snOPY snoRNA Orthological Gene Database

Family: U54

CLUSTAL W (1.83) multiple sequence alignment A_tauschii300316 ----------ATCTCAGTGATTTCAGTCCAATA--CTT--TGGTCATATATGCTATTCTG A_tauschii300315 ----------TGCTCAGTGACTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTACGCTG A_tauschii300313 ----------GGGTTTGTGAT-A--TGCCATTTAGATTCATGGCGATATACACTATTCTG A_tauschii300312 ----------AGCTCAGTGATTAG-AGCCAATTACAT---TGGCAATATATGCTATACTG A_tauschii300314 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTAGATTCATGGTGATATACGCTATTCTG A_tauschii300153 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTAGATTCATGGCGATATACGCTATTCTG A_tauschii300149 ----------AGCTCAGTGATTAG-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG A_tauschii300152 ----------TTCTCAATGATTA--AGCCGTGTAGATTCATGGCGATATACGCTATTCTG A_tauschii300151 ----------AGCTCAGTGATTTTAGCCAAATAAACTT--TGGTCATATACGCTATTCTG A_tauschii300150 ----------TGCTCAGTGATTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATGCTG G_gorilla300971 TGGCGATGAGGAGGTACCTATTGT-GTTGAGTAACGGTGATAATTTTATACGCTATTCTG O_sativa300041 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTTAATCCATGGCAATATGCGCTATTCTG O_sativa300053 ----------GGCTCAATGATTGTTGC-CAATCACATT--TGGTCATATATGCTATTCTG O_sativa300042 ----------GGCTCAGTGATTGTTGC-CAATCAGATT--TGGTCATATACGCTATTCTG O_sativa300043 ----------AGCTCTGTGATTTCAAC-CAATCA-CAT--TGGTTTTATACGCTATTCTG O_sativa300044 ----------AGCTCAGTGATTGC-AGCCGTTT---TCATTGGCAATATACGCTATGCTG O_sativa300052 ----------TGCTCAATGATTA--ACCCATGC---ACCATGGCAATACACGCTATTCTG O_sativa300146 ----------AGCTCAGTGATTTCAAC-CAGTCA-CAT--TGGTTTTATACGCTATTCTG O_sativa300147 ----------AGCTCAGTGATTGT-AGTCACTTTTGT---TGGTAATATACGCTATGCTG O_sativa300148 ----------TGCTCAAGGATTATAAGCCATGTTATGCCATCACAATATACGCTATTCTG O_sativa300227 -------------------AGCTCAATGCAATCA-AGT--TGGTTTTATACGCTATTCTG T_aestivum300051 ----------AGCTCAGTGATTAG-AGCCAATTACAT---TGGCATTATATGCTATACTG T_aestivum300052 ----------ATCTCAGTGATTTCAGTCCAATA--CTT--TGGTCATATATGCTATTCTG T_aestivum300053 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTAGATTCATGGTGATATGCGCTATTCTG T_aestivum300054 ----------TGCTCAGTGACTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTACGCTG T_aestivum300378 ----------AGCTCAGTGATTAG-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG T_aestivum300380 ----------TGCTCAGTGATTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATGCTG T_aestivum300381 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTAGATTCATGGCGATATACGCTATTCTG T_aestivum300382 ----------TTCTCAATGATTA--AGCCGTGTAGATTCATGGCGATATACGCTATTCTG T_aestivum301193 ----------AGCTCAGTGATTAG-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG T_aestivum301194 ----------TGCTCAGTGATTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG T_aestivum300379 ----------AGCTCAGTGATTTTAGCCAAATAAACTT--TGGTCATATACGCTATTCTG T_aestivum301197 ----------TTCTCAATGATTA--AGCCGTGTAGATTCATGGCGATATACGCTATTCTG T_aestivum301196 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTAGATTCATGGCGATATACGCTATTCTG T_aestivum301238 ----------GGGTTTGTGAT-A--TGCCATTTAGATTCATGGCGATATACACTATTCTG T_aestivum301195 ----------AGCTCAGTGATTTTAGCCAAATAAACTT--TGGTCATATACGCTATTCTG T_dicoccoides300124 ----------AGCTCAGTGATTTTAGCCAAATAAACTT--TGGTCATATACGCTATTCTG T_dicoccoides300950 ----------ATCTCAGT-ATTCGAGTCCAATA--CTT--CGGTCATATATGCTATTCTG T_dicoccoides300127 ----------TTCTCAATGATTA--AGCCGTGTAGATTCATGGCGATATACCCTATTCTG T_dicoccoides300126 ----------TGCTCAGTGATTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACACTATGCTG T_dicoccoides300125 ----------AGCTCAGTGATTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG T_dicoccoides300123 ----------TGCTCAGTGATTAT-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG T_dicoccoides300021 ----------TGCTCAGTGACTAT-GGCAAATTACAT---TGGCAATATGCGCTACGCTG T_dicoccoides300020 ----------AGCTCAGTGATTAG-AGCCAATTACAT---TGGCAATATACGCTATACTG T_dicoccoides301042 ----------TGCTCAATGATTA--AGCCATGTAGGTTCATGGCGATATACGCTATTCTG * ** *** *** A_tauschii300316 A-ATATGTTG---TAAAATAA--ACTTATGAGAGCT A_tauschii300315 G-CCTTGTTTTGATGCAAGGTTGGA-CATGAGAGCT A_tauschii300313 AGTCTT--TAGGATGTCGTCAAATGTTATGAAATCA A_tauschii300312 A-TCATACTTTGATGAAAAGTT-TA-TATGAGCT-- A_tauschii300314 AGTCTT--TACGATGTCATCACATGTTATGAGAGCA A_tauschii300153 ATTCTT--TAGGATGTCATCAAATGTTATGAGAGCA A_tauschii300149 A-CCATATTTTGATGAAAAGTTGTA-TATGAGAGCT A_tauschii300152 AGTCTT--TAAGATGTCATCAAACTTTATGAGAGAA A_tauschii300151 A-ATATGTTGTTGTAAAATAA--ATTTATGAGAGCT A_tauschii300150 A-CCTTGTTTTGATGAAAAGTTGGA-TATGAGAGCT G_gorilla300971 AGCCAGCG---------------------------- O_sativa300041 AATCATATTAAGATGTCAT-AAACATTATGAGAGCA O_sativa300053 A-TTTCTATTGGTGAAAACGAA--TTTATGAGAGCT O_sativa300042 A-TTTCTATTGGTGAAAAAGAAAATTTATGAGAGCT O_sativa300043 A-TTGGAGCTGTTGAAAAATAAGACTTATGAGAGCT O_sativa300044 ACTGTT----TGATGACAAATAAGAATATGAGAGCT O_sativa300052 AATCATATTAAGATGCCAT-AAACATTATGAGAGCA O_sativa300146 A-TTGGAGCTGTTGAAAAATAATACTTATGAGAGCT O_sativa300147 A-CCATAGTTTGATGATGAATGAGAATATGAGAGCT O_sativa300148 AATCATATTAAGATGTCAT-AAACATTATGAGAGCA O_sativa300227 A-TTGGAGTGTTTTTTTATTAGGACTTATGAGAGCT T_aestivum300051 A-TCATATTTTGATGAAAAGTT-TA-TATGAGCT-- T_aestivum300052 A-ATATGTTG---TAAAATAA--ACTTATGAGAGCT T_aestivum300053 AGTCTT--TACGATGTCATCACATGTTATGAGAGCA T_aestivum300054 G-CCTTGTTTTGATGCAAGGTTGGA-CATGAGAGCT T_aestivum300378 A-CCATATTTTGATGAAAAGTTGTA-TATGAGAGCT T_aestivum300380 A-CCTTGTTTTGATGAAAAGTTGGA-TATGAGAGCT T_aestivum300381 ATTCTT--TAGGATGTCATCAAATGTTATGAGAGCA T_aestivum300382 AGTCTT--TAAGATGTCATCAAACTTTATGAGAGAA T_aestivum301193 A-CCATATTTTGATGAAAAGTTGTA-TATGAGAGCT T_aestivum301194 A-CCATATTTTGATGAAAAGTTGTA-TATGAGAGCT T_aestivum300379 A-ATATGTTGTTGTAAAATAA--ATTTATGAGAGCT T_aestivum301197 AGTCTT--TAAGATGTCATCAAACTTTATGAGAGCA T_aestivum301196 AATCTT--TAGGATGTCATCAAATGTTATGAGAGCA T_aestivum301238 AGTCTT--TAGGATGTCGTCAAATGTTATGAAATCA T_aestivum301195 A-ATATGTTGTTGTAAAATAA--ATTTATGAGAGCT T_dicoccoides300124 A-ATATGTTGTTGTAAAATAA--ATTTATGAGAGCT T_dicoccoides300950 A-ATATGTTG---TAAAATAA--ACTTCTGAGAGCT T_dicoccoides300127 AGTCTT--TAAGATGTCATCAAACTTTATGAGAGCA T_dicoccoides300126 A-CCTTGTTTTGATGAAAAGTTGGA-TATGAGAGCT T_dicoccoides300125 A-CCATATTTTCATGAAAAGTTGTA-TATGAGAGCT T_dicoccoides300123 A-CCATATTTTGATGAAAAGTTGTA-TATGAGAGCT T_dicoccoides300021 G-CCTTGTTTTGATGAAAAGTTGGA-CATGAGAGCT T_dicoccoides300020 A-TCATATTTTGATGAAAAGTT-TA-TATGAGAGCT T_dicoccoides301042 AATCTT--TAGGATGTCATCAAATGTTATGAGTCCG

Copyright © 2008 Medical Biology, Faculty of Medicine, University of Miyazaki, All rights reserved