snOPY snoRNA Orthological Gene Database

Family: SNORD99

CLUSTAL W (1.83) multiple sequence alignment C_familiaris300074 ACTGGTCC--AGGATGAAACCTAATCTGAGTGGACAT-CTATGGATGATA C_porcellus300394 ACTGGTCC--AGGATGAAACCTAATCTGAGTGGACAT-CTGTGGATGAGA D_rerio300046 ACTGATCA--AGGATGATAGTATATTG--ATGGTGAC-TGCTGGATGAAA E_telfairi300230 GCTGTATTCAAGGATGAAACCTATTCTGAGTGGACAT-ATATGGATGATA E_telfairi300489 CCTGGTCA--AGGATGAAACCTAATCTGAGTGGACAT-CTCCGGATGATA E_telfairi300625 GTAGGTCACCTACTTTAAAGCAAAC--AAGTG-ACAT-CTATGGATGATA E_caballus300004 ACTGGTCC--AGGATGAAACCTAATCTGAATGGACAT-CTATGGATGATA E_europaeus300053 ACTGGTCA--AGGATGAAAACCTATCTCTGTGGACAT-CATTGGATGATA E_europaeus300340 ATTGGTCA--AGGATGAAAACCTATCTCTGTGGACAT-CATTGGGTGATA G_aculeatus300019 -GTGATCT--ATGATGATTCAATACTAAAATTGTGAC-TGCTGGATGAAG G_gorilla300447 ACTGGTCC--AGGATGAAACCTAATTTGAGTGGACAT-CCATGGATGAGA H_sapiens300651 ACTGGTCC--AGGATGAAACCTAATTTGAGTGGACAT-CCATGGATGAGA L_africana300173 ACTGGTCC--AGGATGAAACCTAATCTGAGTGGACAT-CTGTGGATGATA M_mulatta300214 ACTGGTCC--AGGATGAAAC--AATCTGAGTGGACAT-CCATGGATGAGA M_domestica300062 ACTGGTCA--GTGATGAATCTCTTATCTGGTGGACATGCTTTGGATGACA M_musculus300613 ACTGGTCC--ATGATGAAACCCATTATCAGTGGACAT-CTATGGATGAGA M_lucifugus300900 ACTGGTCT--GGGATGAAACCTAATCTGAGTGGACAT-CTGTGGATGATA O_anatinus303291 GCTGGTTA--AGGATGACACTCAAT---GGTGGACAT-GTATGGATGACA O_cuniculus300205 ACTGGTCC--AGGATGAATCCTAATCTGAGTGGACAT-CTTTGGATGAGA O_latipes300040 TCTGATCC--ATGATGACTTCCAAACAC-ATGTGGAC-TGTTGGATGAAG P_troglodytes300511 ACTGGTCC--AGGATGAAACCTAATTTGAGTGGACAT-CCATGGATGAGC P_pygmaeus300607 ACTGGTCC--AGGATGAAACCTAATTTGAGTGGACAT-CCATGGATGAGA S_araneus301081 GCTGGTTC--AGGATGAAACCTTATCTGAGTGGACAT-CTATGGATGATA S_tridecemlineatus300294 ACTGGTCC--AGGATGAAACCTAATCTGAATGGACAT-CTATGGATGAGA T_nigroviridis300174 TCTGATCT--GTGATGATGCCTAAATG--ATGAGGAC-TGCTGGATGAAG T_belangeri300185 AGTGGTCC--GGGATGAAGCCTAGTCTGAGTGGACAT-CT--GGATGAGA T_truncatus300541 ACTGGTCC--AGGATGAAACCTAATCTGAGTGGACAT-CTATGGATGATA X_tropicalis300028 GCTGCGCG--GGGATGAATCTCTTATCTGG-AGACGG---TTGGATGAAT X_tropicalis300029 TCTGTGTG--GGGATGAATCCCTTATCTGG-AGACGG---TTGGATGAAT X_tropicalis300030 GCTGTGCG--GGGATGAATCTCTTATCTGG-AGACGG---TTGGATGAAT * * * ** *** C_familiaris300074 AA-TGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTCTTCAG C_porcellus300394 AA-TGCGGATATGGGACTGAGACCAGTGCTTAGG D_rerio300046 CT-TGCGGATATGGGACTGAGATCAGTT------ E_telfairi300230 AA-TACGGATATGGGACTGAGACCAGCTGCTCGA E_telfairi300489 AA-TGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTGCTTGA E_telfairi300625 AA-TGAGGATTTGGGACTGAGACCAGCTGCTCCT E_caballus300004 GA-TGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTTTTAGG E_europaeus300053 GA-TGCGGATATGGGACTGAGACCAGTTCTAGGG E_europaeus300340 AA-TGTGGATATGGGACTGAGACCAGTTCTTGGG G_aculeatus300019 CT-TGCGGATATGGGACTGAGATCAGCATTTCAA G_gorilla300447 AAATGCGGATATGGGACTGAGACCAGCT------ H_sapiens300651 AA-TGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTCCTAGG L_africana300173 AA-TGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTCTTAGA M_mulatta300214 AA-TGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTCCTAGG M_domestica300062 CT-TGCGGATATGGGGCTGAGACCAGTCACAAGC M_musculus300613 AA-TGCGGATATGGGACTGAGACCAGTTCTTAGG M_lucifugus300900 AA-TGCGGATATGGGACTGAGACCAGCT------ O_anatinus303291 CT-TGCGGATATGGGACTGAGACCAGCT------ O_cuniculus300205 AA-TGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTCTTGGG O_latipes300040 CA-TGCGGATATGGGACTGAGATCAGACTTTAGC P_troglodytes300511 AA-TGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTCCTAGG P_pygmaeus300607 AA-TGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTCCTAGG S_araneus301081 AA-TGCGGATATGGGACTGAGACCTGCTGTTTGA S_tridecemlineatus300294 AA-TGCGGATATGGGACTGAGACCAGCTCTTAGG T_nigroviridis300174 CT-TGCGGATATGGGACTGAGATCAGCC------ T_belangeri300185 GA-AGCGGATATGGGGTTGAGACTAGCTCGGGGA T_truncatus300541 AA-TGCGGATATGGGACTGAGACCAGCC------ X_tropicalis300028 CT-TGCGGATATGGGACTGAGCGCAGCCGTTGCC X_tropicalis300029 CT-TGCGGATATGGGACTGAGCACAGGCGCCTCC X_tropicalis300030 CT-TGCGGATATGGGACTGAGCGCAGCCTTTGCC **** **** **** *

Copyright © 2008 Medical Biology, Faculty of Medicine, University of Miyazaki, All rights reserved