Cavia_porcellus EIF4A2 | ||
organism | Cavia_porcellus | |
locus name | EIF4A2 | |
chromosome ⁄ contig | scaffold_70 | |
snoRNA list | SNORD2, SNORA63, SNORA81, SNORA63, SNORA4 | |
snoRNA position | 2154..2222, 3608..3734, 3979..4156, 4421..4552, 4737..4872 | |
length | 7390 | |
sequence |
ttttagaagcccacgaatacaaatactcctttttagtaagccgcctgtgttgctcctag
ctgaaacatgccgcccaaagcggccttgcggtttatctaagcagcacgtttacttgcttg aatctcaaggcatcaatatctcacatgagaggcaattaaaactgtcttaaaacaaacacc cattgagatcaggatccaggcctatctggtccgagagagcactcagctctacccgccaga agcgtcccctgaaattccggctgccaggaccctcggtggtcctgagcgtccctgccgctt gcaggcgttaatcacggccccgtcggtcatcctctgcaccggccagttcaaatccttagc attactgggaaaagaccgagggacggcagaggcgacagaagagcagccagccccgcggcg tccggcggtgacgcggccggccgggcgggttcgggggcgcgcggggctaccaccttcccc ggcagggacgcggttcacaccgccaggactcaacagtggcgggccccacgcacggcacga gtcccccgcggcgcgcagcacggagccttcgttcttccggcacccgggggagccgggcag ccccgcagccgcgcgccgcacgccgcacgcttccgccgcccgcctctgcgtcggggacgc ggaaaccccgtaggagcagggagggcgggcggggacgcgagtctcttcaccgctgctgca atattcttccgccgcagaacaaagagtcccaggccgcctccgggcctcgatattggcgac ctcactagtagtatggaaaaaataggaaatctgaatttttctcgttgactcgctttgggc ttttacctgaggtaacaacaccagggtcctaattttgtgaccgaccggagggctacaaga aaattcctccgcgcgaaacgggttccggccgcgaggctataaaaagcgggcggcccggtg cggctgtcttttcagtcgggcgctgagtggtttctcggatcATGTCTGGTGGTTCTGCGG ATTATAACAGgtatggcgccctttcggcgggaggcgttgagtggggaaggtcacggagcg cctggcgttttcgcggggggcctggaggtaaggagctacagctccacgggcgtctctagg gcacaggtcttctgtgcctttcgagaagcttccatcatgggaagggctacggggcgacag gtcgaggggacgacagcattatggtgacggggactccaaaggcgcttgagaagcctggcg cctttgccaccctgtgggacacggcgtctcgtaaagggccgtggcgcagcccgcgttaag cgcggtgcggcaggcggccgacgcatggttttcggtcctcagcccggctcggggccctgc gccgtagcggagggggtggtggccgggagctgccgggacgggccgcgggggcgccggagg gcggttggcagcgcttcgccggccgcctcgcccgcgtcaatcacccggcttgcgcagagt tgggggcggagctcggcgcgtggcgttctcgcgagagccttggctcccgaaacgggagcg gccccgcacgggcgtgcggggaaaggggctggtgggtggcggagcgcggtgcccgcgtcc gcggtgccagctttgttagctgtcggagggcagagtacactggtggggaggagtgatgtg acaaagcgggtcataaaaggcaggcgcgctttaaaggtggggcacaggtggcttggggaa gggatgttgcctaactgcagtgttcttgccagCAGAGAACATGGAGGCCCAGAGGGAATG GACCCCGATGGTGTCATCGAGgtaagaaaatgggtgtggggcttggatctgtgacatggt gggtgcttggcatccgtgtttacgttagtgtttttcgacttacagAGCAACTGGAATGAG ATTGTCGATAACTTTGATGATATGAATTTAAAGGAATCACTTCTTCGGGGCATCTATGCT TACGGTTTTGAGAAGCCTTCAGCTATTCAGCAAAGAGCTATTATTCCTTGTATCAAAGgt aaaaggaaactcgttggctctttaagaaagtaaattcagtgttccacgtagactttggag cataaaagggaaatcaaccgcagggggtctactaccacctctctgtattcctaaaagtga aatgatggcaaatcatctttcgggactgaacctgaaatgaagagaatactcttgctgatc gcttaattgtttgggcataattcatgttccaactggaatacatggtgtgaagtagaagtg acaatttgatgtgggatcagtaaatatgtatcctactttttttagGATATGATGTGATTG CTCAAGCTCAGTCAGGTACTGGCAAGACAGCCACATTTGCTATTTCCATCCTGCAACAGT TGGAGATTGAGTTCAAGGAGACCCAAGCACTAGTATTGGCCCCCACCAGAGAACTGGCTC AACAGgtattgatagtgtagttcaaaaaaaaactgcttgcgtgttgcataggtttcaggt ttcacaactgtgaagaatttaaagcttagcataactcggtcctatcagagccccctctta attttctgtgcatgcagggagtatttgttcaaagataagcaggaactgggtgtgtaggta tgttttttaggtttgtatgctgacatttgagaatccaaagtgttctgctcagggtggact aatccagatttgaagattgaatgcagttgtgcaacatgaaaactgcagtgacatgttacc atttgactgtctcagtagtttgtgatgcatctgttgcatgctatgttttcaaagctcact gttgtattggctttgaagtaaacctaataaagcagtgggctttattaaggtccagatccg aataagactcagtacattgtgggaggaaaaaaccccaattatttgccctattgtatttat ggaacttgggtttattaacaaattattacacagtgaaggataatatagggaatgatttct ggggcaataggatcccaaacaactgcacaaaacattaaagagaatgttagcttgaaacag gtcagtcttgtttgaagcttaaaaggggtgttatgctctgcatgcttagaagctgttggc agaccaggtattttgccattatgctttggaagttagtttattctatagggtaataattat ggtcttttgggttttagATCCAAAAGGTAATTCTGGCACTTGGAGATTATATGGGAGCAA CTTGCCATGCCTGCATTGGTGGAACAAATGTTCGGAATGAAATGCAAAAACTGCAGGCTG AAGCACCACACATTGTTGTTGGAACACCAGGGAGAGTATTTGATATGTTAAACAGAAGAT ACCTTTgtaagtgtattttaagtgtattgcttgttgtaattgtcaaatcttggagaattt ggagatgatacagtatgacttaattattaacagCTCCAAAATGGATCAAAATGTTTGTTT TGGATGAAGCAGATGAAATGTTGAGCCGAGGGTTTAAGGATCAAATCTATGAGATTTTCC AAAAACTAAATACAAGTATTCAGGtaagttttattttatcccctcatagttaaagggatt agattttaatgcaggtacagttacaatataactgaagtgttctattgtcgttccccctgc ttaaagtatttgatacattactatctctgtctaacatcattccatggtgagacagagacg cttggtctcaaacatttttttcttgactatcactgaaaattacactacgagcttgtgtga caacataatcattgtctccaggTTGTGTTGCTTTCTGCCACAATGCCAACTGATGTGTTG GAAGTGACCAAAAAATTCATGAGAGATCCAATTCGGATTCTGGTGAAGAAAGAAGAACTG ACCCTTGAAGGAATCAAACAGTTCTACATTAATGTTGAAAGAGAGgtaatttgattagtt agaaatacagctagattttaccttcttgtataagcactgtgctaaaattgcagaaactag gatcatgtcttggtttttgtaataatgctagcagagtacacacaagaagaaaagtaactg cactagaccctaaagactggggtggacctctttcttaatgtccagtgtcctttgtcttaa ggtttggtgcaatatgtcttcaggcttactgttaaaaattctattgaaaaatgtgactgt cattgactgtaaatttttctttgaaaatacctagGAATGGAAGTTGGATACACTTTGTGA TTTGTATGAGACACTCACCATTACGCAGGCTGTTATTTTTCTCAATACGAGGCGCAAGGT GGATTGGCTTACTGAGAAAATGCATGCCAGGGATTTCACAGTTTCTGCTCTGgtaagtgg tggtactagtattgctgaggagaataaacatacattcattaaagcaggattcagactaca gcatggctgtaaagtgctgtgttgtcgttccccctgctcaaaataaagttgtttcttaac tatacctgtctgccatgcctgtgtagcagccagggacgcttggtctcatacatgatgaaa ctgcaacttggcctacaggtgattcttgaattagcttactgcatttgtttacattcatac agCATGGTGACATGGATCAGAAAGAGAGAGATGTTATCATGAGGGAATTCCGATCAGGGT CCAGCCGTGTTCTGATCACTACTGACTTGTTGgtaaggtttttaaattttttctaatcta ccaaaagttaaatttcaagggtaaagtttttaaataagctttaccaatctaggctatttg ggagactaaaagaccacactccacagtgaactataccactcagtatagttcattactatt ttgtggctacattacataggtaatccagttttttaaaatttgatcagagttttgaacata cttctttgtgctttagGCTCGTGGAATTGATGTGCAACAAGTGTCTTTGGTTATAAACTA TGATCTACCTACCAATCGTGAAAACTACATTCACAGgtgagcagagcatcctgaccattt gtgtagctggcgaaattcatgtgtattcctacgaactgtaggaaaggtatggtcaaatca gggtgtagattgtttgaaaagagcagtttagtaagatacagttaaaattacacttgggaa gactggccagaacagagcaaagtgggaaaacttgtaactatgaccagattgtgcatacat acagatgacttgacgttgcttaggtcttgagttttattgttagtgatggtcttgtctatg tgctttttttttggtgatttttctgtagttggggtttttcttggtgtgcttgatagcatt ttgagtgatccctggtttagtcatagtggctttatccctaagtaaattggaactgtactt tgttatatgatgtaaaaaaagactttttaaaaaatacaggagtcgatagcagcagttgat gacgagatggcgctcagaagcggcgttgacgtaatttaggacgtggagtcataagcgaaa cagcactgtttgaataaagagcgagtcggtatttataatttgtttttcttttgtcatgat tatttgatattgtaagttgttccagcccaggcatttcatgttggcatttctactagggag cgtaaggtggtttgttgtctggtttgtgtaggaaggttgagttcttttggaggtgaacac gtttgagtaattgagtacaacgtgtgacactgagcaaacaaaagcagtgatgagtttggg tcaccataccaaatctgttttcccactgaaaacattttaagttttagaaattagttaacc ttcagcatttgtgtttacagttccagaagtgcgtcgaagtggattacataactgttcttt tgtttatccctggtgttcacatctgtcccaggctgacaactgctcttggctggcccactt tggtatgggctttaatttcaccaccccaaacacaatactgtcatctgctttatagtaatg ctcaagatgcctgaaaatctcattttgcagccagacaagtctttgaatcctttttggcac taactgcaaagtagtattttttttcctctacacactgatttggccgctagtgctccaatt agaagcacgaactgtaacctttaagtaaactgcagctgatggttaacaagtggatcctca tgttcagtagttcatacagtatgtgagaagtaacattctcattgtcgttttctttctctt acacagAATTGGCAGAGGGGGTCGATTTGGGAGGAAAGGTGTGGCTATAAACTTTGTTAC TGAAGAAGACAAGAGGATTCTTCGTGACATTGAGACTTTCTACAATACTACAGTGGAGGA AATGCCCATGAATGTGGCCGACCTTATTTAAttcctgggatgagagtttcgaatgcagtg ctcgctgttgctgaataggcaatcacaacgtgcattgtgctgctttgggaatttttgaat cttgtctcaatgctcataacggatcagaaatacagattttgatagcaaagcgacattagt cgtgagctcttgtgaggaaagtcattggctttatcctctttagagttagactgttggggt gggtataaaaagatggggtctgtaaaatctttctttcttagaaatttatttcctagttct gtagaaatggttgtattagatgttctctatcatttaataatatacttgtggactaaaaga tataagtgctgtataaaatcagccaattatgttaaactagcatatctgcctttattgtgt ttgtctttagcctggatagaaaggcctttaaaattgattttttttaaggaagcatttgaa tgcattttgttttggtattgtatttattcaataaagtatttaattagtgctaagtgtgaa ctggaccctgttgctaaacccccccagcaagcaatcatattctaggtagggttaaccccc agtaaaattgccatatgcacatgtcttaatgaagtttgaatgttaaataaattgtatatt cactttataaggtggtttggtcatttttattttcatgttctgtattacaaagcatctttg agccagttttcaggctagcaattctgagttaattgctgcattagagttgcacagaggctt atcaattgcaggtattcatcagcaccatctgttaaacatttgtcaacttcctagaagaaa aatatattaaggttaggacatttctagccacaattgcttcttatactgcccaatgtctac tcacagcaagtttttctgtaatgatggacttctgtttatcagaaaggttatcgttctcta caactgcatcatgaagctggctgacaagctgagttgctgcgtgaccctcatttatcaggt cctgtaaaaga
Untranslated Region
Coding Sequence snoRNA |
|
exon position | 1001..1029, 1772..1820, 1905..2037, 2325..2464, 3197..3365, 3453..3563, 3802..3944, 4234..4371, 4622..4711, 4936..5015, 6246..6390 | |
CDS position | 1001..1029, 1772..1820, 1905..2037, 2325..2464, 3197..3365, 3453..3563, 3802..3944, 4234..4371, 4622..4711, 4936..5015, 6246..6390 | |
accession no |