snOPY snoRNA Orthological Gene Database

Family: U54

CLUSTAL W (1.83) multiple sequence alignment A_tauschii300316 ----------ATCTCAGTGATTTC-AGTCCAATA--CTT-TGGTCATATATGCTATTCTG A_tauschii300314 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTAGATTCATGGTGATATACGCTATTCTG A_tauschii300313 ----------GGGTTTGTGAT-A--TGCCATTTAGATTCATGGCGATATACACTATTCTG A_tauschii300312 ----------AGCTCAGTGATTAG-AGCCAATTACAT---TGGCAATATATGCTATACTG A_tauschii300315 ----------TGCTCAGTGACTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTACGCTG A_tauschii300153 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTAGATTCATGGCGATATACGCTATTCTG A_tauschii300152 ----------TTCTCAATGATTA--AGCCGTGTAGATTCATGGCGATATACGCTATTCTG A_tauschii300149 ----------AGCTCAGTGATTAG-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG A_tauschii300151 ----------AGCTCAGTGATTTT-AGCCAAATAAACTT-TGGTCATATACGCTATTCTG A_tauschii300150 ----------TGCTCAGTGATTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATGCTG G_gorilla300971 TGGCGATGAGGAGGTACCTATTGT-GTTGAGTAACGGTGATAATTTTATACGCTATTCTG O_sativa300042 ----------GGCTCAGTGATTGT-TGCCAATCAGATT--TGGTCATATACGCTATTCTG O_sativa300041 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTTAATCCATGGCAATATGCGCTATTCTG O_sativa300146 ----------AGCTCAGTGATTTCAAC-CAGTCACAT---TGGTTTTATACGCTATTCTG O_sativa300043 ----------AGCTCTGTGATTTCAAC-CAATCACAT---TGGTTTTATACGCTATTCTG O_sativa300044 ----------AGCTCAGTGATTGC-AGCCGTTTTCAT---TGGCAATATACGCTATGCTG O_sativa300052 ----------TGCTCAATGATTA--ACCCATGC---ACCATGGCAATACACGCTATTCTG O_sativa300053 ----------GGCTCAATGATTGT-TGCCAATCACATT--TGGTCATATATGCTATTCTG O_sativa300147 ----------AGCTCAGTGATTGT-AGTCACTTTTGT---TGGTAATATACGCTATGCTG O_sativa300148 ----------TGCTCAAGGATTATAAGCCATGTTATGCCATCACAATATACGCTATTCTG O_sativa300227 -------------------AGCTCAATGCAATCAAGT---TGGTTTTATACGCTATTCTG T_aestivum300051 ----------AGCTCAGTGATTAG-AGCCAATTACAT---TGGCATTATATGCTATACTG T_aestivum300052 ----------ATCTCAGTGATTTC-AGTCCAATA--CTT-TGGTCATATATGCTATTCTG T_aestivum300053 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTAGATTCATGGTGATATGCGCTATTCTG T_aestivum300054 ----------TGCTCAGTGACTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTACGCTG T_aestivum300378 ----------AGCTCAGTGATTAG-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG T_aestivum300380 ----------TGCTCAGTGATTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATGCTG T_aestivum300381 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTAGATTCATGGCGATATACGCTATTCTG T_aestivum300382 ----------TTCTCAATGATTA--AGCCGTGTAGATTCATGGCGATATACGCTATTCTG T_aestivum301193 ----------AGCTCAGTGATTAG-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG T_aestivum301194 ----------TGCTCAGTGATTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG T_aestivum301197 ----------TTCTCAATGATTA--AGCCGTGTAGATTCATGGCGATATACGCTATTCTG T_aestivum300379 ----------AGCTCAGTGATTTT-AGCCAAATAAACTT-TGGTCATATACGCTATTCTG T_aestivum301196 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTAGATTCATGGCGATATACGCTATTCTG T_aestivum301238 ----------GGGTTTGTGAT-A--TGCCATTTAGATTCATGGCGATATACACTATTCTG T_aestivum301195 ----------AGCTCAGTGATTTT-AGCCAAATAAACTT-TGGTCATATACGCTATTCTG T_dicoccoides300125 ----------AGCTCAGTGATTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG T_dicoccoides300950 ----------ATCTCAGT-ATTCG-AGTCCAATA--CTT-CGGTCATATATGCTATTCTG T_dicoccoides300127 ----------TTCTCAATGATTA--AGCCGTGTAGATTCATGGCGATATACCCTATTCTG T_dicoccoides300126 ----------TGCTCAGTGATTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACACTATGCTG T_dicoccoides300124 ----------AGCTCAGTGATTTT-AGCCAAATAAACTT-TGGTCATATACGCTATTCTG T_dicoccoides300123 ----------TGCTCAGTGATTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG T_dicoccoides300021 ----------TGCTCAGTGACTAT-GGCAAATTACAT---TGGCAATATGCGCTACGCTG T_dicoccoides300020 ----------AGCTCAGTGATTAG-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG T_dicoccoides301042 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTAGGTTCATGGCGATATACGCTATTCTG T_truncatus300466 TGGCGATGAGGAGATGCTTACTGG-GTTGAGTTGCGGTGATAGTCGCGTACGCTATTCTG * *** *** A_tauschii300316 A---ATATGTTG---TAAAATAAACTTATGAGAGCT A_tauschii300314 AGTCTT--TACGATGTCATCACATGTTATGAGAGCA A_tauschii300313 AGTCTT--TAGGATGTCGTCAAATGTTATGAAATCA A_tauschii300312 A-TCATACTTTGATGAAAAGTT--TATATGAGCT-- A_tauschii300315 G-CCTTGTTTTGATGCAAGGTT-GGACATGAGAGCT A_tauschii300153 ATTCTT--TAGGATGTCATCAAATGTTATGAGAGCA A_tauschii300152 AGTCTT--TAAGATGTCATCAAACTTTATGAGAGAA A_tauschii300149 A-CCATATTTTGATGAAAAGTT-GTATATGAGAGCT A_tauschii300151 A---ATATGTTGTTGTAAAATAAATTTATGAGAGCT A_tauschii300150 A-CCTTGTTTTGATGAAAAGTT-GGATATGAGAGCT G_gorilla300971 AGCCAGCG---------------------------- O_sativa300042 ATTTCTA-TTGGTGAAAAAGAAAATTTATGAGAGCT O_sativa300041 AATCATATTAAGATGTCAT-AAACATTATGAGAGCA O_sativa300146 A-TTGGAGCTGTTGAAAAATAATACTTATGAGAGCT O_sativa300043 A-TTGGAGCTGTTGAAAAATAAGACTTATGAGAGCT O_sativa300044 A-CT---GTTTGATGACAAATAAGAATATGAGAGCT O_sativa300052 AATCATATTAAGATGCCAT-AAACATTATGAGAGCA O_sativa300053 ATTTCTA-TTGGTGAAAACGAA--TTTATGAGAGCT O_sativa300147 A-CCATAGTTTGATGATGAATGAGAATATGAGAGCT O_sativa300148 AATCATATTAAGATGTCAT-AAACATTATGAGAGCA O_sativa300227 A-TTGGAGTGTTTTTTTATTAGGACTTATGAGAGCT T_aestivum300051 A-TCATATTTTGATGAAAAGTT--TATATGAGCT-- T_aestivum300052 A---ATATGTTG---TAAAATAAACTTATGAGAGCT T_aestivum300053 AGTCTT--TACGATGTCATCACATGTTATGAGAGCA T_aestivum300054 G-CCTTGTTTTGATGCAAGGTT-GGACATGAGAGCT T_aestivum300378 A-CCATATTTTGATGAAAAGTT-GTATATGAGAGCT T_aestivum300380 A-CCTTGTTTTGATGAAAAGTT-GGATATGAGAGCT T_aestivum300381 ATTCTT--TAGGATGTCATCAAATGTTATGAGAGCA T_aestivum300382 AGTCTT--TAAGATGTCATCAAACTTTATGAGAGAA T_aestivum301193 A-CCATATTTTGATGAAAAGTT-GTATATGAGAGCT T_aestivum301194 A-CCATATTTTGATGAAAAGTT-GTATATGAGAGCT T_aestivum301197 AGTCTT--TAAGATGTCATCAAACTTTATGAGAGCA T_aestivum300379 A---ATATGTTGTTGTAAAATAAATTTATGAGAGCT T_aestivum301196 AATCTT--TAGGATGTCATCAAATGTTATGAGAGCA T_aestivum301238 AGTCTT--TAGGATGTCGTCAAATGTTATGAAATCA T_aestivum301195 A---ATATGTTGTTGTAAAATAAATTTATGAGAGCT T_dicoccoides300125 A-CCATATTTTCATGAAAAGTT-GTATATGAGAGCT T_dicoccoides300950 A---ATATGTTG---TAAAATAAACTTCTGAGAGCT T_dicoccoides300127 AGTCTT--TAAGATGTCATCAAACTTTATGAGAGCA T_dicoccoides300126 A-CCTTGTTTTGATGAAAAGTT-GGATATGAGAGCT T_dicoccoides300124 A---ATATGTTGTTGTAAAATAAATTTATGAGAGCT T_dicoccoides300123 A-CCATATTTTGATGAAAAGTT-GTATATGAGAGCT T_dicoccoides300021 G-CCTTGTTTTGATGAAAAGTT-GGACATGAGAGCT T_dicoccoides300020 A-TCATATTTTGATGAAAAGTT--TATATGAGAGCT T_dicoccoides301042 AATCTT--TAGGATGTCATCAAATGTTATGAGTCCG T_truncatus300466 AGCCGGCG----------------------------

Copyright © 2008 Medical Biology, Faculty of Medicine, University of Miyazaki, All rights reserved