Family: snoR135

CLUSTAL W (1.83) multiple sequence alignment A_tauschii300002 TTTGCAGGATAAGTGTGTATCAGTTAA---ATGCTTTTG-----CTATGCATTTCTTGCT A_tauschii300003 TTTGCAGGATAAGTGTGTATCGGTTAA---ATGCCGTTT----GATGTGCATTTCTTACT A_tauschii300004 TTTGCAGGATAAGTGTGTATCAGTTAA---GTGCTTTT-----GCTGTGCATTTATTACT A_tauschii300045 TTTGCAGGATAAGTGTGTATCGGTTAA---ATGCCTTTT----GTTGTGCATTTCTTGCT A_tauschii300506 TTTGCAGGATAAGTGTGTATTGGTGAA---GTGCCTTTT----GATGTGCACTTCTTACT A_tauschii300507 TTTGCAGGATAAGTGTGTATCGGTTAA---GTGCTTTTT----GCTGTGCGTTTATTACT A_tauschii300508 TTTGCAGGATAAGTGTGTATCAATTAA---ATGCTGTTG-----CTATGCATTTCTTGCT A_tauschii300541 TTTGCAGGATAAGTGTGTATCGGTTAA---ATGCCTTTT----GATGTGCATTTCTTACT O_sativa300009 CATGCAGGACTAGTATAAATGGAGCTGCACATACAATTT-----CATTGTACATGCTGCT O_sativa300011 CCTGCAGGATA-GTGTGTATCGGCTTA---ACGCTTTTT------TGTGCGTCTTGTGCC O_sativa300012 CCTGCAGGATA-GTGTGTATCGGCCTA---ATGCCTTAT----GCTATGCATTTTTTGCC O_sativa300202 AGTGCAGGATT-GTGTGTAACGGCATT---ACGCTGCTTATATGCTGTGCGTTTGTTGCC T_aestivum300089 TTTGCAGGATAAGTGTGTATCGGTTAA---ATGCCGTTT----GATGTGCATTTCTTACT T_aestivum300090 TTTGCAGGATAAGTGTGTATCAGTTAA---ATGCTTTTG-----CTATGCATTTCTTGCT T_aestivum300092 TTTGCAGGATAAGTGTGTATCAGTTAA---GTGCTTTT-----GCTGTGCATTTATTACT T_aestivum300125 TTTGCAGGATAAGTGTGTATCGGTTAA---ATGCCTTTT----GTTGTGCATTTCTTGCT T_dicoccoides300181 CTTGCAGGATAAGTGTGTATCGGTTAA---ATGCCTTTT----GCTGTGCATTTTTTGCC T_dicoccoides300248 TTTGCAGGATAAGTGTGTATCAGTTAA---ATGCTCTTT-----CTATGCATTTCTGGCT T_dicoccoides300249 TTTGCAGGATAAGTGTGTATCGGTTAA---ATGCTTTTT----GCTGTGCATATATTACT T_dicoccoides301126 TTTGCAGGATAAGTGTGTATTGGTTAA---ATGCCTTTT----GATGTGCATTTCTTACT ******* ** * * * ** * * A_tauschii300002 GAAAGTGTTTCCTGCTATATTAATTT-GCGGAAAGTGGGCAGTTGGGTTGAGC---TTGA A_tauschii300003 GAAAGTGTTTCCTGCTATATTAATTT-GTGGAAAGTGGGCAGTTGGGTTGAGC---TTGA A_tauschii300004 GAAAGTGTTTCCTGCTATATTAATTT-TAGGAAAGTGGGCAGTTGGGTTGAGC---TTCA A_tauschii300045 GAAAGTTTTTCCTGCTATATTAATTT-GAGGAAAGTGGGCAGTTGGGCTGAGC---TTGA A_tauschii300506 GAAAGTGTTTCCTGCTATATTAATTT-GTGGAAAGTGGGCAGTTGGGTTGAGC---TTGA A_tauschii300507 GAAAGTGTTTCCTGCTATATTAATTT-TAGGAAAATGGGCAGTTGGGTTGAGC---TTCA A_tauschii300508 GAAAGTGTTTCCTGCTATATTAATTT-GTGGAAAGTGGGCAGTTGGGTTGAGC---TT-A A_tauschii300541 GAAAGTGTTTCCTGCTATATTAATTT-GAGGAAAATGGGCAGTTGGGTTGAGC---TTGA O_sativa300009 TAAA--CTTTCCTGCTAAACCAGTTTTGGGAAAAATGGGCAGTTGAGTTCGGCCAATTTA O_sativa300011 AAAAGTGTTTCCTGCTATATTGATCT-GGGGAAAGTGGGCAGTTGGGTTAAGC---TTT- O_sativa300012 GAAAGTGTTTCCTGCTATATCAATTA-GAGGAAAGTGGGCAGTTGGGTTAAGC---TTA- O_sativa300202 GAAAGTGTTTCCTGCTATAGAAATTT-GAGGAGAGTGGGCAGTTGGGTTAAGC---TTGA T_aestivum300089 GAAAGTGTTTCCTGCTATATTAATTT-GTGGAAAGTGGGCAGTTGGGTTGAGC---TTGA T_aestivum300090 GAAAGTGTTTCCTGCTATATTAATTT-GCGGAAAGTGGGCAGTTGGGTTGAGC---TTGA T_aestivum300092 GAAAGTGTTTCCTGCTATATTAATTT-TAGGAAAGTGGGCAGTTGGGTTGAGC---TTCA T_aestivum300125 GAAAGTTTTTCCTGCTATATTAATTT-GAGGAAAGTGGGCAGTTGGGCTGAGC---TTGA T_dicoccoides300181 GAAAGTTTTTCCTGCTATATTAATTT-GAGGAAAGTGGGCAGTTGGGCTGAGC---TTGA T_dicoccoides300248 GAAAGTGTTTCCTGCTATATTAATTT-GTGGAAAGTGGGCAGTTGGGTTGAGC---TTGA T_dicoccoides300249 GAAAGTGTTTCCTGCTATATTAATTG-TAAGAAGGTGGGCAGTTGGGTTGAGC---TTGA T_dicoccoides301126 GAAAGTGTTTCCTGCTATATTAATTT-GTGGAAAGTGGGCAGTTGGGTTGAGC---TTGA *** ********** * * * ********** * * ** ** A_tauschii300002 TAATCTCTTTCACCAACAATCATTTTCCTCTCATTA A_tauschii300003 TAATCTCTTTCGCCAACAATCATTTTCCTCTCATTA A_tauschii300004 TGATCTCTTTCGCCAACAATCATTTTCCTCTCATTT A_tauschii300045 TAATCTCTTTTGCCAACAATCATTTTGCTCTCATTC A_tauschii300506 TAATCTCTTTCGCCAACAATCATTTTCCTCTCATTA A_tauschii300507 TTATCTCATTCGCCAACAATCATTTGCCTCTCATTT A_tauschii300508 TGATCTCTTTCGCCAACAATCATTTTCCTCTCATTA A_tauschii300541 TAATCTCTTTCGCCAACAATCATTTTCCTCTCATTT O_sativa300009 TCTATGGTTTCCTCAACAATCATTTTTCCCACATGT O_sativa300011 --TGTGCTTTTTTCAACAATCATTTTCCTCTCATTT O_sativa300012 -TTCTGTTTTCTCCAACAATCATTTTCCTCTCATTA O_sativa300202 TATCAGCTTTTTCCAACAATCATTTTCCTCACATGT T_aestivum300089 TAATCTCTTTCGCCAACAATCATTTTCCTCTCATTA T_aestivum300090 TAATCTCTTTCGCCAACAATCATTTTCCTCTCATTA T_aestivum300092 TGATCTCTTTCGCCAACAATCATTTTCCTCTCATTT T_aestivum300125 TAATCTCTTTTGCCAACAATCATTTTGCTCTCATTC T_dicoccoides300181 TAATCTCTTTTGCCAACAATCATTTTCCTCTCATTA T_dicoccoides300248 TAATCTCTTTCGCCAACAATCATTTTCCTCTCATTA T_dicoccoides300249 TAATCTCTTTTGCCAACAATCATTTTCCACCCATTT T_dicoccoides301126 TAATCTCTTTCGCCAACAATCATTTTCCTCTCATTA ** ************ * * ***