 1001..1162, 2167..2274, 2731..2928, 3525..3630, 4301..4353, 4449..4559, 5040..5165, 6298..6447, 6712..6852 | |
CDS position | 1001..1162, 2167..2274, 2731..2928, 3525..3630, 4301..4353, 4449..4559, 5040..5165, 6298..6447, 6712..6852 | |
accession no |