Family: SCARNA6

CLUSTAL W (1.83) multiple sequence alignment H_sapiens300785 GGTCAATGATGAATG-GTAAAAGGTCTGAGTCCTCAGA---TCCCCTCCCGGCATCCCAG O_anatinus302276 GCTCAGTAAATACTA-TTGAATGAAATCACAGTCCCTTTATTGCTCTTATA--ACTCCCA O_anatinus302945 GGTCAGTGATGAATA-GTAAAAGGTCTGACTGGCCAGAGACTGCGCTTTCATCACCATCC O_anatinus303148 -------GGCTCCTA-TTGAATGAAAG-ACAGTCCCTTTATTGCTCTTAGGG-ACTCCCA T_nigroviridis300178 GGTTGGTGATGAGCA-GTAAAAGGTCTGATTTCCCACAATCCC------CCGCTGCCACG T_nigroviridis300179 GGTCTGTGATGTGGATGTAAAAGGTCTGAGGTTC---AGGCTC------CTCCCCCGGCG T_truncatus300285 GGTCGATGATGATTG-GTAAAAGGTCTGATTGCACTTAACGTCACATTGCCTTCCCTGCC T_truncatus300286 -------GATCCATA-TTGAAAAGTAGGGA-----AAG---TGC------GGCATCCTCA * ** H_sapiens300785 TTA--TCCCCAGCTGCCTCTCCT-----CCATCGCACTTCAGAAGTGCTGCGA---TGG- O_anatinus302276 GCA--GCTCCT-CCGT-----TGC----CCATTAGGCTCAGGTTGTTTGGTAA---TTGG O_anatinus302945 TGA--TTCCCTGCAGCCTCTTTTT----CCATCAGACCCCAGTAGTGCTCTGA---TTG- O_anatinus303148 GCA--GCTCCT-CCGTGAAAATCT----CTCAAAGAGTGAGGTTGTTTGGTAT---TTGT T_nigroviridis300178 CGG--CTCCCAGCGGCTCCTGCCCGCGTCCATCCTGTTGAAGAGGAGGAGCAGCGATGGC T_nigroviridis300179 CCC--CTCCCAGCAGCCCCTGCTC-CGACCCCGGCGCTCCAGCGTGCGTGTGG-----GC T_truncatus300285 CTCAACTCCCAGCAGCCCATTTTT---TCCCTCCTGTCACATTTAAGTCGTGTGTATGGG T_truncatus300286 CCA--TCCCCAGCCGCCTCTCTC-----CCATTGGGCTCCAGTAGTGCTGTGG---CGG- ** * * * * H_sapiens300785 GCAGAAGGGCAGCTGACACTCCGTGATGTCCCTCA-TTCTGTGTTCCTCCGTGAGCTCAG O_anatinus302276 GTGCTGGGGCTGCTCATAGCTTGTGATGCACTCAG-GCTGGGATATCCAAAGAGGAATGG O_anatinus302945 GCGGAGGAACTGCTGAAATTGTGCGATGTCTTCTACTTTTGTGTTCGCCGGAGTTCCGGG O_anatinus303148 GTGCTGGTGTTGCGCATAGCTTGTGATGCACTCAG-GCTGGGATAGCGAGAGAGGAATGG T_nigroviridis300178 GTCA-GGAGCCGCTGACAGGA-GGGATGCGGCCTC--GCCCGGCCTGTAGCGAGCCTCCT T_nigroviridis300179 GCCA-GCGGCTGCTGACAGAGCAGGATGTGACCTC--AC--GGCCCCTCAGAGACTTG-- T_truncatus300285 GTAATGGAGCAGCTGATAATTGGGGATTCTGTCAG--TGTGTGTCTCTGAGAG-TGAGCA T_truncatus300286 GCA-AAGGGCA-CTGACGTTCGGTTATGACCCA-G-TTCTGCGTTGCTTGGC-AGCCCAG * * * ** H_sapiens300785 GGAAGACAC--T--GGTTGGCATCCAACAGCTT-AGTCACAAAGGGATTTGATTGTTGGG O_anatinus302276 AGAGACAACCGCCCCTTGAGCATCCAACAAAATTAATCACAAAGGAGGT--ATTAATGGG O_anatinus302945 CGACACAGCAGTTGGGTAGGCGTCCAACAGGAGCAGTCGTAAAGGAGTTTCGGTGGTGGA O_anatinus303148 AGAGACAACCGCCCCTTGAGCATCCAACAAAATTAATCACAAAGGAGGT--ATTATTGGG T_nigroviridis300178 ACAGGCTGCT----GGTCCACATCCGACAGAAGCAGCCAGGGTGGAGCGTCGGGCTGACG T_nigroviridis300179 GCGGGTGGCG----TGACGCCAGCGTCCAACAGCATCCGAGCAGGAG----GAGCTGGGG T_truncatus300285 GTGCACAGCT----GACAAGCGTCCAACAGAACCGGCCGCACAGGAGATTGACGAGAGGC T_truncatus300286 GAAAGATGCCAT--GGTTGGCATCTCACAGCT--AGTCACGAAAAGATTTGATTGTTGGG * * * ** * H_sapiens300785 AGTGCTGGTATCTGTGGCT----ATGATCTGCCTTGTTCAAGCTGAGACCT O_anatinus302276 GCCG-TGAGGACTGTGGTCGTACATGATTCTAAGTTTTCAAGCTGAGATC- O_anatinus302945 AGTTTGGAGGTCT-TGGTT----GTGATCTGAAGTTTTCAAGCTGAGACC- O_anatinus303148 GCCG-TGAGGACTGTGGTCGTACATGATTCTAAGTTTTCAAGCTGAAATC- T_nigroviridis300178 GGTG---GAGCAGG----GA-GC-TGATCTCAAGTTTTCAAGCTGAGACC- T_nigroviridis300179 GGCG---GAGCCTG----AACGC-TGATCT--GTCCTTCCTGCTGAGACC- T_truncatus300285 AGCC---ATGGTTGTGATGGTGCGTGATCTCAAGTTTTCAATCTGAGACC- T_truncatus300286 AATGCTGGTGTCTGTGGTT----ATGATCTGACAT-TTCAAGCGGAGACC- **** *** * ** * *