snOPY snoRNA Orthological Gene Database

Family: SnoR60

CLUSTAL W (1.83) multiple sequence alignment A_tauschii300197 ATAAATATCATG-ACCTAACTTGGATTCCCCTTCAGGACATCACCATGGATCGTGCAAAA A_tauschii300224 TAGCATATGATG-AGCTAACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCACAATGTATGATGCAAAA A_tauschii300225 TAGCAAAAGATGAGCTTTACTCGGATTCCCCTAAAGGACATCA-AATGGATGATGCAAAA A_thaliana300192 TTGCAAATGATG-ATCTTACTTGGATTCCCCTTCAGATCATT---ATGGGTGATGCAATC A_thaliana300214 CGGCAGATGATG-ATTTTACTTGGATTCCCCTTCAGAACATTT--ATGGGTGTTGCAAAC O_sativa300046 TAGCATATGATG-ATCTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCAAATTGGATGATGCAAAT O_sativa300047 CTGCAAATGATG-AGCTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCAAATTGGATGATGCAGAT O_sativa300076 CTGCAAATGATG-AGCTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCAAATTGGATGATGCAAAT O_sativa300077 TAGCAAATGAGG-AACTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCAAATTGGATGATGCAAAT T_aestivum300000 TAGAAGATGATG-ACCTAACTCGGATTCTCCTTGAGGACATCACAATGGATGATGCAAAA T_aestivum300189 ATAAATATCATG-ACCTAACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCACCATGGATCGTGCAAAA T_aestivum300248 TAGCAAATGATG-AGCTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCACAATGGATGATGCAAAA T_aestivum300353 TAGCAAATGATG-AGCTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCACAATGGATGATGCAAAA T_aestivum300354 TTGCTGATGATG-AGCTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCACAATGGATGATGCAAAA T_aestivum300355 TTGCTGATGATG-AGCTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCACAATGGATGATGCAAAA T_aestivum300393 TAGTAGATGATG-AGCTAACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCACAATGTATGATGCAAAA T_aestivum300394 TAGCAAAAGATGAGCTTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCT-AATGGATGATGCAAAA T_aestivum300396 TAGCAAAATATG-GCTTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCA-AAACGATGATGCAAAA T_aestivum300398 TAGCAAATGATG-AGCTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCACAATGGATGATGCAAAA T_aestivum300619 TAGCAAATGATG-AGCTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCACAATGGATGATGCAAAA T_aestivum300633 TAGCAAATGATG-AGCTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCACAATGGATGATGCAAAA T_aestivum300634 TTGCTGATGATG-AGCTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCACAATGGATGATGCAAAA T_aestivum301410 TTGCTGATGATG-AGCTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCACAATGGATGATGCAAAA T_aestivum301411 TTGCTGATGATG-AGCTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCACAATGGATGATGCAAAA T_dicoccoides300040 TAGAAGATGATG-ACCTAACTCGGATTCTCCTTGAGGACATCACAATGGATGATGCAAAA T_dicoccoides300095 TAGCAGATGATG-AGCTAACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCACAATGTATGATGCAAAA T_dicoccoides300096 TAGCAAAAGATGAGCTTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCA-AATGGATGATGCAAAA T_dicoccoides300103 TAGCAAATGATG-AGCTTACTCGGATTCCCCTTCAGGACATCACAATGGATGATGCGAAA T_dicoccoides300165 TAGCAAAAGATG-GCTTTACTCGGATTCCACTTCAGGACATCA-AAACGATGATGCCAAA * * * * *** ****** ** ** *** * *** A_tauschii300197 TC-GAGTTTCTGGTGCT A_tauschii300224 TC-GAGTTTCTGATGCA A_tauschii300225 TC-GAGTCTCTGATGCG A_thaliana300192 TCCAAGTTTCTGATGTA A_thaliana300214 TCCAAGCTTCTGATGCT O_sativa300046 TC-GAGTTTCCGATGCG O_sativa300047 TC-GAGTTTCTGATGCA O_sativa300076 TC-GAGTTCCTGATGCG O_sativa300077 TC-GAGTTTCCAATGCG T_aestivum300000 TC-GAGTTTCTGATGCT T_aestivum300189 TC-GAGTTTCTGATGCT T_aestivum300248 TC-GAGTATCTGATGCA T_aestivum300353 TC-GAGTATCTGATGCA T_aestivum300354 TC-GAGTATCTGATGCA T_aestivum300355 TC-GAGTCTCTGATGCT T_aestivum300393 TC-GAGTTTCTGATGCA T_aestivum300394 TC-GAGTCTCTGATGTG T_aestivum300396 TC-GAGTCTCAGATGCA T_aestivum300398 TC-GAGTATCTGATGCA T_aestivum300619 TC-GAGTATCTGATGCA T_aestivum300633 TC-GAGTATCTGATGCA T_aestivum300634 TC-GAGTCTCTGATGCT T_aestivum301410 TC-GAGTATCTGATGCA T_aestivum301411 TC-GAGTATCTGATGCA T_dicoccoides300040 TC-GAGTTTCTGATGCT T_dicoccoides300095 TC-GAGTTTCTGATGCA T_dicoccoides300096 TC-GAGTCTCTGATGCG T_dicoccoides300103 TC-GAGTATCTGATGCA T_dicoccoides300165 TC-AAGTCTCTGATGCA ** ** * ** T_dicoccoides300096 ------------------TAGCAAAAGATGAGCTTT-ACTCGGATTCCCCTTC-AGGACA T_dicoccoides300103 ------------------TAGCAAATGATGAGCTT--ACTCGGATTCCCCTTC-AGGACA * O_sativa300068 TCGTCGGGAACAGCACCTCGTTACAGATCCTGAGCGCGATAGCGTCAGCTGATCGCTGC O_sativa300111 TCGTCGGGAACAGCACCTCGTTGCAGATCCTGAGCGCGATAGCATCAGCTGATCGCTGC O_sativa300214 TTACATGGAACAAAAAGCAACTGAACTTTCCC--------------------------- O_sativa300215 ATACATGGAACAAAAAGCAACTGAGCTTTCAC--------------------------- O_sativa300066 TTACATAGAACAAAAAGCAACTGAACTTTCAC--------------------------- T_aestivum301275 GCCATAGGCATG-TCTCTGAGGAC----------------------------------- T_aestivum301340 ATTATTAGCATAATCCCCTAGGGC----------------------------------- T_aestivum301342 ATCATAAGCATAATCCCTGAGCTC----------------------------------- T_aestivum301349 ATTATTAGCATAATCCCCTAGGGC----------------------------------- T_aestivum301351 ATCATAAGCATAATCCCTGAGCTC----------------------------------- T_aestivum301507 ATCATAAGCATAATCCCAGAGGGC----------------------------------- T_aestivum301517 GCCATAGGCATG-TCTCTGACGAC----------------------------------- T_dicoccoides300992 ACCATAAGCATAATCCCTGAGGGC----------------------------------- T_dicoccoides301090 ATTATTAGCATAATCCCCTAGGGC----------------------------------- T_dicoccoides301092 ATCATAAGCATAATCCTTGAGCTC----------------------------------- T_dicoccoides301101 ATCTTAAGCATAATCCCTGAGGGC----------------------------------- T_aestivum300634 TCACAATGGATGATGCAAAATCGAGTCTCTGATGCT----------------------- T_aestivum301410 TCACAATGGATGATGCAAAATCGAGTATCTGATGCA----------------------- T_aestivum301411 TCACAATGGATGATGCAAAATCGAGTATCTGATGCA----------------------- T_dicoccoides300040 TCACAATGGATGATGCAAAATCGAGTTTCTGATGCT----------------------- T_dicoccoides300095 TCACAATGTATGATGCAAAATCGAGTTTCTGATGCA----------------------- T_dicoccoides300096 TCA-AATGGATGATGCAAAATCGAGTCTCTGATGCG----------------------- T_dicoccoides300103 TCACAATGGATGATGCGAAATCGAGTATCTGATGCA----------------------- * *

Copyright © 2008 Medical Biology, Faculty of Medicine, University of Miyazaki, All rights reserved